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Vigan.04G078000.01

Basic Information:
Name: Vigan.04G078000.01
Multiple alignment
Variant Information
Position: Chr04:7562623..7566141 (- strand)
Length: 3519
Functional Information:
Description: Similar to uncharacterized LOC101221288. [XP_004171875.1, Cucumis sativus]
InterPro: HAD-like domain (IPR023214)
Expression level (FPKM): Co,Em,Fl,Le,No,Po,Ro,St:0.36,0.00,1.24,44.76,0.03,0.46,0.27,1.24
Automatic updates:
Name: NM_001289392 NCBI(nuccore)
Organism: Glycine max
Description: Glycine max uncharacterized LOC100809469 (LOC100809469), mRNA.
PubMed ID: -
Status: Known Variant
Structure :
Position: Chr04:7562623..7562788 (- strand)
Length: 166
Type: three_prime_UTR
Position: Chr04:7562789..7562889 (- strand)
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Type: CDS
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Type: CDS
Position: Chr04:7566033..7566141 (- strand)
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Type: five_prime_UTR

>Vigan.04G078000.01 class=Sequence position=Chr04:7562623..7566141 (- strand)
GTTGGTATCA TAGAATTCAA TCCTGTTTGG ATGGTGGGTA ATTGCATAAC AAGAGTACAA TATAATAATA TTCAGATAAG
TTTAGTAACG TTGGAAGGAA GACAGGGAAA TGGGTCACCT CTATGCTTTG GACTTTGATG GAGTTATATG TGACAGTTGT
GGGGAGACTG CAATCTCTGC TCTCAAGGTT CATTCTATCA CCCTTTATCT CAAATGGAAG AGGAAAACAA CACAAAATAA
TTGAAGTATC TGATGATCAC TTTTAGTCTA TGTATGGTTT TGGTTTCAAA ACTAAGCTGT GATTACTTTG TTGATAATTT
GTAGGCTGCC AAGTTGAGAT GGCCTTCCTT GTTTGATGGT GTGGATTCAG CCATAGAAGA TTGGATTGTT GATCAGATGA
TTACAGTAAA TAATTTATGG CTGGTTTTGT TTTGTGCTGT TAGTTATTCC GTTTTTTCTT TAAATTTTGA GAATGTTTGG
ATAAAGAACG CAATTAAGTA CTTGATCATA ATATCTTGTA AAATGATAAT TTCTTCATAA GTTTGACTGT AAATTTTACT
GAATAAGTTG AAAAGAACTA GTAGGAAGGT CAGATACCAC TTCTTTAAGT TCAGATAAAC TTTTTCAAAA ACACATTTTA
ACTATGAGAA TGATGTTTTG GGAATCCATC AACCACTTTG ACTATATAGG TGCGGAAAGA CTATGGAAAA GAAAACAAGA
AACAAGATTG AATTTAGTTG AGGAAAACTA TTAACATTCA TGATAATGTT TATGCTTGAA TTTGTCTTAG GAGGTATTTG
GATGAATTTA TGCATAGATG TTCAGATAAA GTATTAACCA TTTGCTAACT GCTACTTGGA TGCTTTAATG ATGATGTTAA
CTCCAAACAT GAAAAATGAA AATTCCAATC AAAATATCAT AAATCGCAAT ACCTTAAGGA CTGGTTGTAG ACGTGAAATA
GAATTTGGCT CCTTGTACAT AAAAAGATTG GAGAGCATTT TTTTTTACAT TTTCAAGTGG TTTCTCTTTG TTATTATTGT
GCTTAATGAC CATTTTCAGT TTTTGTGATA TAAGTAATTT CTTTTTAAGA TTAAAAATGT TTTTAATTCT TGAACTTTCA
TAAGAAATTG AAATTTATTT TTATTTGAAA CTTTGATATA TTTTGATTTT GATACATTTT TCTCTCTAAA CTTTAAAAAT
GAATAGATAT AATTCTTTTA ATCCAATTAT GTTAAATATT TTTATATGTC AAATGTTTTT CCTAGTTGAC ATTAAAACGA
