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Vigan.10G025000.01

Basic Information:
Name: Vigan.10G025000.01
Multiple alignment
Variant Information
Position: Chr10:2211115..2215216 (- strand)
Length: 4102
Functional Information:
Description: Similar to Uncharacterized protein. [I1J6R9, Glycine max]
GO: Cellular Component: integral to membrane (GO:0016021)
InterPro: Cytochrome b561, eukaryote (IPR004877)
Cytochrome b561/ferric reductase transmembrane (IPR006593)
Expression level (FPKM): Co,Em,Fl,Le,No,Po,Ro,St:0.22,10.36,10.43,5.89,6.94,26.35,6.36,11.83
Arabidopsis thaliana homolog: AT1G26100.1
Automatic updates:
Name: NM_001250172 NCBI(nuccore)
Organism: Glycine max
Description: Glycine max uncharacterized LOC100527512 (LOC100527512), mRNA.
PubMed ID: -
Status: Known Variant
Structure :
Position: Chr10:2211115..2211232 (- strand)
Length: 118
Type: three_prime_UTR
Position: Chr10:2211233..2211556 (- strand)
Length: 324
Type: CDS
Position: Chr10:2214441..2214637 (- strand)
Length: 197
Type: CDS
Position: Chr10:2214741..2214792 (- strand)
Length: 52
Type: CDS
Position: Chr10:2214873..2215025 (- strand)
Length: 153
Type: CDS
Position: Chr10:2215026..2215216 (- strand)
Length: 191
Type: five_prime_UTR

>Vigan.10G025000.01 class=Sequence position=Chr10:2211115..2215216 (- strand)
TACATTAAAA ATATAAAATT TATTTAAGTA TTTGAAACTT AATTACATCT CTTAAAAATA AACCATAAAA AAAAATTGTC
TGGGAAGACA TCTATTTTCA GTAGAATTTT TGTTGAAAGT GTTGGTGTAG TGATAGCTAG TTCACCCAAA TGAAAAAGGT
GCAGTGTCGG CAAGAGCGAG TGTGAGTGAG TATGGGCACT GTGTATTCTC CCTCGCTCCT TGCTCTCCTG TTCTTGGCTA
GAGTTGCAGG TCTTGCAGTG GCAGTGCTTG TACTCATCTG GGCCCTTGCC TTCAAATCTA GCTTCCTCAC TCCTTCACTC
TCCCAACAAG ACCTTCTCTA TGCAGTACGC ACACATACCT CTTCTTTCTT CCTCCATCAA CACTTCCAAA AATGCTACTC
AACTTCCTTT TTCTCTCTTT GTAGGTTCTT CATCCTCTCC TCATGGTCAT CGGCTTCATT CTGTTAAGTG GAGAAGGTAC
ACTTTTGCTT ATAGTTTTAT TTTCAATTTC TGTTACTTTT CACCTCAAAA GAAGCTGCCT TAGCTTAGCT TTTACTGGTT
TGTGGGTTTT GGTATGCAGC AATTTTGGTT CACCGGTGGT TACCTGGATC AAGGGGCTTC AAGAAATTGG TGCATCTGTG
