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Vigan.05G195800.01

Basic Information:
Name: Vigan.05G195800.01
Multiple alignment
Variant Information
Position: Chr05:17579554..17586896 (- strand)
Length: 7343
Functional Information:
Description: Similar to Transport protein SFT2-like protein. [T2DPE0, Phaseolus vulgaris]
GO: Biological Process: transport (GO:0006810)
Biological Process: vesicle-mediated transport (GO:0016192)
Cellular Component: integral to membrane (GO:0016021)
InterPro: Vesicle transport protein, Got1/SFT2-like (IPR007305)
Vesicle transport protein, SFT2-like (IPR011691)
Expression level (FPKM): Co,Em,Fl,Le,No,Po,Ro,St:17.72,13.79,22.77,12.92,22.16,39.34,26.06,20.30
Arabidopsis thaliana homolog: AT4G26550.1
Automatic updates:
Name: NM_001251523 NCBI(nuccore)
Organism: Glycine max
Description: Glycine max uncharacterized LOC100306412 (LOC100306412), mRNA.
PubMed ID: -
Status: Known Variant
Structure :
Position: Chr05:17579554..17579856 (- strand)
Length: 303
Type: three_prime_UTR
Position: Chr05:17579857..17579967 (- strand)
Length: 111
Type: CDS
Position: Chr05:17580327..17580431 (- strand)
Length: 105
Type: CDS
Position: Chr05:17580580..17580847 (- strand)
Length: 268
Type: CDS
Position: Chr05:17586523..17586710 (- strand)
Length: 188
Type: CDS
Position: Chr05:17586711..17586896 (- strand)
Length: 186
Type: five_prime_UTR

>Vigan.05G195800.01 class=Sequence position=Chr05:17579554..17586896 (- strand)
AGGTATTGTA GCAATCGAGT GGTGATTTCA ACAATAGAGA GCAGAAGCAG CTATTCAATT CTCAACAACC GGAAGCACTC
AGCACACAAC AGATAAATCC ACACATCAAA TCGCAAATCC TAATTAATTC CATTTCCCCC TTTTCTCCCT CCAAGCAATC
ATTCGTAGTT GGAATTGGTG ACCAAAATGC AGGGGTGGTT CTCGGCACCG AGCGGTGGTG AGGAGGAGGC GAAGCCCTCC
TCGTCGTTGC TTGCCGATTG GAACTCCTAT GCCTCTAATC AATCCTCCCA GGACAGCTCC AGTTTGGGTC TTTCCTTCGA
TCTCGAATCC GCCGTCAGGT CGGCCAATGA CACCGTTTCC GGCACCTTCA GCGTGTAAGG AACCCCACTT CAATATCTTA
CCACGCCTCT TGTTTTGCTT TATCTGTTTG TATGCAAACG CAAATATGGT TTTAATTTTG TGTGTTGTGA GAATCGTGTA
