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Vigan.08G153800.01

Basic Information:
Name: Vigan.08G153800.01
Multiple alignment
Variant Information
Position: Chr08:13721296..13727658 (+ strand)
Length: 6363
Functional Information:
Description: Similar to Uncharacterized protein. [I1LBW2, Glycine max]
GO: Biological Process: proteolysis (GO:0006508)
Molecular Function: aspartic-type endopeptidase activity (GO:0004190)
InterPro: Aspartic peptidase (IPR001461)
Aspartic peptidase domain (IPR021109)
Expression level (FPKM): Co,Em,Fl,Le,No,Po,Ro,St:40.49,21.18,14.46,16.49,10.69,9.73,16.81,25.55
Arabidopsis thaliana homolog: AT1G05840.1
Automatic updates:
Name: NM_001255310 NCBI(nuccore)
Organism: Glycine max
Description: Glycine max aspartyl protease family protein (LOC100801883), mRNA.
PubMed ID: -
Status: Known Variant
Structure :
Position: Chr08:13721296..13721539 (+ strand)
Length: 244
Type: five_prime_UTR
Position: Chr08:13721540..13721742 (+ strand)
Length: 203
Type: CDS
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Type: CDS
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Type: CDS
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Type: CDS
Position: Chr08:13724012..13724174 (+ strand)
Length: 163
Type: CDS
Position: Chr08:13724247..13724320 (+ strand)
Length: 74
Type: CDS
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Type: CDS
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Length: 143
Type: CDS
Position: Chr08:13727524..13727658 (+ strand)
Length: 135
Type: three_prime_UTR

>Vigan.08G153800.01 class=Sequence position=Chr08:13721296..13727658 (+ strand)
TGTTGGTCGG TTTTTTATTT TTATTTTTAA AATTTTGTTG TTGGTTGTTC TCATTCCACA ATAATCCTCT CCATTGCCGA
ATTAACCTTT TTCAATATAA CGGACCGAAC ACGGCAAAAC CATTACACCT TTACGCCAAA GCACCGAAAC GAGTCGCATC
GAGCTTCATT GAGCTGTGCT GGATCTGTTG CTACTATTTC TTTGATTCTT TCTGTTGAAT TGAACTAGTT AGGCTACTGA
ATTAATGGAT CCGAGAGGTT TAGTGATATT GGTGGCGATT CTAGTTGCGG AAATGAGTTG CGTTGCCGAC GGAACTTTAG
TGTTTCCGGT GGAGCGTCAG AAAAGGAGTT TAAGCGCTAT CAAAGCTCAC GATGCTCAAC GTCGAGGTCG AATTCTCTCC
GCCGTGGATC TCAACCTTGG CGGCAATGGT GTCCCTACTA ATACTGGGTT CATTTCTTTT GCTTCTTTAT CACATGTGTT