GCTTCAAGGG GTAGCTTTGG GTTGTGGGAT CTTTGGGATT TGGACAAGGT TTCAGGGAAA AGATGGGGTT GTTGCAAATT
TCTTTAGCCT CCATTCATGG ATGGGTTTGG TTTGTGTTTC CCTCTTTGCA GCCCAGGTAT TTGCATTTAC TACTTACTCT
TTCAACATTT CTTACATTTT CATTTTCCTG CACTGTTTAT TTCCTTTCTT ATTTCATTTA TTGTCTTGTT TCAGTAATCT
AAAGGAAGAA AGTTAAACAT TTTGAAATCA ACTTTTTAGT TTAGTTTAGT TTAGATAATT TTTGAATGTC ATTATCCTTG
GCACTAAGTA GGTGTCGATA ATGAATGGCA TTGTGGTCCT ACTCTCTTTT GAGTCTTTTC AGAAGAAAGG AAGAGACGTT
GCGATTCAGT TAGACTGCTT TCTTTCTTTT TTTGTCATTT TTTTCATTGC AAAAACATCG GAGGTTGTGT TTCTAAAAAG
TTTTTAGTAA AATCAAATAA GATACTTTTG CATTGAAAAA TAATATTTTA TCACACATAA TTTTTTTAAT TTGAATCTAC
TCTTTCTTAT TTTTTACTTT TTTCTTTTTC AAAAAATTAT AAAAAATATA CTCTTTTATG TATAATGCTA TCCTTGCTCT
TTTGCATTTT CTATTTTCCT TTTCGGTAAA ATAAATTCAT CGGAGGATAC TTCACAGGCA AAAAAAAGAA AGAAAAATCG
TTAAATTTGA GAAAATGTTT CTTTAGCTGT GAAATGGTAT CTTATTTTTT ACTTTATTCT TATTGTAATT TGAAAATAAA
ACTCCATTGA ATTTGATGAT AAAAAGTAAT AACTGCAAAC CTATTTAATA TATCAAACTT TGATGTTTGG GTACATTTTG
CATATTCTAA TAAGGTAATG CATTATAAAA GTTAAATAAT TTGTATTTAG ATATACATAC TTCAACAGTA ATAATCACTA
TTTTATTTTA TTTTTATTTT GTTGTCATGT AAATCTACTA TCTTATAATA ATTTAAAAGT TAGGAAATAA TGGCTCCTAT
TTGAGGGTGG TAGCGTAGAA GCAAGCAGGA TAGTGAATTA TATAATCTTA GGGAAGAGGA CACATTCACA TACACCTATG
AATATGTCGG AAAACGTTGT CGGCCAATTA TGAGTTTCAA TTTGTTTACA TTTCCAAGGT GGGCTCTCTC CTTTATGTTG
ATTTTTGGTA ACAAGTGATT GGGCTTTTGG TGCTAAGTGT AGGCAATTCT TTTTTTATTT TTATTCTCAC CTCTATAATT
TATTCTTTTA CCAATTTATT ATAATAGAAT AATAAAACCA ATCTTTAAAA ATTTTGCTTG TGATTGGATA AGGAGTATGA
CAATTTTCAA CAAATTTAAA TATATTTGAA TTGTTTAATT TTGTAGGTTT TTGTTAAAGG ATAATGATAT TTTGACAACA
TTTTTTTGAT AACATTTTAA TATCATCTAC GTGTTATTCT GTAATTGGTC TATGTTGGTG TTTATGATTA TTATTATTGA
TTGTAGAGTA ATCTTGAACT AATTATAAAA TGACACGTAA ATGATGTTAA AATGTTGTCA AAAAATTGTT GTCAAAATAT
CATTATCTTT GTTAAATTAA AATAGTTTAA ATTGGTTGAG TCTTAGTTTT TCTTTTTGTT TGCATAGAAT TTTTCAATTA
TCATCAAATA ATAACAGTGA TGTTGATGGG AAAATAATTC TTCTAAACAT TGACAAAGAG TAATAATCAT TAAAAGAAAT
AATTGGGATA CTTTAATACA GTAAAATAAA ATTTAAAAAG TAAAAGAAAA CTACTGATAA AATAAAATTT AAAAAGTAAA
