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Vigan.08G045000.01

Basic Information:
Name: Vigan.08G045000.01
Multiple alignment
Variant Information
Position: Chr08:3564831..3571529 (- strand)
Length: 6699
Functional Information:
Description: Similar to Uncharacterized protein. [I1NFX0, Glycine max]
InterPro: UNC-50 (IPR007881)
Expression level (FPKM): Co,Em,Fl,Le,No,Po,Ro,St:10.84,9.38,14.49,9.91,13.54,10.92,15.78,13.78
Arabidopsis thaliana homolog: AT2G15240.1
Automatic updates:
Name: NM_001248514 NCBI(nuccore)
Organism: Glycine max
Description: Glycine max uncharacterized LOC100500001 (LOC100500001), mRNA.
PubMed ID: -
Status: Known Variant
Structure :
Position: Chr08:3564831..3565554 (- strand)
Length: 724
Type: three_prime_UTR
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Type: CDS
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Type: CDS
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Type: CDS
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Type: CDS
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Type: CDS
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Type: CDS
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Type: CDS
Position: Chr08:3571197..3571529 (- strand)
Length: 333
Type: five_prime_UTR

>Vigan.08G045000.01 class=Sequence position=Chr08:3564831..3571529 (- strand)
ACCAAATCAT AATGTATCAT GTATGTATGT ATGTATTGTG TATGATATGA TTGGGAAGGT TTTTTTTCTT CGTAAGATAG
AGTGGGTCAG AAGGTGATTA GAGTCCAGTA CCGAAATTGT AATCGGCCCA GGTTGGTGGT GTAGTCATTT TACTTTTCAG
TCCTTTCCCA TCCCATCTCG CATCTGTGAG AGAGTTCGAG GTAGCTACCG GAGAGAAACA CACAGAGATC GCAATCAACA
ACACATAACA GCACGACAGA GAATAATAGA ATCGTGAATC GTTTGCAGAA GAAGAGGTAA AGGAATCGAG AAGAGGAGTC
ATCGAAGCCA AAGATGTTAC CCACAGCTTC CAAAGGACGT TCTTCTTCTT CCTCTTCTTC CTCTCGACCT AATAATCCCA
TGCTGCTTCC CTACCTCCGC AGAATCATCA AGGTTCCGAT CTCTTTCTTT AATTTCCCGA TTTCGTAGAT TTACTTCGCG
CTCCATTCTA AGATCCAATT CCTGCTTTTA TCTCTCCCTC TGCTTCTCAC ATCTTAAATG CCATTGCTTA AATTACCCGG
