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Vigan.06G104300.01

Basic Information:
Name: Vigan.06G104300.01
Multiple alignment
Variant Information
Position: Chr06:19665421..19671831 (- strand)
Length: 6411
Functional Information:
Description: Similar to trafficking protein particle complex subunit 3-like isoform X3. [XP_004505442.1, Cicer arietinum]
InterPro: Transport protein particle (TRAPP) component (IPR007194)
TRAPP I complex, Bet3 (IPR016721)
NO signalling/Golgi transport ligand-binding domain (IPR024096)
Expression level (FPKM): Co,Em,Fl,Le,No,Po,Ro,St:33.00,38.31,44.64,31.18,57.38,80.32,72.38,35.91
Arabidopsis thaliana homolog: AT5G54750.2
Automatic updates:
Name: NM_001248628 NCBI(nuccore)
Organism: Glycine max
Description: Glycine max uncharacterized LOC100306217 (LOC100306217), mRNA.
PubMed ID: -
Status: Known Variant
Name: NM_001249856 NCBI(nuccore)
Organism: Glycine max
Description: Glycine max uncharacterized LOC100499843 (LOC100499843), mRNA.
PubMed ID: -
Status: Known Variant
Structure :
Position: Chr06:19665421..19665648 (- strand)
Length: 228
Type: three_prime_UTR
Position: Chr06:19665649..19665771 (- strand)
Length: 123
Type: CDS
Position: Chr06:19666368..19666550 (- strand)
Length: 183
Type: CDS
Position: Chr06:19670725..19670824 (- strand)
Length: 100
Type: CDS
Position: Chr06:19671300..19671397 (- strand)
Length: 98
Type: CDS
Position: Chr06:19671638..19671694 (- strand)
Length: 57
Type: CDS
Position: Chr06:19671695..19671831 (- strand)
Length: 137
Type: five_prime_UTR

>Vigan.06G104300.01 class=Sequence position=Chr06:19665421..19671831 (- strand)
TTGAAACAAT TATGAATGAA GGTTGGAGTG CAAAAACACT GGGGTTGTTG TGGGCACTGA TCCAAGGTCG TACATCTTTG
CTCAACTCAT CGCCAAGCAG ATCGCAGCAA AGCAGATTCT GAGAGTGAAC TCCGACAATG CCTCCCGTCG CTCCTCGATC
CGGCGATGCC ATATTCGCCA ACATCGAACG CGTTGTAAGC AACTCTTACC GAACCAAAAC CAAAACCCTC TCTTATGCCC
CATTTGGTTT TTCAGAAAAT AACCCTGCAA GAGTTCCTCT TTCCCCTTGA TTCTGCAACA ATTTTCATTC CAAACAGTGG
ATTCGTCGAT TTTGTATTTC TTTTTCCTTG AAAAATGTGA ACTTTCTCTT TGCTGAAGTG TGTGGAATTC AGTGAGTTCG
TTTCATAGGA TCCTAATTGG TTTGGATTGT GCAGAACGCA GAGCTGTTTA CTTTGACTTA TGGTGCAATT GTGCGTCAAT