TTAACTGGAT GAATATTTGT TTGTACGGGA TTAAAATTCG TAAGGACTAA ATATTTTTTA GATTCAGAAT GAATGTCTTT
AATTGTACTA TATGGTTATT TCTAAATTCT AACATACGGT CTCTCAAGAA AATCAAGTAT TCGGTTAAAG ATAATAATAA
TACAAGGAAA ATAGAGTGAG ACAGTTGATA AGATTTTTTT TTTCCAGTTA GTTTGTTGTG GGGTAGTGTT TGAATATACG
TTATAAGGAC AGAATGTGGC GAATTTTTAG AATTTGTGAC CTGTAAGTGG GGAATTCTGA TTTGTGGTAT AGGAGTAGGA
TTAATTATTA TGATTTTTGA AGGAGGTAGC AGCGGTTTTC TTTATTTTCA TGCTTATGTT GTTGTTTATT TGGTTTAGTC
TGTATTATAC AAAACTTGGG CTTGGCTCTC CTCCGAAGGA TTATTATGTG CAAGTTGATA CAGGAAGTGA CATTCTGTGG
GTGAATTGCG TTGAGTGTTC GAGATGTCCC AGGAAAAGTG ATCTCGGTGT ACGTATCTAT GACTTTTTCC TCAGTTTGCA
GATTCAAATT CTGAATCGAT GACTTTTGAT CCTTGTTGAA TTTCCTAGAT TTGTGGTTGT TGCAACAGAT AGAATTGACT
CTTTATGACC CAAAGAGCTC TGAAACTGCA GAGCTGGTTT CTTGTGAGCA AGACTTTTGT GCTGCCGCGT ATGATGGTCC
AATGCCTGGG TGCAAGTCTG AAATTCCATG CCCCTACAGC ATAACTTATG GAGACGGAAG TGCAACTTCT GGATACTATG
TCCAGGATTA TCTTACTTAT AACCGTGTCA ATGGAAATCT TCTTACTACG CCACAAAATA GCAGTATCAT TTTTGGGTGA
GAATAATTAC AATTACTAAG TACCAATGTT TTAACTTCTC ACTAAATCTC TTTATTGTTG TCTTGTTATG ATAATTTTTA
GGCCGATCAT GTCTGGTGTT CAATCAGAGT AGGGGTTTCT ATGAGAGAAT TATCTTGGTT CTGAACACAA TTTCCATTCG
TTTGAGTCAT CTATTTCTGG TTATGTGAAA ACTTTGTAAG CAAGTAGGAA GTTTCACTAT ACTATTTTTA ATTAGAAATA
TTCAGGCTAA TAAGTTCCTA GGTTGATATA GATTAAATAA AAATTATGCC ATTTCAACTT TTTCTCCTGT TTATATTTCT
ATGGTTAATC TTTTGCTGAC AGGTGTGGCG CTGTACAATC TGGGACATTG GGTTCATCTT CTGAACAAGC CCTTGACGGA
ATAATGGGTT TTGGACAAGC AAATTCTTCT GTACTTTCTC AGCTTGCTGC ATCTGGAAAG GTGAAAAAAA TATTTTCACA
TTGCCTTGAC AATATTCGTG GTGGTGGAAT ATTTGCCATC GGGGAAGTGG TGGAACCAAA AGTTAGTACA ACTCCATTGG
TACCAAGAAT GTATGTACGG TAACTTAGTA TTTCACTCTC GTACTATTAT ATTGGTTATG AGATAACTCT AAGGGTAAAT
TTGATGGTCA CGCAGAGCTA CCAATAATGA ATTGTCTTAT GAATAACTTC ATGCGATTTT CACAAGATAT TTCAGTTGGT
TGGGTTGTTC TATAATTGAA GTAGGGAGCA GTGCTTAATA TTATTTGAAG GTAGAAAATT CCCTAGAGTG CTGAATCTGC
GTGGTTCTTT TTTTCTCCAT TTGGACATTT AAACATTTGA TATAATATAT TTATAAAAGA TTCAGAAAAT GAAGTAACGG
AAATATAATT TCAAAGCTAA TGTTGTAAAT GCTTGATACG AGAGTGGAAT ACAGCATTCA CACCAATGAT ATCTAATAGA
TTTTTATTTG TATATTTCTA TCAATTTGAT TGCTTTACGT CAATGTCATT AGTGCAGGAG TATTGAGCAG CACCTTTTCA
