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Vigan.04G007800.01

Basic Information:
Name: Vigan.04G007800.01
Multiple alignment
Variant Information
Position: Chr04:689218..693412 (- strand)
Length: 4195
Functional Information:
Description: Similar to protein. [F2D1W4, Hordeum vulgare var. distichum]
Expression level (FPKM): Co,Em,Fl,Le,No,Po,Ro,St:1.07,1.13,3.64,3.70,3.19,3.29,9.55,4.95
Arabidopsis thaliana homolog: AT1G67060.1
Automatic updates:
Name: NM_001249258 NCBI(nuccore)
Organism: Glycine max
Description: Glycine max uncharacterized LOC100306005 (LOC100306005), mRNA.
PubMed ID: -
Status: Known Variant
Structure :
Position: Chr04:689218..689889 (- strand)
Length: 672
Type: three_prime_UTR
Position: Chr04:689890..690034 (- strand)
Length: 145
Type: CDS
Position: Chr04:690357..690462 (- strand)
Length: 106
Type: CDS
Position: Chr04:690560..690589 (- strand)
Length: 30
Type: CDS
Position: Chr04:690663..690746 (- strand)
Length: 84
Type: CDS
Position: Chr04:690849..690873 (- strand)
Length: 25
Type: CDS
Position: Chr04:690980..691101 (- strand)
Length: 122
Type: CDS
Position: Chr04:691414..691498 (- strand)
Length: 85
Type: CDS
Position: Chr04:691987..692082 (- strand)
Length: 96
Type: CDS
Position: Chr04:693163..693252 (- strand)
Length: 90
Type: CDS
Position: Chr04:693253..693412 (- strand)
Length: 160
Type: five_prime_UTR

>Vigan.04G007800.01 class=Sequence position=Chr04:689218..693412 (- strand)
CTCCCTCTCT CTCTTCGTTG TGATTCCCAC ACCCCACCAA ACCAAACGCT TCCTTCAATC ATAGGATTGA TTCAACACAA
AACCCATCAT TATCTTCCAT CAAAGTTCAA TCCTTTTTCA CTTCGATTCC TCATAGCCGT TTCGTTTGAG CTCATCAGCT
ATGCCCAACT GGGAGCTCAG GAACTGTTGT GACCATGACC AGAAGGTCTT CATTGGTTGT GTTGCTGGCT TCACCGTTGT
AATCCTTGTG GTACACTACT TCTCTCTCTC TCTGCATTCA AAACACCCTC AAAATCAAAA CCAAATTTTT GTTTACTCCT
TCCCACAAAG GAAAACATAC CCTGTTAAGG AATTAGATTT AGAGGAAAAA AAGAGAGTTT GAAATTTAAA TTCAAGTGAA
ATTGGAAGTA ATTTTTTGCG ATGTTTAATG ACAACCACTT TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TAGCTATCTA TCTATCTATC
TCTGTCTCTC TGTAATCTAG TTACTAATTC GTACTAATTA CTGACTGCAC ATGTTTGTAG TTGTAGGTGA TTGTCTTAAT
GTAATCAAAG CTATATCTTG CTTTATTTGA TTGCAATGAT ATATCATGCA TTTAAATTAT TTCAATCCTA CTACGTAGTG
GTAGCAAAGG GATGTTGAGA GAAACACAAT TGCATTCAAT AGATGTTAAG TTATGAATGG GATTGTGAAT TGGAGTGGCA