TGCTCACGGA TCTGGAAGAG GTTGAGGAGG TTAACAAGCA GCTTGATCAA ATGTAAAACT TTGAATCTCT CTCTTCTTCT
GAATTAGATA AATGTGGATA GTTTATTGTT TTAGGTTAAA AAATATATAT TTTTTGGCTT ATTGGTTCAG TGTGTATTAA
TATGAATAAG GGTGAGCGTT TGGGATATGT TTGGGCTGGG ATGTATAGTG GGAGGCTATC AGAGTTTGTC AACCTTTGCT
CCTTGTAATA ATAAAAACTC AGTTATGTGC CATGTGGAAA TTTGTCCCGA TTATGGGCAT GTGGTGATCC TAGACCATAA
AATAATTTCG TGTAAGGAAA GTAGGAGTGG AAAGAGAAAA GAAAAGGAAG AGAAGGAAAG TAAAATATGT GTGATCATAC
CAGTACGACA TGGAGTGAAA GGAGATGAAA AAGAAAGAGG GTTTATTAGT ATGATGTAAT TACCCCATTC ATATTTAGAT
TGCTTATATT GTGTAAGTGA ATTTTGGTGG TTGATTGGTT TTTTCAGGGG TTATAATATT GGAATCCGTT TGATTGATGA
GTTTTTAGCT AAGTCTAATG TCTCAAGATG CAACGATTTC AGAGAGACTA CTGATGTAAT TGCAAAGGTA TTGTACTGTA
TTTTTTGGTC TCTACTTGCT GGTGAAAAAT GTGTGAAGAC TCATCCTCGT TGTACTGCAG AAAAAATTCT GCACTTCTGT
TGTTCATTTG ATCTATGTTA TTTAATGTGC AGCTTGCTGA AATTAACTTG CAATTTAATG TTGTTGGTAG TATTAAAAAA
GGGATGTTTT TGAATAGTGC TCTAATGATG CTTGTTAAGA AATCAGTAGA ATGTTTTTCT CTGAAATCAT GGTGAGAGTG
GATTTGCGAT ATTAAATGTT ATGCCTTCCT GGAAAATTTT TCCACTTTTG ATTCATGAAC TGATTCTTTT AAATGAAGCT
AAAGCTTAAA TGGACATGTT TTACAGAATT GTTTTACTTT TCTCTTCTCA TTAAGAGGGT AATTCTTTAT TATCTCATTT
TCTCTCAGGC TTTTAATTGT ATAATTTGAA AATTCATGTT ACATCCTTAT GAACTGTATT CCTAGTACGT ATGTTAGTAA
CTTTTGTTTT ATAGAAATGA GTATTTATTT TCATCTATAC ATGTCTTTTG AAAATACAAC AATGGATTCA GGTGAGCTGC
ACCTTCTCCA TACAATTTCT ATTATTAAGT CTTATATGCA CAGGTTTGTA GTTGGATTTT GGTTGTGCCC GCGTGTATAG
TTAAAATAGT ATGTTTCTGA TATGGAATAT ACTAGGGTGT AGGAATTAGC TTAAATAAGA AGGTCTTCGA CCCCTTATGA
AGTGGAAATC CTTGGAAAAG AGACCTTTCT TTTTGTTCTG TTCATATTTA GAGAAGTGAA AAAATAATTC ATTTCTTTAA
ATTCTTTTCT CTATTTGCTT TGTGGTTTCC TAGCAGATTT GAACTTGATT CTGCACAACA CATTTGTAAC CTTTTTTTAT
TCTGGAGGGA GGGGGTATAA TTCCAATATA ATGCACGGGG TAAGATTAAA AAATGAACAG CTCTTATGTT GAAGTTCATA
GTGTGGCCGT TTTAAGTGCT ATCTAAAAAG ATTTATGCCT TAGAGCAATT GATATAATAA CACGTTCCTT TGCAAATATA
GACTTTCTAT GAAAGGATGG GCTGGTGGAG GCCCAAAAGA AAAAAAAAGA TTAAATTGTT AAAGGATTTT ACATAATATA
GTTAGAATAT TGTTTAGTTT ATAGTTTTAT TCCCTGTAGT AAGATGGTAA CAGTTGTACG TTCATCATTT TTGTTGGTAT
AGGTTACGTA AGAGTACTGT TCTCTACCCA TTTGGAATAT GAAAGTTTAT CTTCTAGCTT CTGCTTAGCT TTAATGATAG