AACTTTTTGT CTTTTATTGC CCCTTTTGGA TCCTGCGGGG ATCGTTTTAA CAAATTTTTA ATAATAATTG GGATGTAGGA
AATTCCATCT CACTACTAGT ATTTATGTTT TATAAGGCCA CACAATAAAG GCCTTCCTTC TGTTTCTGTT GTTTTTATGG
CTTTACGTTT TCTGAAAGTA TATTCATCTG AGGCCTCTGG TTTGAGTTGT GAAATGTTTT TCAAGTACTT GCAATATATA
ATGTTTTGGT ATTCAGTTCA TTCAGATCTT GAGTTAAAAA AGTTATGCCG TAACTGTTAT CTTTTGACCA TTATAGGGCA
CACTATAACG TAGTTTTGAA GACTATTGAG GTTGATACAG ATACACTACA GCTTCCCTCG GATATATTTG AGTCTGGAAA
TGGGAGGGGG ACAATAATAG ATAGTGGAAC AACCTTGGCT TATCTTCCTG GGTTAGTTTA TGACCAACTG ATGCAAAAGG
TAAGTGTATC TATAAAGGTT TAACTGAATC AATATTTCCA CTTGAGTATT CATTAATGTT CTTTATGATA GGTTTTGACC
CGGCAGCCTG GACTGAAATT ATATCTTGTT GAACAACAAT TTAGTTGTTT TCAGTATGCT GGAAAGTATG ACGCTTATCT
TTGTGACATT CTTTTATTTA AAATTTACAT TTATCTTTTA TACTGGAACA AGTATTGGTT TATTCCTCAT TGTTTTTAAC
TGACATACAA TATTGCATAA CTTATTTGAG ATACTTTAGG TTTATTTTCT TGGTTGTTTA GTTCATAGGG TTTGATGTGT
CAACTTCATA TTTCTATTTA AATGTATCTT CGTAAATATC CATCCATGAC TGTTTGAGAA TGTCCGGCAA TCCAATATTC
TGAAAACTGA AGGAGGAAAA CAATTGTGAT AAAATAAAGG AAACAAGGCA GTAGTAATTA GGATAAGAGG TTGTGTAATA
AAATTTGTGC GCTTTAGCAA GGATGGTGCT TTGACATATG TTGGCCTTTT GATTTTAAAA TTACCTATTA GCTTCTTAAT
GAAGTGAATG TATTGTGTGC TATTAGGACT TTTGTTACAG AAAAATGTAT GACAATCACC TTAACCGGTC CTTTGAATTT
TCTGTTTTGG GTTTTTTATT ATTTGTCCTT TTTCTTTGTT TCTGAAGGGA GCTGTTGAGT AGGTTGGATA ATTATGTATA
AAGAATCTCA TGTTTGACTA TTTAGGTACA AAAGAAGTAT ATAAACCTTT TGTTGATACC TTACAAATAA CTATATTTCA
AAAGAATTGT CTATTAAAAA TGTGTTTTTT TTAAATAGTA ACTTGGTATT CATTGTTCAA ATGCTGTTTG GGTAATTAAA
ATGCATTTCT CTGTTTGACA ATTCAATTTC ATTAGTTCAC GAAGGCAACA AGTGCATCGA TAGTGTCTAG CATATGCGGC
CTTTATTTTA TTGATTGTTG TAATCTTGCA GTGTTGATCG TGGATTTCCA GTTGTCAAGT TTCATTTTGA GGATTCTCTT
TCTCTGACAG TTTATCCTCA CGACTACCTG TTTGATTTTA ATGTGAGTAG GAACATCATT TCATTGTAAA TGTACCCAGC
TTCTTATTTG TGAAGCTTTG TCTGCTAGAT ACTCAAATAC TCAATTGGCA AAAGGCTTTC TAATCTTAAA TTAACCTGTT
TTCTGAACTG GTTTCTCAAT TTCTTCAATG TACCTGATTC TTTCTGTGGT TTATCATACA AATTAAATTC CATGTATAAT
TATTGAGAAA TTTTCTGTAT GAAAATTAAA GGTATCTATT GTTCAATTTC AACTATAATG ATGGTTTAAA ATTTAAATCG
GCATCTTGAT AATGTTACTG ATATATTGTG TATCTTTTGA ATCTATTTGA GTACCTTGGG TTGATAAGAT CAATTACTGG