CGTATAAACT AAATTGTTGC TCAATTCCTC AATGTTTCGG TTCAAAATTG AATAGGTTGG ACTGTGCTGT TCTGATTTGA
AGAGTCCGAT AGGCGTGAGT GTTCAATCTG TGCTGATTCG TTTGTTATTC TTGTAGTGGC AACAAATGGA TATTGAATAC
ACCTTTTGGC AAATGCTTCA TCTATGTACG TCACCGAAAG TTGTGTAAGT ACATGTAAAT TAAATCATCT GATCTCTGCC
CTTCCCCTTG CTGTTAGCAA TGAAATTCGA GTTTTGTTAC CATGATCCAA CGCAATAGCA ATGTGAATCC AATTTTGTGG
GACATTAATA TTGTGTTCTT TGTCGAGATT AACCCTTCTG CTTTGTGTGT ATTTGAAATT TTCTATAACT GGTTCTCTGA
ATGCTTTTTT GGTGTTGTTC TTGGAATGGA ACTGTACCAC GGATGCAGCT ATCAGCATAC TAAATATCAC AAACGTAAGT
CTATGTCTTG TGAATATTTT TATTCTTTAA TATTTATTGG TGCAAATTTT TTCAGTCATT AGTTCACCAA TGTTTTTTGA
GCTTGTTTTA CTGGCTATGT TCCTTTGGTA GCGTTTATTT GAAATAATTT ATAGTACATT AGGCTAGTTA CATCCTTGTG
ATATGTTCCA GGGACAATAA GTAGTTGTCA TTGGTGTAAG TATCTTACAC ACAGTGTCAG ATTGGAAATG CATTTAGTGG
TATATTGTTA AACCCAAGAG TTTATATATA AACTTGTGGA GCATCCTTAA ACTTGACTTG TGGACCTAAT ACAAAATGTT
TGTAAAATTC CTTATACTAA TGAGGAAAAG TACAAAGGTT TTCATGGGGA AAATGCAACA GAATAGTCCT CTAGTGCTTA
TCGTTTCGGT ATAGCAAAGC ACAATAGATT ACTTCGGAGA ATTGCTAATG GTTATATTCG AAAACACATA ACGGAACACA
AAGAATGTGC ATTGATTCTG GATTGAAAGC ACAACTAGAA TGGATGATAG GGATTAAAAA CAAACTCAAA TACCTCAAAT
TGTATTAAAA CTCACTGAGT GGAACTAAAC AACATTAGAA TCAGAAGCTA ATGTGAAGTT TTAATAAATA AGGAGACAGT
ATAAAATAAG GTGCACTTGG CGATCACCCT AGTCTGCTGG TAGCAGCCCT TCTCTGAGGC AGAAGCCTTT CCAGCCTCCT
CCTCCTCCTA CATATTCCCT TTCCAACCAA ATGTTGCCAT CTGTCCATCC TATTATTATG CCAATTATGT TTTACGCTGA
CTGAAAACCC TTCATTGTCC CATAAATTTT CATTCCTTCA TAGCCATTGC CATTTTCTGA TCACTCTCTT GTTTCCTCAA
TTTCCTTTCT CTCAATTTCC TTTCTCTCCT TTTCCTTGGA CTGACTTGAA CCACATGTAA TCTATGGATG AATTTTGAGA
TACAGCACAA ATGGACCTGG ATTTATTTTT AAAGAAATAG AATGTGACAA GCTCATTGTC ATTCAGTTGT AATTGCAGGT
CCATATTTAA AATAAATGAG TAGGTTGGTA ATGATATAGT TATATTAAAT ACTTCAAAAA ATTATTTTCT TGGTTCATGA
ATGAATTGCT GAAAATATTT TTATGGTGTG GCTTGATGGG TCACAAGGGC ATGGGTTTTG TTGTTTTATT CTCCTTGATT
TGAAATCGAT GCTTTGAAGG GGGAGTTCAG GATACTGTCA TTATTTCTGT AATTTGGGAT CATAATTTGC ATCTTATATC
AGACCCATGG ACTCCGTGCA TGATTTGTGA TTCTATTTGA GTTTTAAGAG AATGGAAGTC TAATGAGTCC AGTTGAGTCT