AAATATATCA AACAGATTAA ACAACTCAAA TGTTATCATA AAACACATAT AATATATTAA AAAAATTTAT CATAATTAAG
TTTAAAAGAC TATATCTATT ATTTTTAAAA TTTGAGGATC AAAATGTATT AAAATTTTAA ATATAAACGA ATTTTAATTG
CGTATCAAAA TTCAATGACT AAAAACATAT TTAATAATTC TTTTCAATGA ATGTGTATTT ACACGACTAC ATACCATCTT
AATATTTTTA GTTTTGTGCC ACTCACTTGT TTTTAGGATA AGGCTCATAT TTGCTTCAAT CTAAAGATTT GCATTTCAGT
TAGAAATAAA TATGAATGTT TGTTAATGTA TGAACTTGCA TAATTGCATT TTCAAGACAA CTGCTATGTA TGAAATTCTA
GTTTGATTAT TTTTTTTTAC ACATGAGATG TAAATATGGA ATGGAAGTTT TTCATGTCAG GTACGTCCAG TTGTTGAAAC
TGGATATGAA ACTCTTCTAC TTGTAAGGTT GTTGCTTGAG ACTAGGGTTC CTTCCATCAG GAAGTCTTCG GTTAGTATAT
AAAGCCTACC ATTTTATTTA TGTTATTACT TTTGGCGCAA ACCTTCAGCG TTGAGTTTTT AATTTATTTT TTAATAAATT
GATAGTGTAA AAAGTATTTG TGATTAGTCA ATCAGAAATA ATGATAAATA TGACTTTTAA ATAGTTTTGT AAAAATCAAT
AAATTTATCA TATGTGATCA TTTTTATTGA ATAACAGTGA AACCTTTTTA TATATAATCA GTGTATAAAC TATTTTCGCT
TATTAACAAG TGGAAGTCTT TTATCAGATT CTAAGGAACT TTTGTCATCG TCTATGATGA TGCCATTTTA ACTGATGTCA
TAGTTCTCTG AAAGGTTTCA AAGGGGCTTA CAGTTGAGGA TATACTGGAG AATTGGTTCA AATTGAAACC TGTTATTATG
GAAGAATGGA ATGAGAATAG AGAAGATCTG GTAGACCTTT TTGGGAAAGT CAGAGATGAA TGGCTGGAGA GGGATTTCAC
TGGTTGGATT GGAGCAAACA GGTAGTCCAA TTAAATGTCA AGAAATAGGA TAACTTTTCT TAGAACTTAC ATCTGATGAA
ATGAATCAAG AAAAGCTTAA AGTACAAAAA GAGTTCTGAT AGCATTGAGT ATAGATGTTC AAATTTTAGA AATGTTTCTG
CAAGATGTGT TGAACTTTTG CCTGCTAATT ATGTCTTGGT TGCTAATTTG TGGGTGATTT ACCTCTAGAC TATATCCTGG
TGTTGCTGAT GCATTGAGAT TTGCAAGCTC AAAAGTGTAC ATTGTCACCA CAAAACAGGT CATTACAATT TGATATTGCC
ATGCCCTGAT CACTTTATAT TCTCTACTTA CTTCTACCCC TGATCTGTTT TCAGAGCCGC TTTGCCGATG CTTTACTAAG
AGAGCTTGCT GGAGTCACTA TACCACCAGA ACGATTATAT GGTTTAGGAA CTGGGTTAGT CTTAAATTTT GATATATTTG
GTCCAACTGA AGCTCTGTGT GGTGCTCTAT ATCAGCACTT TATAATGTTT TTTATCTATG AATTGCTTCA TTCCATTGAC
AAATTTGTTT TTCCCAAACT AATTACAGTC CCAAGGTAAA AGTGTTAAAG AAGCTTCAGG AAATGGCAGA ACACAAAGGG
CTGACACTAC AGTTAAGATT TTGTGCTTCC AGGGGTTATT TTATTTAATA GTATGGTTCA GGGGAAATTG ACCGAAGTTA
ATTTTAAACA GCTTTGTGGA AGATAGGCTT GCAACCCTAA AGAATGTCAT CAAAGAACCC GAGTTGGATA ACTGGAATTT
GTATCTGGGT AGAACTCTTC TCTCTATCCA ATTGTAATTT CTGCTATCTA TTTGTTTCTT TCAGTTTCTA TGTTTTGCAT
TATTTGTATT TCTTAGAGTT GTATATCTGC TATGTTTGAC TGTTTGGATT AGTGAATTGG GGGTTCAACA CTCAAAAAGA
GAGAGAAGAA GCAGCAGCCA ACCCTAGGAT TCAAGTTCTT GAGCTTTTTG ACTTCAGTAG CAAGCTGGTA TAGTAGTCTG
ACTTCGTTAA ATTGTCAAAC ATTGGATTAA ATATTTACTA CCATTTCATT CCTTTATGAG CAACGACAAA TTGCTACACT
TGAAAATTCA TGAGGTATTT TTAACTAGTT TCCTTTCTTA TTAAACTGCA TCACTCGTGT CCTATAAGTG AGTTGGAAG