GATTTGATTA TAGTGTTTCC TGATATTAAT TTGTGCTTGA TTGACCCCAG GATGGTCGTA TGTGGTGTAT CGGCTGGCAG
AAAAGTGTGT CACAAGCCAA GAATGGAAAG GACATGACCC TTCTTGGAGG TACTATTTAG AATTGAATGA CACTTTATAA
ATTAATCCAT CAACATAGTG TAAGTTTACC GAACAAAATT TGTGCATTAA GTCATATTCT GATTGTTAAG ATATCAGGGT
CATTAATTTA TTATTGTGTT ACTGATATTG AGCTTCGACT TGTACTAGTA ATAATATATT TGTTACAAAT AGGTGTATTA
GGTTAAGTAT TTCACATCCA ATCAATAATA TGTTTGTAAC TGTTGGTTAT CTCTTTCTAT TTTCTTTCTT CAACAACCCA
GAACCCATAA TTCGAACAAT GGTGAGGGTT CATCTTACAG CTTTTCATCT ATTGCATAAT TTGTGTTGAA GAAAGTACAC
TTTTGTAAAC TTACTTTTGG ACCTTTACCT TTTCTGTTGC TTTGTCTATG TAACTGAAGC CAGTTCTATT CATTTTGTAT
ATCTTTTTTT TTTGTCAGCG TTGGATCTCA ATATCATTAA CTTTGAATTA TTTTCAATTG CAGATTTGGT GCTATCCAAT
AAAGTAGTGA TATATGATCT TGAAAATATG GCCATTGGAT GGACCGACTA CAACTGTAAG TATCAAGCAG CGTCTCATAA
TGTTTGTTTC CTACTTTGTT GCAGATGCAT CTGTTCCTTT TTAGTTGTCC GTTAAAATAA TAAAAATTAT TTGATTTTTT
TTAAACTTCA ATGCAATATT TAGTACAGTA CCTTTCCGAT TATGCCCAAC TGCTAAATAT TTACTCACTT ATCATAATTG
TGAGAAGAAT AATCATAATG GAGGTCTTTT ATTAAGTAAA AAACAATTGT GATATAAATT GGAGCAATAA TTACATTTCG
TAAGTTGTTT ATAGTTGAAA TCACGTAGCT TGTTTCCTTT AGTACTCTTT AATTTAAGTT AATTTCATCA TACTTAGCCG
AAACCTACTC CCGTATGATA TGTTTTAAAG GTTTATTTTT GGGCCCTACT TTAGGTTGAG AGAATCTTCT ATTATATTTC
ATTTCCATCT AATTTTAAAA CTCTTACCAT AAGAAATTAA GTGTGCTACA TGTTAGTCTA TTTTTGTTGT AAACGGGTCT
CTTAAAGTGA CAAGATAAAA AAGTTTTAGG GTGTATATTT TTTCATTATA CAGCTTTTAG GGTTGCCCCA AGCTAATTTC
GAACACACCC TATTAAAATG GAGTTTAGGC CTATGAAAAC TAAATGATGT TTTTTAAACA CTATGAGCCC TACTTTTATT
TCATCTTTTG GGGTTCTAAA TATGATAGTT CAAAATGAGT TGTTGAGAGC CTCAAAGAGT TAAAAGGTTT TCCTAAGAGA
TTGATTTACA TTATTAAAAT ATATTGAAGT GTAACATATA TTAATGTTAC ACGAGGATGT CTTAATTTTT AAAATTAAGT
GGAGTTTTGT AATTCAAGCA ACGGGAAAGC TTATTAATGA CTATTATTAG GTTGAAGAGA GTTTAATTTA CTTTTTAATG
ATTTTTTGTC TTCTCATTAG AAATGTAAGA GAAAGGTTAA TTAATTTATA CGAGCTTGAC CAAAAGAAAT TTCATTTGTT
ATAGTTATCT TATCCGTATA ACTCATGTTA ATTTCTTTTG GTTTTTGGGT TAGCTTACTT AGCATCGTGG TTCTTTGTTT
TTCAGGCTCT TCCAGCATTA AAGTGAAGGA TGAAGCCACC GGAGCAGTGC GTACTGTGGG TGCACACGAT ATTTCTTCAG
TTTCTACCTG TTTTATTGGA AGAATACTGA CTTTCTTTTT GTTGCTAATT GCGATTCTAA ACTATTAAAT TAACTTGGTT
