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Chr11:37065749 - 37069537

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 [SNPs] [Indels]

SNPs

PositionRef.Alt.DepthScoreFreq. Of Alt.EffectSpecies
37065974CG542081.771.00INTRON(|||None|Vigan.11G247900.01), UTR_3_PRIME(|1492||None|Vigan.11G248000.01)Vigna nepalensis
37066373AC471885.771.00UTR_3_PRIME(|1093||None|Vigan.11G248000.01), UTR_3_PRIME(|88||None|Vigan.11G247900.01)Vigna nepalensis
37066466GA461839.771.00UTR_3_PRIME(|1000||None|Vigan.11G248000.01), UTR_3_PRIME(|181||None|Vigan.11G247900.01)Vigna nepalensis
37066713AG582695.771.00UTR_3_PRIME(|428||None|Vigan.11G247900.01), UTR_3_PRIME(|753||None|Vigan.11G248000.01)Vigna nepalensis
37066721GA592657.771.00UTR_3_PRIME(|436||None|Vigan.11G247900.01), UTR_3_PRIME(|745||None|Vigan.11G248000.01)Vigna nepalensis
37066798TG451849.771.00UTR_3_PRIME(|513||None|Vigan.11G247900.01), UTR_3_PRIME(|668||None|Vigan.11G248000.01)Vigna nepalensis
37066826CT512097.771.00DOWNSTREAM(|6||None|Vigan.11G247900.01), UTR_3_PRIME(|640||None|Vigan.11G248000.01)Vigna nepalensis
37067267TC441756.771.00DOWNSTREAM(|447||None|Vigan.11G247900.01), UTR_3_PRIME(|199||None|Vigan.11G248000.01)Vigna nepalensis
37067675TA442007.771.00DOWNSTREAM(|855||None|Vigan.11G247900.01), NON_SYNONYMOUS_CODING(MISSENSE|Aca/Tca|T393S|None|Vigan.11G248000.01)Vigna nepalensis
37067682CG472067.771.00DOWNSTREAM(|862||None|Vigan.11G247900.01), NON_SYNONYMOUS_CODING(MISSENSE|aaG/aaC|K390N|None|Vigan.11G248000.01)Vigna nepalensis
37067931GA672557.771.00DOWNSTREAM(|1111||None|Vigan.11G247900.01), SYNONYMOUS_CODING(SILENT|gtC/gtT|V307|None|Vigan.11G248000.01)Vigna nepalensis
37068181TG441988.771.00DOWNSTREAM(|1361||None|Vigan.11G247900.01), NON_SYNONYMOUS_CODING(MISSENSE|tAc/tCc|Y224S|None|Vigan.11G248000.01)Vigna nepalensis
37068182AT451988.771.00DOWNSTREAM(|1362||None|Vigan.11G247900.01), NON_SYNONYMOUS_CODING(MISSENSE|Tac/Aac|Y224N|None|Vigan.11G248000.01)Vigna nepalensis
37068307TG542102.771.00DOWNSTREAM(|1487||None|Vigan.11G247900.01), NON_SYNONYMOUS_CODING(MISSENSE|cAa/cCa|Q182P|None|Vigan.11G248000.01)Vigna nepalensis
37068420AG582189.771.00DOWNSTREAM(|1600||None|Vigan.11G247900.01), INTRON(|||None|Vigan.11G248000.01)Vigna nepalensis
37068515CT612453.771.00DOWNSTREAM(|1695||None|Vigan.11G247900.01), INTRON(|||None|Vigan.11G248000.01)Vigna nepalensis
37068578TG652885.771.00DOWNSTREAM(|1758||None|Vigan.11G247900.01), INTRON(|||None|Vigan.11G248000.01)Vigna nepalensis
37068579AT652885.771.00DOWNSTREAM(|1759||None|Vigan.11G247900.01), INTRON(|||None|Vigan.11G248000.01)Vigna nepalensis
37068650TC562419.771.00DOWNSTREAM(|1830||None|Vigan.11G247900.01), INTRON(|||None|Vigan.11G248000.01)Vigna nepalensis
37068675GT562394.771.00DOWNSTREAM(|1855||None|Vigan.11G247900.01), INTRON(|||None|Vigan.11G248000.01)Vigna nepalensis
37068735GA431942.771.00DOWNSTREAM(|1915||None|Vigan.11G247900.01), INTRON(|||None|Vigan.11G248000.01)Vigna nepalensis
37068739TA411906.771.00DOWNSTREAM(|1919||None|Vigan.11G247900.01), INTRON(|||None|Vigan.11G248000.01)Vigna nepalensis
37068751GA482176.771.00DOWNSTREAM(|1931||None|Vigan.11G247900.01), INTRON(|||None|Vigan.11G248000.01)Vigna nepalensis
37068788AC472057.771.00DOWNSTREAM(|1968||None|Vigan.11G247900.01), INTRON(|||None|Vigan.11G248000.01)Vigna nepalensis
37068829CA532550.771.00DOWNSTREAM(|2009||None|Vigan.11G247900.01), INTRON(|||None|Vigan.11G248000.01)Vigna nepalensis
37068848AG512166.771.00DOWNSTREAM(|2028||None|Vigan.11G247900.01), INTRON(|||None|Vigan.11G248000.01)Vigna nepalensis
37068922CT532031.771.00DOWNSTREAM(|2102||None|Vigan.11G247900.01), SYNONYMOUS_CODING(SILENT|gcG/gcA|A139|None|Vigan.11G248000.01)Vigna nepalensis
37068965TG542072.771.00DOWNSTREAM(|2145||None|Vigan.11G247900.01), NON_SYNONYMOUS_CODING(MISSENSE|gAg/gCg|E125A|None|Vigan.11G248000.01)Vigna nepalensis
37069018GC462015.771.00DOWNSTREAM(|2198||None|Vigan.11G247900.01), SYNONYMOUS_CODING(SILENT|gtC/gtG|V107|None|Vigan.11G248000.01)Vigna nepalensis
37069025CA431902.771.00DOWNSTREAM(|2205||None|Vigan.11G247900.01), NON_SYNONYMOUS_CODING(MISSENSE|gGt/gTt|G105V|None|Vigan.11G248000.01)Vigna nepalensis
37069039GC401474.771.00DOWNSTREAM(|2219||None|Vigan.11G247900.01), SYNONYMOUS_CODING(SILENT|gcC/gcG|A100|None|Vigan.11G248000.01)Vigna nepalensis
37069075GA371358.771.00DOWNSTREAM(|2255||None|Vigan.11G247900.01), SYNONYMOUS_CODING(SILENT|gtC/gtT|V88|None|Vigan.11G248000.01)Vigna nepalensis
37069105CT421701.771.00DOWNSTREAM(|2285||None|Vigan.11G247900.01), SYNONYMOUS_CODING(SILENT|gaG/gaA|E78|None|Vigan.11G248000.01)Vigna nepalensis
37069266GA461934.771.00DOWNSTREAM(|2446||None|Vigan.11G247900.01), NON_SYNONYMOUS_CODING(MISSENSE|Cgg/Tgg|R25W|None|Vigan.11G248000.01)Vigna nepalensis
37069288CA502142.771.00DOWNSTREAM(|2468||None|Vigan.11G247900.01), SYNONYMOUS_CODING(SILENT|acG/acT|T17|None|Vigan.11G248000.01)Vigna nepalensis
37069349CG592665.771.00DOWNSTREAM(|2529||None|Vigan.11G247900.01), UTR_5_PRIME(|11||None|Vigan.11G248000.01)Vigna nepalensis
37069364AT673087.771.00DOWNSTREAM(|2544||None|Vigan.11G247900.01), UTR_5_PRIME(|26||None|Vigan.11G248000.01)Vigna nepalensis
37069373TA673071.771.00DOWNSTREAM(|2553||None|Vigan.11G247900.01), UTR_5_PRIME(|35||None|Vigan.11G248000.01)Vigna nepalensis