CTTTTAGGCA TTTAGAGTTT CTGAGCTTTA TCTTCCTAAC AATTTGGTGC TTTCATCCAG CTTACTCCCC TCCCATAGCC
ATCACCACAA TGGAAGACAA TCTCCAAGCT ATTTTCCACC GGAAACTAGA TGCCTTACAG ACCCAAATCA CCCGCTATGA
AGAACAAAAA AATTCTCACA ACACTACACG CTTACAATCC ATTGATTCTT TTCTTGTCCC CTTCTCCTCT GCTATTAATG
GTCTGTTCAA CATGCTTGCA GTTGTCCCTT TATTCCACAT CGTTGTATTT TCTCTTTGGG GTTACTCCCA AACGCCAAGT
TTCCATCATA CCATACACCA ACTCCAACAT ATTCCACAAT TGCAAAATAA CAGATATCAC CTCCACCTTC CATTGATGCA
AATTATCCAA GATACAAGTT GCCATAACCA CAACTGTTGC CGACACAGTG GCCTCCACAA TGACCATGCA ACTGCTGCCG
GCACAATGGT CACACCAGTG GTCTTGACAA CCAAGTTTTC CATTGTACCA TGGGTTATGC TTTCCTGTAT CTAACCCTTA
AACAAGGGTT TCAAAGTTGC TTCCGATTTG GCAAGTTCGT GAAGATTTAG GGCTCACCAT ATTAGGGTTT TCTGATTTAG
GTTGAGTGAC GAAGCTCTAT TTCTTGTTTG TCTCCTACAA TTAACTCAAC ATTGTGCTTC GTCTCTACGA TTTAGTAGTT
GTCGCTCGCG TTTTGTCCTT GCTTGCCTTT TGCCCTTGTT CGCGGTCGTT GTTGCCACGA TCTCGCCGTC ACTGATTGTC
GCATTGCGTC GTGCCTCCTT CAGTTGTCAC ACTGTTTCGC CTCTGATCGT GTGCTCTGTT TTTCGCATTC ATCATGCCTT
TATTTCACTA ATATGCTCAC AGCCCTTGGT TTGTGTCCTT CGTGTGGTGT AATGTAAGTG AAGCAATTTT TTTTTTCTGA
AAAGTACTAA GCCTTTGTTC GTGTCTTTTT TTGCCTTCAA CTGCTGCACT GTTTTTTTTT CCTTTATAGT TTTTAATAAT
TATATCATTA GAGGATTAGA GAATTAAAAA TAGACACTTG ATATTTTAAT TTATGTTAAT ATTTTTATAA ATAATATTTC
AATAAATTTA TTTATAGTTA TATAATTTTG TGGACTTATT TAAATTAGAC ATTATTTATA CAATTATTTT TTCATGTAAA
ATTTTATGAG TCGAGTACTT TGACTCACGA GTTTACGTAA ACTCTCGAGT TTGATAACCT TGATCACATG TCACCCGATA
GTGTGCTGCC CCACCGCACT TCCTTCGGAT TCTCCTATGT GTTCACAACT TTCCCTTATA CCTCCACCTC CCCACCCATG
AAACTTTGTA CCCATTATTG CCAATCACTC CTCCCCACTT TCGCATTTTT TGTTGACTCT ACCCTTTTCC CAGCCATTAG
ATCGTTTTTT TAACAAACCC CTACAATCTC CATCTTTTCA TCATGACTTT CCATTATTTA TGTTGAAAGT CCCACATTGA
TTAGAAATAA GGCTAATTTA CAATATATAA GTGGATGTAA ATCTCATCTT ACAAGCCGAT TTTATGGGCT TGAGTTAGAT
TTAAAGTCCA CTTCTTAACA TAATATCAGA GCCATAATTT AAAGCCTATC CTAGTGAGAT TTGTGTTTGT TGGACATAGT
TCCACCCACT ATCGGACTGT TATCAGACCA ATCATTAATG TCTAGGCTCA TGCTTGAGAT GTTTATATCT TAGCGTGAGG
GGAGTGTGTT GAAAGTTCTA CATTGACTAG AGATAAGACC AATTTATAAT ATATAAGTGA GTGTAAATCT TACCTTACAA
GCCGGTTTTG TAGGGTTGGT TTAGGCTTAA AGTCCATTTC TTAATAGTTT ACATGTTCTA AAGGCAATTT TTGTTGATAT