TTGATATTCA TTTTATTTTG TTGTACCATA ATTCCTTGAA TGATAAGGTG TGCAACGTGC TTGATATGGT ATAATCAATC
ATTACTGGTG TAGATAGAAT TGACAAAGGT GCAAATATTT TTT

>Vigan.08G153800.01
TGTTGGTCGG TTTTTTATTT TTATTTTTAA AATTTTGTTG TTGGTTGTTC TCATTCCACA ATAATCCTCT CCATTGCCGA
ATTAACCTTT TTCAATATAA CGGACCGAAC ACGGCAAAAC CATTACACCT TTACGCCAAA GCACCGAAAC GAGTCGCATC
GAGCTTCATT GAGCTGTGCT GGATCTGTTG CTACTATTTC TTTGATTCTT TCTGTTGAAT TGAACTAGTT AGGCTACTGA
ATTAATGGAT CCGAGAGGTT TAGTGATATT GGTGGCGATT CTAGTTGCGG AAATGAGTTG CGTTGCCGAC GGAACTTTAG
TGTTTCCGGT GGAGCGTCAG AAAAGGAGTT TAAGCGCTAT CAAAGCTCAC GATGCTCAAC GTCGAGGTCG AATTCTCTCC
GCCGTGGATC TCAACCTTGG CGGCAATGGT GTCCCTACTA ATACTGGTCT GTATTATACA AAACTTGGGC TTGGCTCTCC
TCCGAAGGAT TATTATGTGC AAGTTGATAC AGGAAGTGAC ATTCTGTGGG TGAATTGCGT TGAGTGTTCG AGATGTCCCA
GGAAAAGTGA TCTCGGTATA GAATTGACTC TTTATGACCC AAAGAGCTCT GAAACTGCAG AGCTGGTTTC TTGTGAGCAA
GACTTTTGTG CTGCCGCGTA TGATGGTCCA ATGCCTGGGT GCAAGTCTGA AATTCCATGC CCCTACAGCA TAACTTATGG
AGACGGAAGT GCAACTTCTG GATACTATGT CCAGGATTAT CTTACTTATA ACCGTGTCAA TGGAAATCTT CTTACTACGC
CACAAAATAG CAGTATCATT TTTGGGTGTG GCGCTGTACA ATCTGGGACA TTGGGTTCAT CTTCTGAACA AGCCCTTGAC
GGAATAATGG GTTTTGGACA AGCAAATTCT TCTGTACTTT CTCAGCTTGC TGCATCTGGA AAGGTGAAAA AAATATTTTC
ACATTGCCTT GACAATATTC GTGGTGGTGG AATATTTGCC ATCGGGGAAG TGGTGGAACC AAAAGTTAGT ACAACTCCAT
TGGTACCAAG AATGGCACAC TATAACGTAG TTTTGAAGAC TATTGAGGTT GATACAGATA CACTACAGCT TCCCTCGGAT
ATATTTGAGT CTGGAAATGG GAGGGGGACA ATAATAGATA GTGGAACAAC CTTGGCTTAT CTTCCTGGGT TAGTTTATGA
CCAACTGATG CAAAAGGTTT TGACCCGGCA GCCTGGACTG AAATTATATC TTGTTGAACA ACAATTTAGT TGTTTTCAGT
ATGCTGGAAA TGTTGATCGT GGATTTCCAG TTGTCAAGTT TCATTTTGAG GATTCTCTTT CTCTGACAGT TTATCCTCAC
GACTACCTGT TTGATTTTAA TGATGGTCGT ATGTGGTGTA TCGGCTGGCA GAAAAGTGTG TCACAAGCCA AGAATGGAAA
GGACATGACC CTTCTTGGAG ATTTGGTGCT ATCCAATAAA GTAGTGATAT ATGATCTTGA AAATATGGCC ATTGGATGGA
CCGACTACAA CTGCTCTTCC AGCATTAAAG TGAAGGATGA AGCCACCGGA GCAGTGCGTA CTGTGGGTGC ACACGATATT
TCTTCAGTTT CTACCTGTTT TATTGGAAGA ATACTGACTT TCTTTTTGTT GCTAATTGCG ATTCTAAACT ATTAAATTAA
CTTGGTTTTG ATATTCATTT TATTTTGTTG TACCATAATT CCTTGAATGA TAAGGTGTGC AACGTGCTTG ATATGGTATA
ATCAATCATT ACTGGTGTAG ATAGAATTGA CAAAGGTGCA AATATTTTTT 

>Vigan.08G153800.01