ATCAAGAAAT GAGTTTAAAG TTGAGTCTGT CTGATTCCCC TGCCCACAGC TGTAGACTTG TATGGTTCTA CAAACTGACT
CGTGGTCTTC TCAACCATGA CTAATGAATG ATTCCAATGA CATCATTCGT TGATCTTATG CTGAAATTCC TTTTATCTTT
ACTGGTGAAC TGATTTCACT TACTTGGGAT GATAATATTT CTTCTCAAAC AAGAGGTTAT GAGCAATATT GTTTTTGACT
GATTTGGGCC TTATCGTTCC ATTCCCTTTT CACAAATCTC TTATAAACGT TATACATGCA TATAACAACT GACAGACACA
ACCAATGATT GGATAGAATT TAAGAATTTC ACAGCTCCTT TCTTTCAAGT AAAATTACCT TTTAATGCAA AAGTTAATTC
ACCGAGAGCT GCTTTTGAAG ATGAATGATC GAGAACTTTG GCTTATTATT AGGCTTGCAA ATCAACTTAT TTTAGTGATA
CACAATCATG CAAATGTTTC AGGAAAAAAA GACTTCAGGG TTAATTGTAT AATTAATGTC TTTGCTTTAT GAAATTAGGA
AATTTCATTG GTGATTTCAA AAAATTGTTT AATTGATTTC CTTCTTATTG TTTGATATTA GAAACCAAGA ATCAATGGGC
ACGTGATGAC CCTGCATTTG TTGTGATCTG CAGTCTTCTT TTGGCAGTTG CAACTTTGGC TTATTGTGCT GCGTAAGTTT
TTTTAAACAT TTGATGGTGT TGGCTCCTTG TGGACCAGTA GCTAAAATTC ACTTTACTTT TGTAAAACAG AAAGAATATG
CAAATGTTCC TAAGTAAATC CTTGTATTTT ATTTATTTAA TTGAAGGATG ATATTTTGAA AACTTCCCTT ATAAAAACAT
TCTGTTAATT TAGAGTTTGG TATGTGAATC TTATTAAATC GTGTATCATG AACCAAGCTT GTATTGTTGT TGGATTATCC
ATTATTTAAC TTTTCTTTAT ATTTGTTCTC AATCTGCCTC TACTAACTTT TGGTATTATA TTTTCCCATA TACTTTCAGG
TATGACCATA GTACTGCCCA TACACTTCTT GTTATCTTCT CAGTGTTGTT TTTCCACTTT GTACTGACAG GTGTATTTCT
GGCAACTTTT TGTTGGTAAG GGTACTTCCT GTACAAATTA TTGCATCCTT TTTTTTAATC ACTTGATCTT GGTACCAACA
GTGGTGGATA TTATCCGTGT ATTCTCTAGG TTCCTGACTA ACTCTTATCT TCGAGAAGAG GCTCCAAATA GCTATGTGGT
TGAACAACGT GTTGAATGGT AAGTTCAAGA AATTGTGCCT GTTTCATGTG TTAACTTAGT TTGCTTCTTG TATTCTGAGA
ACATTTTCTA ATATTTGGCC ATGCTTCTTT AAAATGCCTG ATCAATTGAT AAGCAAAGAA TTGAATTGAA CCCTTGTCTT
ATAATTTTGT TAATTATTTT TCAATAGCTG ATTATATTTT TTTGGTTTTT CATGGAAGGA TGTATGCATT TGATGTACAC
TGCAACTCTT TCTTCCCATT GTTTGTTTTG CTCTATGGTA ATTTCTGACT CCTTGGTTAG TGTGAACTCT GTTATGATAT
AGGAAGCTAC AATATCTTGC ATTAGAGTGG TACTGATGTC TGGTCCCTTG ACAGTGATCC ATTATTTTGT ATCTCCTCTA
TTGTTGGCTC ATGGTTTCAT TCCAGTATTG CTCTCAAATC TTCTATTCAT GGTGGGAGCT TCATACTATC ATTATCTAAA
