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Vigan.04G283400.01

Basic Information:
Name: Vigan.04G283400.01
Multiple alignment
Variant Information
Position: Chr04:40647211..40651693 (- strand)
Length: 4483
Functional Information:
Description: Similar to Uncharacterized protein. [C6T1F4, Glycine max]
GO: Biological Process: intracellular signal transduction (GO:0035556)
Cellular Component: membrane (GO:0016020)
InterPro: Cornichon (IPR003377)
Expression level (FPKM): Co,Em,Fl,Le,No,Po,Ro,St:1.09,0.88,2.83,4.13,8.85,1.75,8.57,5.02
Arabidopsis thaliana homolog: AT3G12180.1
Automatic updates:
Name: NM_001250267 NCBI(nuccore)
Organism: Glycine max
Description: Glycine max uncharacterized LOC100527262 (LOC100527262), mRNA.
PubMed ID: -
Status: Known Variant
Structure :
Position: Chr04:40647211..40647881 (- strand)
Length: 671
Type: three_prime_UTR
Position: Chr04:40647882..40647927 (- strand)
Length: 46
Type: CDS
Position: Chr04:40649821..40649943 (- strand)
Length: 123
Type: CDS
Position: Chr04:40651003..40651184 (- strand)
Length: 182
Type: CDS
Position: Chr04:40651351..40651428 (- strand)
Length: 78
Type: CDS
Position: Chr04:40651429..40651693 (- strand)
Length: 265
Type: five_prime_UTR

>Vigan.04G283400.01 class=Sequence position=Chr04:40647211..40651693 (- strand)
TTGCATTCAA ATGTGTAAAA TATTCCTTTT TTTCTTCAAA CGACATGATA TCCTGCTAAA AATAATGCTG TTTAAAAAAT
TGTAATTGTA ACTACATCAA ACAGGTAATG TGCAACTTGT CGTGTGGAGG CTTCACCACT TCGTCCGTGT TCAGTGTTCC
AACAAGGCAA CAACTCAAAC GTTGTCAACT GTTTGTTGAG GTTTCATCAG CTTCCTCCAA TCAATATATT CGACCTATCT
CTCTCTGCTT CTCTGTTAAT TCATAATGGG TTTGGAGTTG TTCTTTTGGC TTATCATTTG TTTCCCTTTC CACATCGTTT
TTTTAGCCTC AACGTTCTAC CAGGTATTCA TCTAACTTTT CTTTCGCTTA CCATTTCAAA CTTTTTTCTT TGCCTGAGCT
CCGTTATTTA ATTCCAATGT GATTGAACTG TCAGAGAGGA TTCACGTTCA GATTGATTTT TAGCTTCGAT GAATCTAAAC
ATGTTCTTTA TTTCTTTTTT GGGTTGAAGG TTTTGATGCT GACTGACTTA GAAGCCGATT TTATCAACCC ATATGATGCT
TCATCAAGGA TTAATTACTT CATCGTTCCT GAGTTTATTG GGCAGGGATT GTTGTGCGCT TTCTGCCTTT TAACAGGTCA
CTGGATCATG TTTTTGTTGA CGGTTCCTGT TACATGCTAC CATGTGATGC TGTAAGTACT AAATTTTATA CAAAAGGTGA