AGAAAACTAC TGATAAATAC TTTTTCTGTT GCCACTTTTC TACATTCCTC TAATTCCTCG TAAACCTTTA CTATTGCAAA
GTGAAAAAAA AAAGGTTCAA TTTTTCTCTT TTGTAGCAAC TTAGATGTCA CTTTCTACTT TTCTTCATTT ATATAATCAC
GATATTAAAA TATTATATAT AAGATTAGGA TTCTTTTGGA AGAAAGTACT GCATAAGCTC TTTCGAAAGA GAGATATAAA
AGTAAAATAA GTTTTTCTAC AAACTAAAAG TTAGTTTATC TATAAGTTGA AAAATAAATT TTGAAAAAGT TAATAGAAAA
TAACCTTTAA AAATTAAATT AGGTCGAAGT CAAATTTAAT TTATATATAT TTTTTGTTTT CGTCTCTTAA AGCTGTTTAT
AAAATAACTT TATCCAAACA ATTTTTTAAA ATGATTTTAA AAAAGTTTAT CCAAAACAAT TTTTTTTATG CTTTTATTGC
TTTTTAATGG AAAAATTCAC GCATACATCA TGGTTTCATT ATCAAATCAT TGAATATTTA AATTAATAAA ATTCTTATAA
AATTTTGTTA CACTACTACC AATCACTCAT GTTTAACTTT TGCAATAATT ATGCATGAAA ATTATATTAC CATCTAATTA
TTCTAAATAT TTTATTTTCA ATTTCTTGGC TGAGTCTTAA TTGAATGAGT TTTAAATTAT ATATATCAAT ACTTTATTTT
ATGCAAGGAA TGACTTGCAA TGGTATTACT AATAGAATAC ATAAATTTGT CTTCACCATT TGATGAAAGT GTTAGTGTTA
GATTCTTAGT TGATAATGAA AAAAAAAGTT ACAAGTTATT CATCCCTCAA ATGAGTTATT TATTAAGGTT GTATTTTTAA
ATCTGATCCA ACTCTATAAA ATTAATTCCG TAAAATCCTC TTTTTATATA GTATAAAAGG GTCGATTAAG TTTAATTCAA
TCTTAGAACT CACTCTAATT TAATCTTATT TTCAAATGAA GTAGGTTTGT TTCTATGGAT CTCTAATAGT TACATGAATT
ATTAATCTAA AAATTTCACT TGAGAAATTA ATAGGATGTT GTCATAAAAT CTATAATATA TAATTAGTAT TTAAAATATA
TGAAAATGAA ATTACTGGTT ATGTATAATG GATGTTTTAT TATTTGTTGT GGACACACAG TGGGTGATTG GGTTCTTGAA
CTTTTGGCAC CGAGGAGAAG GGCGCAGGGT AAGGATAAGG GTGTTACCAT GGCACGTGTT CCTTGGTCTA TACACCTATG
CATTGGCAAT AGCAACAGCA GAAACTGGTT TGTTAGAGAA GGTAACATTC TTACAAACAA TGAGAAATGT CTCCAAGCAC
AGCACTGAGG CCATGGTGGT TAATGCTTTA GGTTTGGTTC TTGCCCTCCT CAGTGCCTTT GTCATTTTGG CTGCTGTTTC
ACCTAAGTAT CAAACCATTC AGACCAAACT TTTGTACTCA GATACTACCA CTTTCTCATC TTAATAAGCT GCATTACACA
CCAATGTTTT CAACTTTGTT AGAGACAACT GTAAATAAAC AGGTTTGAAG AGAGATATTT TCATGAATTT CAATATTTTT
AATTGATTAT TTATTAAGAA AT

>Vigan.10G025000.01
TACATTAAAA ATATAAAATT TATTTAAGTA TTTGAAACTT AATTACATCT CTTAAAAATA AACCATAAAA AAAAATTGTC
TGGGAAGACA TCTATTTTCA GTAGAATTTT TGTTGAAAGT GTTGGTGTAG TGATAGCTAG TTCACCCAAA TGAAAAAGGT
GCAGTGTCGG CAAGAGCGAG TGTGAGTGAG TATGGGCACT GTGTATTCTC CCTCGCTCCT TGCTCTCCTG TTCTTGGCTA