ACAGCTTAGT GTTTGTAAGT GAAATTCCAG ATCCGTATCT GAGAAGCTTG GGGTGGGAAA TATTTGTCCC CAGTAATACA
AAATCATGTT AACCTAAAAC AATCACAATT ATAGGTCGAA TTAGGCTCAG TTTGGATAAA CTTGTCTTTG GAAGCACTTG
TAACTTATAG AGAAGAGATT AAGAAAGCAT AACCGTTTGG GAATCTAATT TTTTTAACTC ACTTAGGCTC TTTTTAGATG
AACTTTTCTG TTGAAGCACT TGTAAGAGAA GAAAACGAGG AAGTAAAACA AGTTAGTAAA ATGGATTTGG ACTCTAAATT
GAGTGATCCA CTCTGAAGCG TAAAAGTAAG TAATTTGATT GTTGATGAGA AATCGACAGT GGATGTTATT GTACATTCAT
GCAAATCACG TTTGTCTTAA AGTATCAACG GCTGATTTTC TTTCTTATCT CCTCCACTCC CTAAAGCGAA TTACTTGTTT
TTGAGGAAGC GGATCCAATT AACTAAACTT GTCATTCGTA AGTTAAAATC AACTTGTGCT TTTAATTTTT AAAGAAGCTC
TTTTATACAA CTTCTTGAAA AGCTGAGGAC TTAGGTGCAA AAGTTGTTTT TTCTTATGGA AGAAATTTGA TTCATCTTAC
CTTTATACGT TCTTTTCTTG TTAGTGTTTT AGGGAGAAAT TTATCCTAAC AAAGTCTTAG TTTATAAGCA TGAGAGACTT
TGGTTTAGTC CTTGAAAAGA ATCAATGTGA CTGACATTGT GATTTCTGGG GACTAAGGTG GAATTTTTCT ATTTTTAAGG
ATGGAGAGTG CCATGCCAGT AGCCATTGGT AAAATTCGTT TAAACCTGAA GATATTGTCA AAATAACTTT AGCTTGGATT
TTGTTCCCTT TATTATTATA GTTGTTGTTG TTGTATTGTA GGTTTTGATT GGTTGTACTT CTAATTATTG TGCTTATTTA
AGTATAACGT TAATTATTCA ATAGATAAAT CACCGGGTTT AGAAAAAAAT CATTTTTAGG ATGTTGATTT AATTGGAGTC
ATGTACACTG TTGATTCAGA AGGAAGTTTG ACACACAAAC TAGATTTGTG CTAGGCTAAC AGAACCCTCA GTGAGGGATA
AGATAGATGT TGCTTGGTGT TATTAAGCTG CTTAAGGGCA GGACTACACC AAGATGGAAA GCCTTATTAC TTGGGATTAA
CTCTATTGCT TGCAAGGTTT TGGATCAAGG AAGTGCCTAA GGTGTTTCAT ACCATGAAAA GTGTTCATCA TACACATGGA
TAAATCTGTT TTGGTAACCA TGTCCTGTAG ACCAGGTGGA TAGAGTGGAC TAGAGACTTG TTTCGCAGGT CCCAACTTTT
ACTTTGACTC AAAACTCAGA AGTGGCCATC TATGTCTTTG ATGCCACTGG AAACTTGAGC CTCCCAAAAC CCATCTGTTA
ACTATAGTAA AGAGGGAGAC ATTGAACTAA AATCATGTGT TTCTGAGACA ATACAAATGC TTTATTTATA TAGAGAAAAA
GAAACCAATA CAATAAATAT AGGAGATTTG ATATCCTCTA ATGGTAAAGA TATGGTACAG GAATAAATAA AAATATTCCT
AAATACATTT ATAATCTAGA TATTCTTGGT TATATATGAT ATGCTCATTA TTTCTATAAC TCTACCCTTC AAGGTGGACC
ATGTAAGTCT AATGTGCCTA GTTTCTTGCA AATATAATCA ATCATTGGTC CTCTTAGAAA CTTGGTGAAT ACATTTATTA