ACAATGTGCT GCTCAAGTTA CATCAAAGCA TTACATGATT TCTCCCCTTT TCAAATTTTG ATTCCCCTTT CTTAGAAATT
TGTTAAAGCG GAGTTTTTGG TGGGGGTAGT CTAAGATGAA TGTTTTTCTT GCTGTGAGAA TCTTCCACCT AATAGCCTAT
TCTTCTACTT TGTTTTGGGG GCAGAAAGGG GGTGGGAAAC TAACGAAAGC TAAAATTTGA AGGTTTGAGG ATTAGATGCA
TTCATAAATA ATAAGTAACT GATTAAAAGA AATTCCGTGT CACTAAAGGA GTCCTCTCTG TTTGTTTGTT TGTTTTTCAT
TGCTCGTGAT CTAAACAAAG TTATATGCAA CAATTTTTAA TTTAAGAATA TGGATCAATT CAACTTTATT TTCTCATATT
GCTATATAAT TGATATTAAA AAATTGCAAA ATTTGAAAAC ATGGCAGCAG CTACTCATGC CAATTGATTT AAGTGCTATC
ATATACATTG ATTTAAGTGC TATCATATAC CTTTGTATCG ACTAAGTTTA CAAATTGGAG ATAAACGAAT TCAAATCGCT
GACATCTGTC ACAGGATATC AGGCCCCGAC TGATTCTATT ATAGAGGCCA ATAATAGACA ATAACTCCTC TTAACACAGC
TCACAACTTT CATCGAAGTG TGTCTCGAGC AACTCTTCTC AAAATATCAA AAGTGGTTTT TTACTGTAGC TGCCAGTAGC
TTGAACTTAA TGGTTTATCT TCTCTTTAAT GCCATCAAGA TATTTGTTTG TTTATATTGA GGTTTATTGT TCAATTAATT
GGCATTACTA GATTGTATTC TTGAGGTTTG AATTTATTAT ATAGGAGATT TGGTAATGCC AATAAAAGGA ACTTGTGGTC
ACTAGTTTTG TGTTTGAACA GTTCTGACTT GGGTCGCAAT AAATATTGAA CCATTGTGCT CATATTTTGT TCTGAACTCC
CATACAAGAC TTGGAACATG AACTTCTATG TTCTGTTTCA GTTCATTTTT GTTCCATTTC AATGATTCAG GTACATGAAA
CAGCAGCATC TCATCGATGT TACTGAAGTG TTTAGAGCAC TTAACTCTGA GAAGAAATTT CGCTTGGCCA AACTTGCGTA
TTACTTAACA ATCATCATTA TAACTGTCTT CAGGTTAGTT TGTGCTGCCC TTAAAATGGC ATATGCTTAT CTACCATATT
TTTGTGTTTT ACATTCTCAC TGCTTAATAT TATGTCTATT TATTTTTCTG ATTAATGTGA TGCATTGGGA TTGTGTTAGG
CAAGCCAGCC TGGTTTTTGT TACTATTAGC TAAGGTGTTA GAGTTAATTA TTATTGTTGA GAGAAGATTG GAGGTATTCT
GTTATTAATG TCAGGATAGG TCTAGATAAT GAGAGAATAT TGAAGGTTTT CTGTTTAGTT TGTGATCGGG TTTTGGAGGA
AGGATCTCAG GCTTTCAAAA TTCTTACAGG AACTACTTGT ATTCATTATT TATTTTCACA AACTGAGTTT TTTACTCATC
CAATGCTAAG GGAGATCTCA TATTTTCACT AGTTCTTTCA TTAATCTCTG AACCAGTAAC GATCACTTTC ATAATTCAGG
AAGCATATCA TTTTACAATT CTAAGGATGA AAAGTTAGTT ATATGGGCCA CTGTTCTAGG ATTCAGTAAG CATATTGTAA
CAAAACTTTT TCATAATGCA TTCTCGGAGC AAGTAACCCA TTTTACTTAC GGCCAAAATG CGTTGGGGGA CAGTGCCTAG
TGTTTTAGCT AGTAAAGTTT GGCAGTATTC AATAGGTCTC ATAATGACTG CAACTGCTTG AAGGAGTTGG AACTTGCTGT
TAATGTTTTC CTATGCAGTA ATTTATTTTG CCTTTTTGGG TTTCTTCATA AAGACTCAGC CCATCAACCA TCGTTACTAT