ATGGATCCGA GAGGTTTAGT GATATTGGTG GCGATTCTAG TTGCGGAAAT GAGTTGCGTT GCCGACGGAA CTTTAGTGTT
TCCGGTGGAG CGTCAGAAAA GGAGTTTAAG CGCTATCAAA GCTCACGATG CTCAACGTCG AGGTCGAATT CTCTCCGCCG
TGGATCTCAA CCTTGGCGGC AATGGTGTCC CTACTAATAC TGGTCTGTAT TATACAAAAC TTGGGCTTGG CTCTCCTCCG
AAGGATTATT ATGTGCAAGT TGATACAGGA AGTGACATTC TGTGGGTGAA TTGCGTTGAG TGTTCGAGAT GTCCCAGGAA
AAGTGATCTC GGTATAGAAT TGACTCTTTA TGACCCAAAG AGCTCTGAAA CTGCAGAGCT GGTTTCTTGT GAGCAAGACT
TTTGTGCTGC CGCGTATGAT GGTCCAATGC CTGGGTGCAA GTCTGAAATT CCATGCCCCT ACAGCATAAC TTATGGAGAC
GGAAGTGCAA CTTCTGGATA CTATGTCCAG GATTATCTTA CTTATAACCG TGTCAATGGA AATCTTCTTA CTACGCCACA
AAATAGCAGT ATCATTTTTG GGTGTGGCGC TGTACAATCT GGGACATTGG GTTCATCTTC TGAACAAGCC CTTGACGGAA
TAATGGGTTT TGGACAAGCA AATTCTTCTG TACTTTCTCA GCTTGCTGCA TCTGGAAAGG TGAAAAAAAT ATTTTCACAT
TGCCTTGACA ATATTCGTGG TGGTGGAATA TTTGCCATCG GGGAAGTGGT GGAACCAAAA GTTAGTACAA CTCCATTGGT
ACCAAGAATG GCACACTATA ACGTAGTTTT GAAGACTATT GAGGTTGATA CAGATACACT ACAGCTTCCC TCGGATATAT
TTGAGTCTGG AAATGGGAGG GGGACAATAA TAGATAGTGG AACAACCTTG GCTTATCTTC CTGGGTTAGT TTATGACCAA
CTGATGCAAA AGGTTTTGAC CCGGCAGCCT GGACTGAAAT TATATCTTGT TGAACAACAA TTTAGTTGTT TTCAGTATGC
TGGAAATGTT GATCGTGGAT TTCCAGTTGT CAAGTTTCAT TTTGAGGATT CTCTTTCTCT GACAGTTTAT CCTCACGACT
ACCTGTTTGA TTTTAATGAT GGTCGTATGT GGTGTATCGG CTGGCAGAAA AGTGTGTCAC AAGCCAAGAA TGGAAAGGAC
ATGACCCTTC TTGGAGATTT GGTGCTATCC AATAAAGTAG TGATATATGA TCTTGAAAAT ATGGCCATTG GATGGACCGA
CTACAACTGC TCTTCCAGCA TTAAAGTGAA GGATGAAGCC ACCGGAGCAG TGCGTACTGT GGGTGCACAC GATATTTCTT
CAGTTTCTAC CTGTTTTATT GGAAGAATAC TGACTTTCTT TTTGTTGCTA ATTGCGATTC TAAACTATTA A

>Vigan.08G153800.01
MDPRGLVILV AILVAEMSCV ADGTLVFPVE RQKRSLSAIK AHDAQRRGRI LSAVDLNLGG NGVPTNTGLY YTKLGLGSPP
KDYYVQVDTG SDILWVNCVE CSRCPRKSDL GIELTLYDPK SSETAELVSC EQDFCAAAYD GPMPGCKSEI PCPYSITYGD
GSATSGYYVQ DYLTYNRVNG NLLTTPQNSS IIFGCGAVQS GTLGSSSEQA LDGIMGFGQA NSSVLSQLAA SGKVKKIFSH
CLDNIRGGGI FAIGEVVEPK VSTTPLVPRM AHYNVVLKTI EVDTDTLQLP SDIFESGNGR GTIIDSGTTL AYLPGLVYDQ
LMQKVLTRQP GLKLYLVEQQ FSCFQYAGNV DRGFPVVKFH FEDSLSLTVY PHDYLFDFND GRMWCIGWQK SVSQAKNGKD
MTLLGDLVLS NKVVIYDLEN MAIGWTDYNC SSSIKVKDEA TGAVRTVGAH DISSVSTCFI GRILTFFLLL IAILNY*