ACTGTTCACT ATAGTTGGCA AATCTAGTGG TGAATACATT TAGTAACTGT TTATTATAGT TGACATTTAG TAACATTTAA
TAACTTTTCT CTTATGAAAT GAAAATTCAC CTCAATATGT ATGGTCCTCA TAAAGCACAG GATTGGAGGC TACATGCAAT
ATTTCCCGAT TGTCACATAT AAGGTGCCTT TGGGAAGTTT CTTAAAAAGT TTAAGCTCTT TGAGGTGGTG TTTTAGCCAT
AGTTCACAAG TGATTAATGC CATTATCCTC TATTATGATT GTTCACTTCA TCTTGTGACA ACATTTTGCA TCTTACTTTT
CGCAACATTA AATTACCTCA CCCAAGAACA CATTAAAAGA AGAGATTTGA CATCCTTTAA TAATAAAGAT ATGATATGGG
AATAAATAAA AATATTCCCA ATAATACATA TATAATCTAG ATATTTTTAA CTATATAGGA TGTGCTCCTT ATTTTCGTAT
TATAATGTAT CAAATGTTTC ATAGTTTTCT CTTCCATTAA CATGTTATAT AGGGCTATCC AAGATGCAGC CCTAATCCAT
ATATACCTTG TGGATTTCTT CTTTTAGGGC CATGTCTCAT TCCCAGTTTC TCGCCAATCC CCCACCCCCA TTGTTGTGTT
CTCATTCTAG CATGTTCATA CCTAATTTCC AGCTGCCACC ACAACCATTG CTCCACGATT GTCATTTGAT CCCCCATGTA
TAGCCACCCC AACATGCCTT TATTCCCGTC ACATTGGTTA GTTTCCCACT GGATCTACCT CCACTGGAAT GTCATGCACT
CTCAGGAGGT GGTGACTGAC GTTGCAAAAT CTCCTTCACA TTTTGTATTC ATCTTATTGT CCTCTACTTA GATCTGTGGT
GCTCTCTTCC ATTCGACCTC TCCTTCAATT GTCCCTTTGA AAGGTTCCTT TTAGTTTTTT GTTTTGGTAC CCATTGTGAG
CTTGGGCTAG ACCTGCACCA TCAGATGGTT CCAAAAACAT TTTGAGTCAA AGTTTCCTAC TCTCAATCTA TTGTGTGTAC
TCCTCTTCAC TTAAAGTTGG TTAGGAGGGG AGCAAAGCAA CTATGATACA TAAGCTTTGC TTATCAAATG ACGCACTGTC
CAGGAATCCT ATTATTGGGT TTGTCAGCTC TAATGAGAAG CTCACAGACA TTCTAACTAA ATCCCTAAGA GGACCTAAGA
TTCAGTTTAT ATACTCTAAG TTTGGTACAT ATGATCTATA TACTCCAACT TGAGGGAAAG TGTTGAAATG TAATCTTATT
TTAATAACAT TTTCTGTGTA CCCAGCTTTA GGGTTAGGGT TTTAAGCAAG TGTATTGCGT CTTTTTGTAT CCTATATATT
TGCATCAATA AGAAGCACGA CAGTGCAAGT AAATATGCTG TGTTTCTATC CATTCTATTT GTTCAAGTGT AGATAAAGGT
GATACTCTGC TAAAGTAGTC CATCAAACAT TTCATACTAC TTAGTGAGAC TTAGACACTC CATAATATCC AAGACGCCAT
TAGATCAAAT TTAAATGCTA ATATGGTTAG TTTCCTTATT GATATTGATA GGATATAATG TGTATGATAG GAGGAAACAG
ATTATGAAGT AGTTGTTAGT TAGGTTGTTA GGGATAGTGA GGTTTCCTTT ATATAGTTGG GGGGTCCTGG TATGCTAGGG
ACTTTTGTAT AATTTTGTAG ATTGAGTTTT TGCTCTTTGT GAAGGGGAAA CCCTTGGAGG AGAGAGTGCT CTCCTATTTT
TTTGTGTTCT TTTCAGTCTA TATAATAAAG AATATTACTC TTCCTCTTTT CATTTCTGGG TTTGTAACAG ATATAGAGAT