>Vigan.04G078000.01
GTTGGTATCA TAGAATTCAA TCCTGTTTGG ATGGTGGGTA ATTGCATAAC AAGAGTACAA TATAATAATA TTCAGATAAG
TTTAGTAACG TTGGAAGGAA GACAGGGAAA TGGGTCACCT CTATGCTTTG GACTTTGATG GAGTTATATG TGACAGTTGT
GGGGAGACTG CAATCTCTGC TCTCAAGGCT GCCAAGTTGA GATGGCCTTC CTTGTTTGAT GGTGTGGATT CAGCCATAGA
AGATTGGATT GTTGATCAGA TGATTACAGT ACGTCCAGTT GTTGAAACTG GATATGAAAC TCTTCTACTT GTAAGGTTGT
TGCTTGAGAC TAGGGTTCCT TCCATCAGGA AGTCTTCGGT TTCAAAGGGG CTTACAGTTG AGGATATACT GGAGAATTGG
TTCAAATTGA AACCTGTTAT TATGGAAGAA TGGAATGAGA ATAGAGAAGA TCTGGTAGAC CTTTTTGGGA AAGTCAGAGA
TGAATGGCTG GAGAGGGATT TCACTGGTTG GATTGGAGCA AACAGACTAT ATCCTGGTGT TGCTGATGCA TTGAGATTTG
CAAGCTCAAA AGTGTACATT GTCACCACAA AACAGAGCCG CTTTGCCGAT GCTTTACTAA GAGAGCTTGC TGGAGTCACT
ATACCACCAG AACGATTATA TGGTTTAGGA ACTGGTCCCA AGGTAAAAGT GTTAAAGAAG CTTCAGGAAA TGGCAGAACA
CAAAGGGCTG ACACTACACT TTGTGGAAGA TAGGCTTGCA ACCCTAAAGA ATGTCATCAA AGAACCCGAG TTGGATAACT
GGAATTTGTA TCTGGTGAAT TGGGGGTTCA ACACTCAAAA AGAGAGAGAA GAAGCAGCAG CCAACCCTAG GATTCAAGTT
CTTGAGCTTT TTGACTTCAG TAGCAAGCTG GTATAGTAGT CTGACTTCGT TAAATTGTCA AACATTGGAT TAAATATTTA
CTACCATTTC ATTCCTTTAT GAGCAACGAC AAATTGCTAC ACTTGAAAAT TCATGAGGTA TTTTTAACTA GTTTCCTTTC
TTATTAAACT GCATCACTCG TGTCCTATAA GTGAGTTGGA AG

>Vigan.04G078000.01
ATGGGTCACC TCTATGCTTT GGACTTTGAT GGAGTTATAT GTGACAGTTG TGGGGAGACT GCAATCTCTG CTCTCAAGGC
TGCCAAGTTG AGATGGCCTT CCTTGTTTGA TGGTGTGGAT TCAGCCATAG AAGATTGGAT TGTTGATCAG ATGATTACAG
TACGTCCAGT TGTTGAAACT GGATATGAAA CTCTTCTACT TGTAAGGTTG TTGCTTGAGA CTAGGGTTCC TTCCATCAGG
AAGTCTTCGG TTTCAAAGGG GCTTACAGTT GAGGATATAC TGGAGAATTG GTTCAAATTG AAACCTGTTA TTATGGAAGA
ATGGAATGAG AATAGAGAAG ATCTGGTAGA CCTTTTTGGG AAAGTCAGAG ATGAATGGCT GGAGAGGGAT TTCACTGGTT
GGATTGGAGC AAACAGACTA TATCCTGGTG TTGCTGATGC ATTGAGATTT GCAAGCTCAA AAGTGTACAT TGTCACCACA
AAACAGAGCC GCTTTGCCGA TGCTTTACTA AGAGAGCTTG CTGGAGTCAC TATACCACCA GAACGATTAT ATGGTTTAGG
AACTGGTCCC AAGGTAAAAG TGTTAAAGAA GCTTCAGGAA ATGGCAGAAC ACAAAGGGCT GACACTACAC TTTGTGGAAG
ATAGGCTTGC AACCCTAAAG AATGTCATCA AAGAACCCGA GTTGGATAAC TGGAATTTGT ATCTGGTGAA TTGGGGGTTC
AACACTCAAA AAGAGAGAGA AGAAGCAGCA GCCAACCCTA GGATTCAAGT TCTTGAGCTT TTTGACTTCA GTAGCAAGCT
GGTATAG

>Vigan.04G078000.01
MGHLYALDFD GVICDSCGET AISALKAAKL RWPSLFDGVD SAIEDWIVDQ MITVRPVVET GYETLLLVRL LLETRVPSIR
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