AATGACGTTA CCATGTGAAA GTTTCTGCCT TTTAAGTTTT TTGTTTTTTG GATAAAGTAT GTGGACGGTT AGCAAGGGGA
TTAACGATTA TTTGTGATTT CCGCCTGACT TTTTCCCAAA TTAGTTGACT TGAGACTGGA TCAAAGTTTG GTAGCTCTTT
TGGATGGGCT TATCCCTAAA AATAATACAT GGTTGCGTAA GTTGAACAAC TTGGTGGTCT TGGCATTAGA CAAAAGACCT
TTTCAAAAGG AGGTCCTTAG TTTGTTCTAG TATGCTACAC CGTATTTAAA TAGTTAGTGG TTACTAAGGT AAGTTTGCAG
ATATTTGTTT TGATTTAGTA ACCATACATA TTAATGCTAC ACCACATTTC ATGTAGATTT ATTTAGGGCA CAATGTCATA
TATATATATA TATATATATA TATATATATA TATATATATA TATATATATA TATATATATA TATATATATA TATATATATA
TATATATATA TATATATATA TATATATATA TATATATATA TATATATATA TATATATATA TTTATTTTGG TCTCAGGCTG
TATAACTGAT CTACTTGTGT TATATTACTT TGTTGTGGTG GTGGCTGTAG CTATGGAGGA CCTTTGTACT TACACCTTTT
AAGCTCATCA CTGTGTTTCT GCATGAAGCT AGTCATGCCA TTGCTTGCTG GCTCACTTGT GGCAAGGTAA AAACTGTAAA
TGTTGTAGCT TAATGCATTT TGATGTTGAA GCTATCAAAC ATCTTTAATC TAGTAAGCTA GTTTATCGAC TAGGAACTTA
TAAACTGAGC TTATTGGTTA GTAGTTAGCT TATCTACTAG AAACTACTAG TTTACTAGTT ACCAGTTAGC TTATAAACTA
ATTTGGCCAA ACACACTCTT GAGGTCTTTT AAGGAATTTG TCACTTTCAT TGCTTCGTAA TTTATTCATA TGCAGTAAAT
TTTGTGAATT GTGATGCATT AATGCTGCAT GTTCCAGTTA AACAAAGTAT ATACCATGTT GGTAACAATA TATTCACTGT
GGATCATTAG CATTATGCAT ATTTTTACAG CTGGCCCGAC CATGATGGTC TTATTGTATG GAGCCTGAGT CATTGCAAAA
ATTTGACTCT GGTGTAAGGT TCTTTATATT TGTATCTTCT GTATACTGAA TCATTTTTAG TCTGATCTCA ATAGGTGGAA
GGAATTCAGG TTCACGCAAA TGAGGGTGGG GTAACCCAGA CACGTGGTGG AATATACTGG GTGATCTTGC CTGCTGGATG
TAATGCACTT TTCTCCCTTA ATTTTTAGTT AACACTTTAA TTTTTACTTT CATTTGATAT ATAAAAAGTT AATGCAATGA
GGTTCAATTT TTTAAGTTCA TTTAGAATCA GGGACTTGTG GATAACAATC TTATAAAACT AACATCATCA CCAAATGTGC
TATGGGTTTG ATGTGAAATT GTGACATGCA ATATGTGGAT ATTCTGTATT TGAATGGATA GACTTCTTAA CCTTTTTATG
CATATGATTT GAAATTGATA AGAAGACTTC TCAATTGCAT TTACCATTAT TCTGATTGAT TTTTCTTCTA GATCTTGGTT
CGTCATTTTG GGGAATGGCT TTGATACTTG CATCCACAAA TCTTCTCACC GCAAAAATTG CTGCTGGTTG CTTTATTGCT
GCTCTGATTG TTGTGCTCTT TCTTGCAAAA AATGTAAGAT TGATTATAGA TGGAGATGTT TTGTACCAAT ATATCAAAGC
TATTTTTGTT CTGACTTCTC TCCCTTTTCC TATCTTGCTA CACACTTTTA TTCAAAAAGT GGACACTTCG AGGACTATGT
ATTGGTGAGT GGTTTTGTGA TCTTCTTCTC AAATAGAATG TGAAAAAGTG GAAAGATGAC ATTGACAATT CTCACATTGA
CATTTTTGTT GACCAATTAA TATCAGGATT TATTGTTTTT ATTGCTGTTA TTTGGGTTCT GCAAGAGAAA ACAACAGTTC
ATGTCCTTCG CTATGTCATT CTCTTTATTG GTATGTTCCT CTTCATCCAT TTTCCAAAAA TTATTTGAAC TAAATAGACT