CCATTGTTGG ATATTGTGTA TTTATTGGAG TTAATTTGGT ATGTTGGGAA AGTAAAACAT AATGGTGTCA TGTTAAGTGT
TGGAGTAGAT ATGAAGTGAT AGCATAGCTT TGGCTACTTG TGAATTCATT TGGTTCATTG TACATACTAG ATGAGTCAGT
TGTTTTTATT GGTGAAAAGA AGCTCATCAC AGTGCTTGTT CCTTGACCAG TTTAGTTAGC AGCTGTTTGC TCATTCATCT
TGTAGAGCTG TCAAAGTTTG CTTGGCATCG CCATTATATT TCTTCTTCAC CACCTTATAT CCTTTGTCAT TGCTTTTAGC
AGGTTTTGGT GGAGTTGATT TAAGATGAGT ATTAGAGGTT AGTTAATTGA AGCCCCTATA CATAAAGGTT CAAGCAATCA
CTTTGTACTC ACTCTCATCA TCAATATTAT CCCATTTCAC TTTATTACAC TTTTGTTCAA ATTCTCTCTT CTCTGTTTGA
AACCATGTTT ACTAACAATG AGAAAGTGAG GAGTTCGCCG CAAGAGGTAG AACATGAATG GATTGAAGAC TTGGACAAAT
AATGGAAGGC CATCATAGCT TGGTTACTCA AAGTTAACCA TTTAATGTCT ATTATATCAA AATCATTTTT TTATTGATTT
TTTGCAGTGT GCCATTGTTT GTTAAAGACA TTTTTTGTAA ACAGTTTGAG GATCCCTTCA AAGCCAATTT TTTGAGGGAA
GAGAATCAAA ACATTTAAGT ACTCCACTGA GCATTTCATA CTTCTTGATG TTGGGCTTAG GTACTCCATG ATGCCCAAAT
CGGAATCATA CTCTGCTCTA TAACACTTAG TCTGTTTGTC TAGTACCTCT GCATGAGTAG CCTTTTCCTA AATATTGACA
ACCCACTCTT ATTTAATTTG ATTTGCCTTT GTGTGTGTAT ACGTGTCTCC CAGTGTCCTA TATTTTAGAC ATTGGCGTTT
GAGATTTGTA GTCTTGTAAT GTTGGATATG ATACTTAAGC ATTTCATAGT ATCCAAGTCC CCATCAGTAT GTTGATTCCC
ATCAGTTGGG AATAAAGTTT GTATGTAACT GTTTTTTCCC TTTACACGCC ACTTTCACGA AAGGATTTCT AACAAAATGT
AGTTGTTAAC ATATTATTTA TTTTTTAAAT ACTAAGGAAT GTCATTCCCA TCATTATGTT CCTGGGATCT TATTCCCAAA
AGTAAAATTT GATAACCTGA AACACAATTC CTGTGTTTTC CTAATATCAA TGTGATCATC TAAGTGTACA CATGATATTT
CTCTTCTCTC TCGTGTCAAA AACTTCACTT TAAGGTCATA TTAATTTATA AGGCTGAGTC TTGGTGTCAG GAACTTTTGT
GAATTAATGT TACAACTGAA CACAGGTTTC TGATGCAATT GTCTATGGAA TAACTGGCTA TTTTGTCTTC CTTATATGTA
TGTGATAAGG TGGTGGAGTC GGAAATAGCT TTTGTTATAC AAGAGCTCTA GGGCCTAAAC TTGGCCCGTT TAGAACTTAT
AAGCTTAGGT TAGCCTGAAA ACTTAAAAAC GTACGTTGTG GTAAGACTTT TTTAATAGGT AAATAGCCTA ATTCTAAATA
GGTTAATGGG CCTAAATTTA TACCTGATGT AGTTTGGTGA ACTTTACCCT TTAAACATGT CAAGTTATAA CTTCAAAAAA
TTTCTGTAAA GATTTAATAG CATAGTATTT ATGATTTAAG GATGTCAGCG AGTTAGGCCT TACAGCTTTT TAACTAAATA