TTTCCTAGGT TATGATGGTA ACCCTCTCTC TCTCTCTCAT TAATATTTTT CTTTTATACA CAAACACACA TACACCCGTA
TATATATGTT GCACACACTC TTACACTGTT CAACAACCTT TTACTAGATT ATTTTATCCC AGAACTCACC AATAGATTAA
AAGTATCCGT TGCATAAATT ATATGCAGAA TTTTATATTA GTTCAGTACT TTATACCTTG TACATGCTCA TCAAAATCAA
CGTAATTAAT GTACTATATA CATTTAAAAT ATATGAAAAT AAGAATCATT TAGCTATCTT CATTCAATTT TTATATGATT
TAACATGAAA AGTCTCAGAA TATACACCAT CTTTTAGGAT CGTTTTAATT GCTTCACTAG AATTAAAGAA TATAGGTAAT
TTAGTTAATG GCATTAAATT TTTGAACAAT TTGTGTAATT TTTCCATAAT TACCCACCAT TAAAATTCCA TTTTATCGAT
CTGTTTCTAC CTAGTTAATG CATCTCAACT TAAGGGAATT TTTGTAAAAA ATGTAAATCA ATGAGGTAAA CAACTTGGAG
GGACTCTTAT AAAAATGAGG CCTAAATATG TTTTTAATCC CTGTAAAAAT TTGGGTCACT ATAACATTTT TCATTTCATC
CCTGCAAAAT TTAAAATAAC CATTTTTAGT CTATGTGTGA ATTTTGGTAT TAGTCACAAT ATTTTTCTTT AATTTTCATC
CCTCCGAAAT TTCAAGTCCC TACTTTTAAT TTTAAGATGG ATAGGTAATA TTCATTTTAT TGATTATTTA GGAGTTTGTT
TTGGATGTCA TATACGAACA TTATATCACA AAACTATTAT GCGTTCTTAC AGAATGGCGA TTAACCTTTT ACTCAACGTA
TAAGCCTTTA ACTAGTATCA TAAGTCTAGG GAGGAAAATA TTAGTGATTT TCAATTCTAA AGGGATCAAA AGCAAACAAA
TATGTAATAC GGACCAAAAG AAGTCACTGA TTTTATAGGG ACGAAAAACA TTTTTAAATC TGAAAATAAT CAAGACAAAC
TTTCCATATA AGATTATGAA AAGGACTGGA GGCAGTACCT ACAATTCAGT AGTTAGATCA TGAAAATCAC ATTTTAAGCG
AAGTTATTGA TTGTGTGAGA ACGATTGTAA CTTATATTGG TGTGAGTATC TCCTCGTTGA GGTTAGTTCA TAATACTTCT
TTTAGTGTAA TTTCCTTGGG TATGGCTGAA TTTTCAAGAA AAGTGTCTAA GGGCTAGAGG CTGGCTCCTC TAATTTAGCT
CTTCATAAAT ATGCTCATCT GCAGTGATTC TGTTTTAATA CTTGCCAATT ATACTGTAGA ATTCAGTTGT GCGTTATTGA
ATATTTGCAG CAAGTACCAT TTCTTTGTTT TTTACTCTAA AGTCCCCCTT TTATGATATG GAGAACAATT TCATATGACG
TGGCTCTGTT GGATGTATCA GCATATTGAA TGAATGTACA TTAAAGTGTT TTGGGTAAAC TTGTTTACTG AGTGTGTATA
ACTCTTAAAC TAGAAGTTTT TGTTGAGTTA GTGGAAACTG TGAATACCGT TGAATTTATT TGATATAATT TGTGGTTGTA
GTTCTGCCTT TTTTGGAGAG GACCACCTTT TTCCTGTACC CCATTGGCAT CGTAATTGTC CTTTCTCCTA TTTGTAAGTA
TTGAGCGGTA CCATTTCTGT TATTTCATGA TTGATTGAAA TTGAATCTGA ACCCAATTTC TTATTTGCAG TGATTTTAAG
TGGTTTCAAT CCATCTAGAT ACTTTATGAA CATGTACTTC AGTCGACAAA TATGATCGTT CCAGCTAGAA CTTTTGACCT