ACTAATTATG ATTTACTTTT CAGGTGTCAT GAACAGTTTG TTTTCAGTTT ATGGTATACT TTTAAGCACT TTCTACATGG
TTTATTTTAC TTTGGATAAT AAAATTTTTG CTACCACTTA TATAACATGA TTAAAATTTA TGTGATCTAG ATATTTACGA
TGATTTAATA TCTCGAAGAG TCAACTCTAG TGACGCTGAA AAGTTTGCAG AAGTTTGTCC ATGCCCTTGT AATGGTTTTG
GCTGGGGAGT TATTTGGTGA GTTTGCTATT CCGAAGCACG CTTGAATGCA AGATAATCCT TTTATTTTGG ACCAATATTT
GCTGGTTTTA TTAGGATTGA AATTTGGAGT TTTTTTTTTT GTCATAGTTA AAACTCTATT AAATAGTAGT TCTTTGCTTA
TAATGATTAA GATGGTCATA TAATAGCAGT GTAGCAATAG GGGTAAAGTA CATGAATGAG CAGTTGACTC ACAATTGTAA
TATATGCTTT ATCACTGGGG ATAAACTGAA TTTATGTCCT ATATTTGTAT TAGCTAGTAG TCATTAATAT TCCGTTCTGC
AATGGATTCC ACTTTCAGGG GGATGATATC ATTTGCATTT CTTTGCGGAT CTTTGTACCT TGGCTTGGTC ATATTATCAG
GTAAATATGA AGAGTTTAAT TTAGTATGCT TTCAGTGTAA AATTTTCTGT ATGATCAATC TACTAGAAAT TACTCAGATA
TGACTTTTAA ATTAAGTATT ACAAGAGTAA AAAATCTTTT TATACTTGTC AATCCAGGAA CGATGACAGT GTAAAAAATT
CATATTTTTA ATATATTTTA ATTAAATTCA ATATACAATG TCTCGAGGAG TTAACTAATC AGTTGAATAC ATGGCTCCTC
CCAAATGAAA TTGAACTTGA AAAATTAGTC TGATACAGTG TATAATTTCA TTCATATGTC AACAATCTGT TCAAACTTAG
TAGGTGTTAA GATTTTAAAA GCCTTAAAGT AGTTTTCTGA ACTGAAACAG ATATATACGG ACACACAAAC ACACAAGACA
ACCACATTTT ATGACAATGA TATATTTATG CATGTCTCTT ATGTTTTTTG TTTACAGGTT GAGAAAATTG TATGCGAGAG
GTTTGTTAGT GCAGAGAGCT TGACCAACTT CTGTTAATGC TTTGTATTCT GATTGTTTGT TCTTTTTTTT TTTCTTTTTT
TTTTGTGATG GGAGTTTACT CTCTGTTACT CCCATGCCTT CATTCTTTGC ATCCCATTTT GGGGTGCTTG ATTATACATG
ATTGCTTTTG TATAGAAAAT CAGAAACTAA TACAGGCGAG TACTTCAATA GATATATGTG CCTTAGACAT TTGCAGCTAC
TTTTCATCCC CTTTTTTTTT CTTTCTAAAT TTGTT

>Vigan.04G007800.01
CTCCCTCTCT CTCTTCGTTG TGATTCCCAC ACCCCACCAA ACCAAACGCT TCCTTCAATC ATAGGATTGA TTCAACACAA
AACCCATCAT TATCTTCCAT CAAAGTTCAA TCCTTTTTCA CTTCGATTCC TCATAGCCGT TTCGTTTGAG CTCATCAGCT
ATGCCCAACT GGGAGCTCAG GAACTGTTGT GACCATGACC AGAAGGTCTT CATTGGTTGT GTTGCTGGCT TCACCGTTGT
AATCCTTGTG CTATGGAGGA CCTTTGTACT TACACCTTTT AAGCTCATCA CTGTGTTTCT GCATGAAGCT AGTCATGCCA
TTGCTTGCTG GCTCACTTGT GGCAAGGTGG AAGGAATTCA GGTTCACGCA AATGAGGGTG GGGTAACCCA GACACGTGGT
GGAATATACT GGGTGATCTT GCCTGCTGGA TATCTTGGTT CGTCATTTTG GGGAATGGCT TTGATACTTG CATCCACAAA
TCTTCTCACC GCAAAAATTG CTGCTGGTTG CTTTATTGCT GCTCTGATTG TTGTGCTCTT TCTTGCAAAA AATTGGACAC