CCTATTTTAT ACATCACCTT CACATCTACT CTGGTTTGAA AGGATACTTG TCAAGAGAGA TTATCTAAGT ATAGCTGGGT
TTAAGTTTAA TACTTGATTT GGGGACATAC ATGACATAGC AGTCCTTGTG AAATGGTATT CTTCACATCT TTAGTTTTAG
TCTGCGATAT CATGTAACAG ACGTGTGTCT ACTATCCATT AAAACCTTCT CTACATAGAT GCAGGAGCAA ATAAGGTTTA
CTAAAGTTTC CTTTAAGGTT AATTAAAGCT ATTTTTCGGT CTTACGTGAT TTCACAAATT TTGTACCTTC TGTCAACCTC
CTTCAACAAA ATAACTATAG TTGCCATCAC AAGGCAGAAT TGCAACTGGC TGTTGATGCT TGATGAGGAT GGATTCTTGA
ACAGGTTCCT GATATCCTTC CAAATCATAC CAATAGTAAT GGATGCTGCA ATGGATTTCA TCATACACAA TTGGGAACTC
TTATTTTGGA TCTTTAAACG TGTGTTTTCA TTTTAAGTGA TCATATGAGA ACCATGAACT TTGCTTCCTA GTGTATTCCA
CTTCTGTACC TAAATTTTAG GAACTGAAAT TAGAGTTTTC ACTGCATTAA AGTATGTGCA TATACACCAC TAACTGAATG
GAACTCAAAG ATCTTTGCTG CCATATTAAT GTGTTTGTGA GCAAAGGAAC CTTTTAGAAA GGTTAAGCGA CCTGTGTTAG
ATTGGTGAAG ATGAACAGTA CTATACCTCT ATCATAATTT ATAACCATTC CAGGCTCTGA AATATTGGGT TGCAAAGTAC
CTAGCCTGTT CACTTGCCTT CTTGTTATGA GTATTTTTTT TCCTTTTTAT CTTGTTACAA AATAAAATGA ATGTTTTTTT
TCTCTTGAAG TTGGGTACGG TAGGGGATGG AAGGTAAGAA AAATATTTTA TTTTCAAATT TAAAAGGTTA TTTATAAAAA
TAAAAAAGAG ATTAACACAT AAAGTTTATG TTAATCAATA ATTTTGTTAT CAAATAAAAA AACATTAATT GGAAATGGAA
AACTCGTCCC CCCTTTTCTA AAATACATAC CCTTAAGCAA CATTTTTCGT AACTATTTAT CATTTTCCTC AACTTTCCAT
TTGCAGGCTT GTATTGATGC TTGTCTACTA TTTAGATTCT GAAGATGAAT GATGTGGACA AAGTTTTCAA TTCCCACTAC
CGACTTTACC ACTATGGTTT AAGGTGGTGC TTCTTTTTCG TCTTATCCTT TTTTTAGTAA TTCTTTTATG AAGATGTGAT
TGAGTTCTAT AGCATAGGAT TTAGAACACA AATTCACAGC TCTAAGAAAC AGAAATCCGT CACTAATTGA ATGAGTATTG
CCAACTAAGG TATGTCTTTA GTTATTTGAC TACAGTTGGT CATTCTCTCC TGAAATAGCT TACCAACTGA TTTTTATGGT
AACTGATGAT TATGGAATTA GAAGATGGTA TTTGGCAAGG GTGCTTTGAA CATTGTATAT TATTTCCTCA GAATGTTACA
ACTTGTTATA AAATACCGAC ACCCAGTGTA AATTTAGCAT AAACTTATTA TGAAAAAGGT GAGTTGTAAT TATTGTCATG
TCCACGGTCC TTGTGTTTAT TTATTTATTT TATATTTGAA AGGCTAATTA TTCATTTAGG TGGAAAATGC ATCTTAGTTA
TTTTAATTAC AAGGAGGTCC AGAAATACTG TGATGAGAGA TGTACATTAA ATTTCAATAC ATGATTGTGC CGCTTGAGAT
ATGCTTGTCA CTAATATAAT TATCTTTGAA CGTTTTGGGC TCTCAAGGAG GAAAATAATG TGTTGTGTTG TGTTGGAGAC
ACA

>Vigan.04G283400.01