GATTTTTTGT GAAAGCCTAA TCTGGAAAAA CTTGTGGTAA GTTAGCCTTT ATGGTTTAGG CTTGACTCGG TTTAGAGTAT
AAAATGCCGC AGAAAGAACA TATATTCTCC TAATTTGTCT TAAATGTATT TTCTACATCT TGGCAAAAGA ACATGCTGGT
AAGAAATTCT TTTGTAACAA ATAATAATGA TTTTTTTCTT ATTATTTAGG GTTTCTAAAG GCGTGAGAGA TCTACCTGGC
AATTTTCAGT CTGCTACTAG TAATGTGCCT TCTGGCAAAG CACTTGTATA TTTTGGTTTG CTTCTGGCAA GTGGAGTCTT
CTTTGTTTTC ATAGCATTTA CATTATTCCT GCCCGTCATG GTGGTTATGC CCCAAAAGTT TGCTATATGC TTTACACTTG
GCTGTGGATT TATTATTGGA TCATTCTTTG CTCTCAAGGG TCCAAAAAAT CAGCTTACTC ACATGATGTC AAGGGAGGTA
ACTTGCTAGA ATTTCATTTC CTATTGCCTG CATTATGATA AGAAAACTTG ACCTGCTGTT ATGTTGCTTC AATGAATTTG
TTTGGTCTCT TTGATTCCCG CTTTGCTGCT TCTTCCTTAC AGTCCCTGTT ATAATTGTTT TTCAGAGGCT CCCTTTCACA
TTGGCTTTTC TAGGCAGTAT GATTGGTACC ATATATGTAT CAATGGTGCT TCATAGCTAC ATCCTCTCTG TGGTATTCTC
TGTAGTGCAG GTATCACCTT CACGTATCCT TAAAAATGCT TCCTTGTAGC TTAGCCATGC CCATTCCCCA AGGCCCTTGT
GTTATTGTTT TGATTTGCTA TTGATCTAAG GTATTATGCT AAAGGTTTTT TGACTTCTAT TTTATTGAAT TTATTATAAC
AATTAGGAAC GCTTCTTTCA ATCTAGCAAA ACCGATATAA ATTTAGGAAC TGCTATTTAC ACTCTTGATA GTGTGCTTTA
TGTGATGTGT GAGTTGCTGG TGTGTGGAGA TAGGTCATCT GTACAGATTT TTTTTTTATT CTTCTGTCAT GTTTCTTTAT
AACTGTATAT GTCTTTACAT TAAAAATGAA ATTTTGACTT TACTTGCAGG TTCTCTCACT TGGCTATTAT TCTATTTCAT
ACTTTCCTGG TGGATCTGCT GGAATGAAGT TTCTAACTTC TGCTCTTACT TCTTCAATAA TGAAATGTTT TGGGCGGTGA
CCAATTTTTT GGTTGACAGT TGAGTTGAGT TCGGACCAGT GTCTATAGAG TAGTTGACTT GTAAATTTAT CTATCTGCTG
AAGAGGCCTA AGAATATTAC TGGATTGAAG CATCATCTAA CAATTTCCTA GGGTTCAACG TTTATTGCCA CTGCCCTATC
TGAATGGGAA AAAAAAAACT GATTTGCCTC TTCGCCTCAT GTTTGTGAAA AACAAAATAA CACTGTCTGA TTGATGAAGT
TAATTCTACC TGTGTTGCTC CCTTTTACAG TTGGAATTTG AAATAATCTT TGTTTGTTTG CGA

>Vigan.05G195800.01
AGGTATTGTA GCAATCGAGT GGTGATTTCA ACAATAGAGA GCAGAAGCAG CTATTCAATT CTCAACAACC GGAAGCACTC
AGCACACAAC AGATAAATCC ACACATCAAA TCGCAAATCC TAATTAATTC CATTTCCCCC TTTTCTCCCT CCAAGCAATC
ATTCGTAGTT GGAATTGGTG ACCAAAATGC AGGGGTGGTT CTCGGCACCG AGCGGTGGTG AGGAGGAGGC GAAGCCCTCC
TCGTCGTTGC TTGCCGATTG GAACTCCTAT GCCTCTAATC AATCCTCCCA GGACAGCTCC AGTTTGGGTC TTTCCTTCGA