TTCGAGGACT ATGTATTGGA TTTATTGTTT TTATTGCTGT TATTTGGGTT CTGCAAGAGA AAACAACAGT TCATGTCCTT
CGCTATGTCA TTCTCTTTAT TGGTGTCATG AACAGTTTGT TTTCAGTTTA TGATATTTAC GATGATTTAA TATCTCGAAG
AGTCAACTCT AGTGACGCTG AAAAGTTTGC AGAAGTTTGT CCATGCCCTT GTAATGGTTT TGGCTGGGGA GTTATTTGGG
GGATGATATC ATTTGCATTT CTTTGCGGAT CTTTGTACCT TGGCTTGGTC ATATTATCAG GTAAATATGA AGAGTTTAAT
TTAGTATGCT TTCAGTGTAA AATTTTCTGT ATGATCAATC TACTAGAAAT TACTCAGATA TGACTTTTAA ATTAAGTATT
ACAAGAGTAA AAAATCTTTT TATACTTGTC AATCCAGGAA CGATGACAGT GTAAAAAATT CATATTTTTA ATATATTTTA
ATTAAATTCA ATATACAATG TCTCGAGGAG TTAACTAATC AGTTGAATAC ATGGCTCCTC CCAAATGAAA TTGAACTTGA
AAAATTAGTC TGATACAGTG TATAATTTCA TTCATATGTC AACAATCTGT TCAAACTTAG TAGGTGTTAA GATTTTAAAA
GCCTTAAAGT AGTTTTCTGA ACTGAAACAG ATATATACGG ACACACAAAC ACACAAGACA ACCACATTTT ATGACAATGA
TATATTTATG CATGTCTCTT ATGTTTTTTG TTTACAGGTT GAGAAAATTG TATGCGAGAG GTTTGTTAGT GCAGAGAGCT
TGACCAACTT CTGTTAATGC TTTGTATTCT GATTGTTTGT TCTTTTTTTT TTTCTTTTTT TTTTGTGATG GGAGTTTACT
CTCTGTTACT CCCATGCCTT CATTCTTTGC ATCCCATTTT GGGGTGCTTG ATTATACATG ATTGCTTTTG TATAGAAAAT
CAGAAACTAA TACAGGCGAG TACTTCAATA GATATATGTG CCTTAGACAT TTGCAGCTAC TTTTCATCCC CTTTTTTTTT
CTTTCTAAAT TTGTT

>Vigan.04G007800.01
ATGCCCAACT GGGAGCTCAG GAACTGTTGT GACCATGACC AGAAGGTCTT CATTGGTTGT GTTGCTGGCT TCACCGTTGT
AATCCTTGTG CTATGGAGGA CCTTTGTACT TACACCTTTT AAGCTCATCA CTGTGTTTCT GCATGAAGCT AGTCATGCCA
TTGCTTGCTG GCTCACTTGT GGCAAGGTGG AAGGAATTCA GGTTCACGCA AATGAGGGTG GGGTAACCCA GACACGTGGT
GGAATATACT GGGTGATCTT GCCTGCTGGA TATCTTGGTT CGTCATTTTG GGGAATGGCT TTGATACTTG CATCCACAAA
TCTTCTCACC GCAAAAATTG CTGCTGGTTG CTTTATTGCT GCTCTGATTG TTGTGCTCTT TCTTGCAAAA AATTGGACAC
TTCGAGGACT ATGTATTGGA TTTATTGTTT TTATTGCTGT TATTTGGGTT CTGCAAGAGA AAACAACAGT TCATGTCCTT
CGCTATGTCA TTCTCTTTAT TGGTGTCATG AACAGTTTGT TTTCAGTTTA TGATATTTAC GATGATTTAA TATCTCGAAG
AGTCAACTCT AGTGACGCTG AAAAGTTTGC AGAAGTTTGT CCATGCCCTT GTAATGGTTT TGGCTGGGGA GTTATTTGGG
GGATGATATC ATTTGCATTT CTTTGCGGAT CTTTGTACCT TGGCTTGGTC ATATTATCAG GTAAATATGA AGAGTTTAAT
TTAGTATGCT TTCAGTGTAA AATTTTCTGT ATGATCAATC TACTAGAAAT TACTCAGATA TGA

>Vigan.04G007800.01
MPNWELRNCC DHDQKVFIGC VAGFTVVILV LWRTFVLTPF KLITVFLHEA SHAIACWLTC GKVEGIQVHA NEGGVTQTRG
GIYWVILPAG YLGSSFWGMA LILASTNLLT AKIAAGCFIA ALIVVLFLAK NWTLRGLCIG FIVFIAVIWV LQEKTTVHVL
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