TTGCATTCAA ATGTGTAAAA TATTCCTTTT TTTCTTCAAA CGACATGATA TCCTGCTAAA AATAATGCTG TTTAAAAAAT
TGTAATTGTA ACTACATCAA ACAGGTAATG TGCAACTTGT CGTGTGGAGG CTTCACCACT TCGTCCGTGT TCAGTGTTCC
AACAAGGCAA CAACTCAAAC GTTGTCAACT GTTTGTTGAG GTTTCATCAG CTTCCTCCAA TCAATATATT CGACCTATCT
CTCTCTGCTT CTCTGTTAAT TCATAATGGG TTTGGAGTTG TTCTTTTGGC TTATCATTTG TTTCCCTTTC CACATCGTTT
TTTTAGCCTC AACGTTCTAC CAGGTTTTGA TGCTGACTGA CTTAGAAGCC GATTTTATCA ACCCATATGA TGCTTCATCA
AGGATTAATT ACTTCATCGT TCCTGAGTTT ATTGGGCAGG GATTGTTGTG CGCTTTCTGC CTTTTAACAG GTCACTGGAT
CATGTTTTTG TTGACGGTTC CTGTTACATG CTACCATGTG ATGCTGTACA TGAAACAGCA GCATCTCATC GATGTTACTG
AAGTGTTTAG AGCACTTAAC TCTGAGAAGA AATTTCGCTT GGCCAAACTT GCGTATTACT TAACAATCAT CATTATAACT
GTCTTCAGGC TTGTATTGAT GCTTGTCTAC TATTTAGATT CTGAAGATGA ATGATGTGGA CAAAGTTTTC AATTCCCACT
ACCGACTTTA CCACTATGGT TTAAGGTGGT GCTTCTTTTT CGTCTTATCC TTTTTTTAGT AATTCTTTTA TGAAGATGTG
ATTGAGTTCT ATAGCATAGG ATTTAGAACA CAAATTCACA GCTCTAAGAA ACAGAAATCC GTCACTAATT GAATGAGTAT
TGCCAACTAA GGTATGTCTT TAGTTATTTG ACTACAGTTG GTCATTCTCT CCTGAAATAG CTTACCAACT GATTTTTATG
GTAACTGATG ATTATGGAAT TAGAAGATGG TATTTGGCAA GGGTGCTTTG AACATTGTAT ATTATTTCCT CAGAATGTTA
CAACTTGTTA TAAAATACCG ACACCCAGTG TAAATTTAGC ATAAACTTAT TATGAAAAAG GTGAGTTGTA ATTATTGTCA
TGTCCACGGT CCTTGTGTTT ATTTATTTAT TTTATATTTG AAAGGCTAAT TATTCATTTA GGTGGAAAAT GCATCTTAGT
TATTTTAATT ACAAGGAGGT CCAGAAATAC TGTGATGAGA GATGTACATT AAATTTCAAT ACATGATTGT GCCGCTTGAG
ATATGCTTGT CACTAATATA ATTATCTTTG AACGTTTTGG GCTCTCAAGG AGGAAAATAA TGTGTTGTGT TGTGTTGGAG
ACACA

>Vigan.04G283400.01
ATGGGTTTGG AGTTGTTCTT TTGGCTTATC ATTTGTTTCC CTTTCCACAT CGTTTTTTTA GCCTCAACGT TCTACCAGGT
TTTGATGCTG ACTGACTTAG AAGCCGATTT TATCAACCCA TATGATGCTT CATCAAGGAT TAATTACTTC ATCGTTCCTG
AGTTTATTGG GCAGGGATTG TTGTGCGCTT TCTGCCTTTT AACAGGTCAC TGGATCATGT TTTTGTTGAC GGTTCCTGTT
ACATGCTACC ATGTGATGCT GTACATGAAA CAGCAGCATC TCATCGATGT TACTGAAGTG TTTAGAGCAC TTAACTCTGA
GAAGAAATTT CGCTTGGCCA AACTTGCGTA TTACTTAACA ATCATCATTA TAACTGTCTT CAGGCTTGTA TTGATGCTTG
TCTACTATTT AGATTCTGAA GATGAATGA

>Vigan.04G283400.01
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