ATCGGTGTCC TTGAGGTTAT AGAGTATTCG GAAAACTATC ACATGAGAAG GCTTTGATGA ATGTTTGATT GTTTGTTTGA
AGAATGCATT GGCCCAGCAA TGTCTCATTT TAGGCCTTCT AATACTACTA CCAATCAAAG TTGGACTGTA GCAAGTCAGG
GTAGTCAGTG TATTTTTTAC AGTTATTAGA TAGAATATTT GTTCAAATGA ATATACTCAT TGTAATGAAT TTTCTTTGTC
AATCCGGTAG CTTTCCTCCC GACAAAGAAC AATTTATATT GATATATTCT TTGATGAGGT TAGATACTTA AATGAAAGGT
CTTCCCATTA GCTCGTCACA TAAGGAGTCA TTGTTAACTT TTAGTTTCAT TAGAAGCCAC TCGAGCCAGG TACCAGTAAG
AGTTAGGGAG GAGCTGATCA AAGCCGGGGA GGGAGCATTT TGTATGTATG ATATTTGCTG GTTATGTATG TTATCTGACT
GAATATTGCT TCACTGTGAG GTGTTTGGTG GTTCAATGGC GAGTACGGGC TACTTATAAA ACTATTTTAA TGGGCAACTC
AATTTTTAAA CCCGTAGGAT AGTGATGTTT GAAAAATATG TGTTACCTAA TGTCTACGCA CGTGTATGAT TTGGATGAGT
CATCCGGGTA AAGATATTTG AGCATGGTTA TAGGATACTA TCTTAATAGT GTATTTGGA

>Vigan.08G045000.01
ACCAAATCAT AATGTATCAT GTATGTATGT ATGTATTGTG TATGATATGA TTGGGAAGGT TTTTTTTCTT CGTAAGATAG
AGTGGGTCAG AAGGTGATTA GAGTCCAGTA CCGAAATTGT AATCGGCCCA GGTTGGTGGT GTAGTCATTT TACTTTTCAG
TCCTTTCCCA TCCCATCTCG CATCTGTGAG AGAGTTCGAG GTAGCTACCG GAGAGAAACA CACAGAGATC GCAATCAACA
ACACATAACA GCACGACAGA GAATAATAGA ATCGTGAATC GTTTGCAGAA GAAGAGGTAA AGGAATCGAG AAGAGGAGTC
ATCGAAGCCA AAGATGTTAC CCACAGCTTC CAAAGGACGT TCTTCTTCTT CCTCTTCTTC CTCTCGACCT AATAATCCCA
TGCTGCTTCC CTACCTCCGC AGAATCATCA AGTGGCAACA AATGGATATT GAATACACCT TTTGGCAAAT GCTTCATCTA
TGTACGTCAC CGAAAGTTGT CTATCAGCAT ACTAAATATC ACAAACAAAC CAAGAATCAA TGGGCACGTG ATGACCCTGC
ATTTGTTGTG ATCTGCAGTC TTCTTTTGGC AGTTGCAACT TTGGCTTATT GTGCTGCGTA TGACCATAGT ACTGCCCATA
CACTTCTTGT TATCTTCTCA GTGTTGTTTT TCCACTTTGT ACTGACAGGT GTATTTCTGG CAACTTTTTG TTGGTTCCTG
ACTAACTCTT ATCTTCGAGA AGAGGCTCCA AATAGCTATG TGGTTGAACA ACGTGTTGAA TGGATGTATG CATTTGATGT
ACACTGCAAC TCTTTCTTCC CATTGTTTGT TTTGCTCTAT GTGATCCATT ATTTTGTATC TCCTCTATTG TTGGCTCATG
GTTTCATTCC AGTATTGCTC TCAAATCTTC TATTCATGGT GGGAGCTTCA TACTATCATT ATCTAAATTT CCTAGGTTAT
GATGTTCTGC CTTTTTTGGA GAGGACCACC TTTTTCCTGT ACCCCATTGG CATCGTAATT GTCCTTTCTC CTATTTTGAT
TTTAAGTGGT TTCAATCCAT CTAGATACTT TATGAACATG TACTTCAGTC GACAAATATG ATCGTTCCAG CTAGAACTTT
