Variant information

Chr11:37090995 - 37093456

Filter



 [SNPs] [Indels]

SNPs

PositionRef.Alt.DepthScoreFreq. Of Alt.EffectSpecies
37091549AC351479.771.00DOWNSTREAM(|2549||None|Vigan.11G248400.01), INTRON(|||None|Vigan.11G248300.01), UPSTREAM(|1509||None|Vigan.11G248200.01)Vigna nepalensis
37091560GC371624.771.00DOWNSTREAM(|2538||None|Vigan.11G248400.01), INTRON(|||None|Vigan.11G248300.01), UPSTREAM(|1520||None|Vigan.11G248200.01)Vigna nepalensis
37091586TC401574.771.00DOWNSTREAM(|2512||None|Vigan.11G248400.01), INTRON(|||None|Vigan.11G248300.01), UPSTREAM(|1546||None|Vigan.11G248200.01)Vigna nepalensis
37091813GA652564.771.00DOWNSTREAM(|2285||None|Vigan.11G248400.01), INTRON(|||None|Vigan.11G248300.01), UPSTREAM(|1773||None|Vigan.11G248200.01)Vigna nepalensis
37091904GT381477.771.00DOWNSTREAM(|2194||None|Vigan.11G248400.01), INTRON(|||None|Vigan.11G248300.01), UPSTREAM(|1864||None|Vigan.11G248200.01)Vigna nepalensis
37091983TC481874.771.00DOWNSTREAM(|2115||None|Vigan.11G248400.01), SYNONYMOUS_CODING(SILENT|gcT/gcC|A150|None|Vigan.11G248300.01), UPSTREAM(|1943||None|Vigan.11G248200.01)Vigna nepalensis
37092061CT672640.771.00DOWNSTREAM(|2037||None|Vigan.11G248400.01), INTRON(|||None|Vigan.11G248300.01), UPSTREAM(|2021||None|Vigan.11G248200.01)Vigna nepalensis
37092181AG602331.771.00DOWNSTREAM(|1917||None|Vigan.11G248400.01), INTRON(|||None|Vigan.11G248300.01), UPSTREAM(|2141||None|Vigan.11G248200.01)Vigna nepalensis
37092240GA612344.771.00DOWNSTREAM(|1858||None|Vigan.11G248400.01), INTRON(|||None|Vigan.11G248300.01), UPSTREAM(|2200||None|Vigan.11G248200.01)Vigna nepalensis
37092285TC662593.771.00DOWNSTREAM(|1813||None|Vigan.11G248400.01), INTRON(|||None|Vigan.11G248300.01), UPSTREAM(|2245||None|Vigan.11G248200.01)Vigna nepalensis
37092318CT572508.771.00DOWNSTREAM(|1780||None|Vigan.11G248400.01), INTRON(|||None|Vigan.11G248300.01), UPSTREAM(|2278||None|Vigan.11G248200.01)Vigna nepalensis
37092335TC602668.771.00DOWNSTREAM(|1763||None|Vigan.11G248400.01), INTRON(|||None|Vigan.11G248300.01), UPSTREAM(|2295||None|Vigan.11G248200.01)Vigna nepalensis
37092480TC723054.771.00DOWNSTREAM(|1618||None|Vigan.11G248400.01), INTRON(|||None|Vigan.11G248300.01), UPSTREAM(|2440||None|Vigan.11G248200.01)Vigna nepalensis
37092526GA662682.771.00DOWNSTREAM(|1572||None|Vigan.11G248400.01), INTRON(|||None|Vigan.11G248300.01), UPSTREAM(|2486||None|Vigan.11G248200.01)Vigna nepalensis
37092725TA491913.771.00DOWNSTREAM(|1373||None|Vigan.11G248400.01), SYNONYMOUS_CODING(SILENT|ccT/ccA|P174|None|Vigan.11G248300.01), UPSTREAM(|2685||None|Vigan.11G248200.01)Vigna nepalensis
37093308GA743293.771.00DOWNSTREAM(|790||None|Vigan.11G248400.01), UPSTREAM(|3268||None|Vigan.11G248200.01), UTR_3_PRIME(|484||None|Vigan.11G248300.01)Vigna nepalensis
37093309TC733293.771.00DOWNSTREAM(|789||None|Vigan.11G248400.01), UPSTREAM(|3269||None|Vigan.11G248200.01), UTR_3_PRIME(|485||None|Vigan.11G248300.01)Vigna nepalensis

Indels

PositionRef.Alt.DepthScoreFreq. Of Alt.EffectSpecies
37090996GCGTATG391697.731.00DOWNSTREAM(|3101||None|Vigan.11G248400.01), UPSTREAM(|957||None|Vigan.11G248200.01), UTR_5_PRIME(|91||None|Vigan.11G248300.01)Vigna nepalensis
37092083CCTT743291.731.00DOWNSTREAM(|2014||None|Vigan.11G248400.01), INTRON(|||None|Vigan.11G248300.01), UPSTREAM(|2044||None|Vigan.11G248200.01)Vigna nepalensis
37092475TTTAT703045.731.00DOWNSTREAM(|1622||None|Vigan.11G248400.01), INTRON(|||None|Vigan.11G248300.01), UPSTREAM(|2436||None|Vigan.11G248200.01)Vigna nepalensis
37092671CTC501346.730.98DOWNSTREAM(|1426||None|Vigan.11G248400.01), INTRON(|||None|Vigan.11G248300.01), UPSTREAM(|2632||None|Vigan.11G248200.01)Vigna nepalensis
37093203CTTTCTCTCTTGCTTCTC572424.731.00DOWNSTREAM(|894||None|Vigan.11G248400.01), UPSTREAM(|3164||None|Vigan.11G248200.01), UTR_3_PRIME(|380||None|Vigan.11G248300.01)Vigna nepalensis
37093329GGTT642943.731.00DOWNSTREAM(|768||None|Vigan.11G248400.01), UPSTREAM(|3290||None|Vigan.11G248200.01), UTR_3_PRIME(|506||None|Vigan.11G248300.01)Vigna nepalensis