TCTCGAATCC GCCGTCAGGT CGGCCAATGA CACCGTTTCC GGCACCTTCA GCGTGGTTTC TAAAGGCGTG AGAGATCTAC
CTGGCAATTT TCAGTCTGCT ACTAGTAATG TGCCTTCTGG CAAAGCACTT GTATATTTTG GTTTGCTTCT GGCAAGTGGA
GTCTTCTTTG TTTTCATAGC ATTTACATTA TTCCTGCCCG TCATGGTGGT TATGCCCCAA AAGTTTGCTA TATGCTTTAC
ACTTGGCTGT GGATTTATTA TTGGATCATT CTTTGCTCTC AAGGGTCCAA AAAATCAGCT TACTCACATG ATGTCAAGGG
AGAGGCTCCC TTTCACATTG GCTTTTCTAG GCAGTATGAT TGGTACCATA TATGTATCAA TGGTGCTTCA TAGCTACATC
CTCTCTGTGG TATTCTCTGT AGTGCAGGTT CTCTCACTTG GCTATTATTC TATTTCATAC TTTCCTGGTG GATCTGCTGG
AATGAAGTTT CTAACTTCTG CTCTTACTTC TTCAATAATG AAATGTTTTG GGCGGTGACC AATTTTTTGG TTGACAGTTG
AGTTGAGTTC GGACCAGTGT CTATAGAGTA GTTGACTTGT AAATTTATCT ATCTGCTGAA GAGGCCTAAG AATATTACTG
GATTGAAGCA TCATCTAACA ATTTCCTAGG GTTCAACGTT TATTGCCACT GCCCTATCTG AATGGGAAAA AAAAAACTGA
TTTGCCTCTT CGCCTCATGT TTGTGAAAAA CAAAATAACA CTGTCTGATT GATGAAGTTA ATTCTACCTG TGTTGCTCCC
TTTTACAGTT GGAATTTGAA ATAATCTTTG TTTGTTTGCG A

>Vigan.05G195800.01
ATGCAGGGGT GGTTCTCGGC ACCGAGCGGT GGTGAGGAGG AGGCGAAGCC CTCCTCGTCG TTGCTTGCCG ATTGGAACTC
CTATGCCTCT AATCAATCCT CCCAGGACAG CTCCAGTTTG GGTCTTTCCT TCGATCTCGA ATCCGCCGTC AGGTCGGCCA
ATGACACCGT TTCCGGCACC TTCAGCGTGG TTTCTAAAGG CGTGAGAGAT CTACCTGGCA ATTTTCAGTC TGCTACTAGT
AATGTGCCTT CTGGCAAAGC ACTTGTATAT TTTGGTTTGC TTCTGGCAAG TGGAGTCTTC TTTGTTTTCA TAGCATTTAC
ATTATTCCTG CCCGTCATGG TGGTTATGCC CCAAAAGTTT GCTATATGCT TTACACTTGG CTGTGGATTT ATTATTGGAT
CATTCTTTGC TCTCAAGGGT CCAAAAAATC AGCTTACTCA CATGATGTCA AGGGAGAGGC TCCCTTTCAC ATTGGCTTTT
CTAGGCAGTA TGATTGGTAC CATATATGTA TCAATGGTGC TTCATAGCTA CATCCTCTCT GTGGTATTCT CTGTAGTGCA
GGTTCTCTCA CTTGGCTATT ATTCTATTTC ATACTTTCCT GGTGGATCTG CTGGAATGAA GTTTCTAACT TCTGCTCTTA
CTTCTTCAAT AATGAAATGT TTTGGGCGGT GA

>Vigan.05G195800.01
MQGWFSAPSG GEEEAKPSSS LLADWNSYAS NQSSQDSSSL GLSFDLESAV RSANDTVSGT FSVVSKGVRD LPGNFQSATS
NVPSGKALVY FGLLLASGVF FVFIAFTLFL PVMVVMPQKF AICFTLGCGF IIGSFFALKG PKNQLTHMMS RERLPFTLAF
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