TGACCTATCG GTGTCCTTGA GGTTATAGAG TATTCGGAAA ACTATCACAT GAGAAGGCTT TGATGAATGT TTGATTGTTT
GTTTGAAGAA TGCATTGGCC CAGCAATGTC TCATTTTAGG CCTTCTAATA CTACTACCAA TCAAAGTTGG ACTGTAGCAA
GTCAGGGTAG TCAGTGTATT TTTTACAGTT ATTAGATAGA ATATTTGTTC AAATGAATAT ACTCATTGTA ATGAATTTTC
TTTGTCAATC CGGTAGCTTT CCTCCCGACA AAGAACAATT TATATTGATA TATTCTTTGA TGAGGTTAGA TACTTAAATG
AAAGGTCTTC CCATTAGCTC GTCACATAAG GAGTCATTGT TAACTTTTAG TTTCATTAGA AGCCACTCGA GCCAGGTACC
AGTAAGAGTT AGGGAGGAGC TGATCAAAGC CGGGGAGGGA GCATTTTGTA TGTATGATAT TTGCTGGTTA TGTATGTTAT
CTGACTGAAT ATTGCTTCAC TGTGAGGTGT TTGGTGGTTC AATGGCGAGT ACGGGCTACT TATAAAACTA TTTTAATGGG
CAACTCAATT TTTAAACCCG TAGGATAGTG ATGTTTGAAA AATATGTGTT ACCTAATGTC TACGCACGTG TATGATTTGG
ATGAGTCATC CGGGTAAAGA TATTTGAGCA TGGTTATAGG ATACTATCTT AATAGTGTAT TTGGA

>Vigan.08G045000.01
ATGTTACCCA CAGCTTCCAA AGGACGTTCT TCTTCTTCCT CTTCTTCCTC TCGACCTAAT AATCCCATGC TGCTTCCCTA
CCTCCGCAGA ATCATCAAGT GGCAACAAAT GGATATTGAA TACACCTTTT GGCAAATGCT TCATCTATGT ACGTCACCGA
AAGTTGTCTA TCAGCATACT AAATATCACA AACAAACCAA GAATCAATGG GCACGTGATG ACCCTGCATT TGTTGTGATC
TGCAGTCTTC TTTTGGCAGT TGCAACTTTG GCTTATTGTG CTGCGTATGA CCATAGTACT GCCCATACAC TTCTTGTTAT
CTTCTCAGTG TTGTTTTTCC ACTTTGTACT GACAGGTGTA TTTCTGGCAA CTTTTTGTTG GTTCCTGACT AACTCTTATC
TTCGAGAAGA GGCTCCAAAT AGCTATGTGG TTGAACAACG TGTTGAATGG ATGTATGCAT TTGATGTACA CTGCAACTCT
TTCTTCCCAT TGTTTGTTTT GCTCTATGTG ATCCATTATT TTGTATCTCC TCTATTGTTG GCTCATGGTT TCATTCCAGT
ATTGCTCTCA AATCTTCTAT TCATGGTGGG AGCTTCATAC TATCATTATC TAAATTTCCT AGGTTATGAT GTTCTGCCTT
TTTTGGAGAG GACCACCTTT TTCCTGTACC CCATTGGCAT CGTAATTGTC CTTTCTCCTA TTTTGATTTT AAGTGGTTTC
AATCCATCTA GATACTTTAT GAACATGTAC TTCAGTCGAC AAATATGA

>Vigan.08G045000.01
MLPTASKGRS SSSSSSSRPN NPMLLPYLRR IIKWQQMDIE YTFWQMLHLC TSPKVVYQHT KYHKQTKNQW ARDDPAFVVI
CSLLLAVATL AYCAAYDHST AHTLLVIFSV LFFHFVLTGV FLATFCWFLT NSYLREEAPN SYVVEQRVEW MYAFDVHCNS
FFPLFVLLYV IHYFVSPLLL AHGFIPVLLS NLLFMVGASY YHYLNFLGYD VLPFLERTTF FLYPIGIVIV LSPILILSGF
NPSRYFMNMY FSRQI*