ATTTAATTGC TTGACCCTAT AACATGATTG TTTCTTCCTC GTTTGCCCCA AGTTAACTTT CAACCACATT ATTGGACCCC
AATCTTTCCA CGGCCTCCTA TTTTCACGAA CAGGTTCATG CAAATTTTAA GGACCTTGAG AACTAGGTCC AATGTGAAGT
GGTGGATTGG ATGGGCCTAA AGAGGCCAGA ATGAAAATCA AGTGGCTTAA GGATTTTATA AGACGGTCTC AGAATACTGA
AAATAACATT ATTTATTTTA AATTTTTATT CCCTAAAGTA AGTGATGACA CTTGTAGGGT CATCATTTAG TTGTTGGTAC
ATTTTATATA AGTGTATTCC TTCATGCTCA TATTATAATC AAGGAAAAGT ATTAATGTTT ATGTTTATCT TTCTTTTAAC
TATAACGGTT GTTTTTAGGG TATTTTCTAG TAGATAGTCT ATAGATTCCT ATCTGTCAAC CTGATGATCA GATCCATGCT
TTCGATAAGT GGGATTTTGG ATTAGCTATT TTGGGAAAAC AATTTCTCTC TCTATATGCA CCTTTCAACA AAAGCTTATA
AGAAAATCAA TTATGTTACA AATGTAATCA TTTGTTTAAG AATGATGAGT ACTTATTTTT CTGGTCGAAC CACTTGTTGT
CACCAACTAT TTAGTCAATC ACTCACTTTG GTGAATTGTT ATAGGAGGAT ATCATATATG TAATTCCTTT ATGATTTTGT
TCTATTATAC TCCCTGGTTT TTGTCACATG TACTGATTGG TTTGGGCTAC GGATGTTTAT TTTAGGTATG TTACGTCTGG
GTGACACTTT GATTGGTATG AGGTTCACAG CATTAAACAT TCATTCTTGG TTGTCTGATC AACAATTTTT TGTTTGTTTA
TTAATTTTAT TACTAGTAAT GTGTATTTAA ACGATAAGGT AAGTTTTTAA TTTTATCAAC TTTACTCTTG CTTTTTTACA
GGTTGGTTTT AAAATGTTCC TCGGTGTTAC TGCATCTGTG ACCAATTGGG ATGCTGATGG GACATGTTGT AGTATTGTCT
TGGAGGATAA TCCTTTGGTA GATTTTGTTG AACTTCCTGA CAACTGCCAA GGTCTGTACT ATTGCAACAT CTTAAGTGGA
GTCATTAGAG GAGCCTTAGA TATGGTAAGT TCTGGTCCTA TTTATTACTT CAATTTACTT GTTACTTCAA CTTTATAGAA
CTTCAGTCTA TCAAATACTA GTTATTTTGT TCCACTTTTA ACAGTTAGGA AAGTTGGAAA ATATAATAGT TTGATTACTG
AATCCCTCCT CCGTGGTCTT CTAAATTTGA GTATTTTCTC AAACATGAAA TAGATGACTC CTATATTGTT TGTGTAGCAT
AGTTGTAAAT GGAAAGGGAA ATTGTTTTAT CAGTTTTTGC TTTCCGAGTT GTTGTTTACA TTCTATATAA ATCCTTAAAA
TATTTTATGA ATGAATTCTT TTTGTGCAGA ACTAGAAATA AAGTCAATGT TTAGCTTGAT AATTTCCAAT TTTGGGAAAG
TTAAAATTGA CCAATATCAT GTCACTGAAC TCAATCTGAT TAAATTACTG AACACCTTTA TGGTAGTAAA TTGCCCTGGA
GGAAAATGAG GCATGGTATG TAATATTCTG TTATATCTTG GGAATTGGGA ATCATGGTGA GGCATTAAGG GTTTTTTTTT
TCCACACCAT AAGCTTTTGT TCTTTATTTT TAAACATGTT TCCCATATAT CTATGTACAG GTGTCAATGA AGACTGAGGT
AACTTGGCTC CGAGATGTGC TTCGAGGCGA TGATGTGTTT GAGTTGCAGG TAAAACTTCT CAAGCATGTT CCAGAAGAGT
ATCCATACAA AGATGATGAG TGAATTTGTT TTTGTAGTGT TGTATACTCG ATATTTTTAT TACTTCATTG CTGCAGTATT