GAGTTGCAGG TCTTGCAGTG GCAGTGCTTG TACTCATCTG GGCCCTTGCC TTCAAATCTA GCTTCCTCAC TCCTTCACTC
TCCCAACAAG ACCTTCTCTA TGCAGTTCTT CATCCTCTCC TCATGGTCAT CGGCTTCATT CTGTTAAGTG GAGAAGCAAT
TTTGGTTCAC CGGTGGTTAC CTGGATCAAG GGGCTTCAAG AAATTGGTGC ATCTGTGGCT TCAAGGGGTA GCTTTGGGTT
GTGGGATCTT TGGGATTTGG ACAAGGTTTC AGGGAAAAGA TGGGGTTGTT GCAAATTTCT TTAGCCTCCA TTCATGGATG
GGTTTGGTTT GTGTTTCCCT CTTTGCAGCC CAGTGGGTGA TTGGGTTCTT GAACTTTTGG CACCGAGGAG AAGGGCGCAG
GGTAAGGATA AGGGTGTTAC CATGGCACGT GTTCCTTGGT CTATACACCT ATGCATTGGC AATAGCAACA GCAGAAACTG
GTTTGTTAGA GAAGGTAACA TTCTTACAAA CAATGAGAAA TGTCTCCAAG CACAGCACTG AGGCCATGGT GGTTAATGCT
TTAGGTTTGG TTCTTGCCCT CCTCAGTGCC TTTGTCATTT TGGCTGCTGT TTCACCTAAG TATCAAACCA TTCAGACCAA
ACTTTTGTAC TCAGATACTA CCACTTTCTC ATCTTAATAA GCTGCATTAC ACACCAATGT TTTCAACTTT GTTAGAGACA
ACTGTAAATA AACAGGTTTG AAGAGAGATA TTTTCATGAA TTTCAATATT TTTAATTGAT TATTTATTAA GAAAT

>Vigan.10G025000.01
ATGGGCACTG TGTATTCTCC CTCGCTCCTT GCTCTCCTGT TCTTGGCTAG AGTTGCAGGT CTTGCAGTGG CAGTGCTTGT
ACTCATCTGG GCCCTTGCCT TCAAATCTAG CTTCCTCACT CCTTCACTCT CCCAACAAGA CCTTCTCTAT GCAGTTCTTC
ATCCTCTCCT CATGGTCATC GGCTTCATTC TGTTAAGTGG AGAAGCAATT TTGGTTCACC GGTGGTTACC TGGATCAAGG
GGCTTCAAGA AATTGGTGCA TCTGTGGCTT CAAGGGGTAG CTTTGGGTTG TGGGATCTTT GGGATTTGGA CAAGGTTTCA
GGGAAAAGAT GGGGTTGTTG CAAATTTCTT TAGCCTCCAT TCATGGATGG GTTTGGTTTG TGTTTCCCTC TTTGCAGCCC
AGTGGGTGAT TGGGTTCTTG AACTTTTGGC ACCGAGGAGA AGGGCGCAGG GTAAGGATAA GGGTGTTACC ATGGCACGTG
TTCCTTGGTC TATACACCTA TGCATTGGCA ATAGCAACAG CAGAAACTGG TTTGTTAGAG AAGGTAACAT TCTTACAAAC
AATGAGAAAT GTCTCCAAGC ACAGCACTGA GGCCATGGTG GTTAATGCTT TAGGTTTGGT TCTTGCCCTC CTCAGTGCCT
TTGTCATTTT GGCTGCTGTT TCACCTAAGT ATCAAACCAT TCAGACCAAA CTTTTGTACT CAGATACTAC CACTTTCTCA
TCTTAA

>Vigan.10G025000.01
MGTVYSPSLL ALLFLARVAG LAVAVLVLIW ALAFKSSFLT PSLSQQDLLY AVLHPLLMVI GFILLSGEAI LVHRWLPGSR
GFKKLVHLWL QGVALGCGIF GIWTRFQGKD GVVANFFSLH SWMGLVCVSL FAAQWVIGFL NFWHRGEGRR VRIRVLPWHV
FLGLYTYALA IATAETGLLE KVTFLQTMRN VSKHSTEAMV VNALGLVLAL LSAFVILAAV SPKYQTIQTK LLYSDTTTFS
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