AGATTGCCAT ATTCTGACTT GTCCTATGTG TATTTTGATG AAACACTATA TACAGTAGAA AATCTTTAAT TAAATCATTA
TCATATTGGT TTTGATAGTG AGCTACAATC TACATGATTT CTAAGGGACC TTTAGATTTT GAGTTCTTAT TATTTTTCTC
ATTACATGAT A

>Vigan.06G104300.01
TTGAAACAAT TATGAATGAA GGTTGGAGTG CAAAAACACT GGGGTTGTTG TGGGCACTGA TCCAAGGTCG TACATCTTTG
CTCAACTCAT CGCCAAGCAG ATCGCAGCAA AGCAGATTCT GAGAGTGAAC TCCGACAATG CCTCCCGTCG CTCCTCGATC
CGGCGATGCC ATATTCGCCA ACATCGAACG CGTTAACGCA GAGCTGTTTA CTTTGACTTA TGGTGCAATT GTGCGTCAAT
TGCTCACGGA TCTGGAAGAG GTTGAGGAGG TTAACAAGCA GCTTGATCAA ATGGGTTATA ATATTGGAAT CCGTTTGATT
GATGAGTTTT TAGCTAAGTC TAATGTCTCA AGATGCAACG ATTTCAGAGA GACTACTGAT GTAATTGCAA AGGTTGGTTT
TAAAATGTTC CTCGGTGTTA CTGCATCTGT GACCAATTGG GATGCTGATG GGACATGTTG TAGTATTGTC TTGGAGGATA
ATCCTTTGGT AGATTTTGTT GAACTTCCTG ACAACTGCCA AGGTCTGTAC TATTGCAACA TCTTAAGTGG AGTCATTAGA
GGAGCCTTAG ATATGGTGTC AATGAAGACT GAGGTAACTT GGCTCCGAGA TGTGCTTCGA GGCGATGATG TGTTTGAGTT
GCAGGTAAAA CTTCTCAAGC ATGTTCCAGA AGAGTATCCA TACAAAGATG ATGAGTGAAT TTGTTTTTGT AGTGTTGTAT
ACTCGATATT TTTATTACTT CATTGCTGCA GTATTAGATT GCCATATTCT GACTTGTCCT ATGTGTATTT TGATGAAACA
CTATATACAG TAGAAAATCT TTAATTAAAT CATTATCATA TTGGTTTTGA TAGTGAGCTA CAATCTACAT GATTTCTAAG
GGACCTTTAG ATTTTGAGTT CTTATTATTT TTCTCATTAC ATGATA

>Vigan.06G104300.01
ATGCCTCCCG TCGCTCCTCG ATCCGGCGAT GCCATATTCG CCAACATCGA ACGCGTTAAC GCAGAGCTGT TTACTTTGAC
TTATGGTGCA ATTGTGCGTC AATTGCTCAC GGATCTGGAA GAGGTTGAGG AGGTTAACAA GCAGCTTGAT CAAATGGGTT
ATAATATTGG AATCCGTTTG ATTGATGAGT TTTTAGCTAA GTCTAATGTC TCAAGATGCA ACGATTTCAG AGAGACTACT
GATGTAATTG CAAAGGTTGG TTTTAAAATG TTCCTCGGTG TTACTGCATC TGTGACCAAT TGGGATGCTG ATGGGACATG
TTGTAGTATT GTCTTGGAGG ATAATCCTTT GGTAGATTTT GTTGAACTTC CTGACAACTG CCAAGGTCTG TACTATTGCA
ACATCTTAAG TGGAGTCATT AGAGGAGCCT TAGATATGGT GTCAATGAAG ACTGAGGTAA CTTGGCTCCG AGATGTGCTT
CGAGGCGATG ATGTGTTTGA GTTGCAGGTA AAACTTCTCA AGCATGTTCC AGAAGAGTAT CCATACAAAG ATGATGAGTG
A

>Vigan.06G104300.01
MPPVAPRSGD AIFANIERVN AELFTLTYGA IVRQLLTDLE EVEEVNKQLD QMGYNIGIRL IDEFLAKSNV SRCNDFRETT
DVIAKVGFKM FLGVTASVTN WDADGTCCSI VLEDNPLVDF VELPDNCQGL YYCNILSGVI RGALDMVSMK TEVTWLRDVL
RGDDVFELQV KLLKHVPEEY PYKDDE*