Indels

PositionRef.Alt.DepthScoreFreq. Of Alt.EffectSpecies
37066915TAT601867.731.00DOWNSTREAM(|96||None|Vigan.11G247900.01), UTR_3_PRIME(|550||None|Vigan.11G248000.01)Vigna nepalensis
37066981AAT612242.731.00DOWNSTREAM(|162||None|Vigan.11G247900.01), UTR_3_PRIME(|484||None|Vigan.11G248000.01)Vigna nepalensis
37068463GTACAGTATGATGCAAGTTTTCTTATTTTTATCAG642828.731.00DOWNSTREAM(|1644||None|Vigan.11G247900.01), INTRON(|||None|Vigan.11G248000.01)Vigna nepalensis
37068658ATA542484.731.00DOWNSTREAM(|1839||None|Vigan.11G247900.01), INTRON(|||None|Vigan.11G248000.01)Vigna nepalensis
37068737CTC392068.731.00DOWNSTREAM(|1918||None|Vigan.11G247900.01), INTRON(|||None|Vigan.11G248000.01)Vigna nepalensis
37068763GAG472302.731.00DOWNSTREAM(|1944||None|Vigan.11G247900.01), INTRON(|||None|Vigan.11G248000.01)Vigna nepalensis
37068819AAAAC512392.731.00DOWNSTREAM(|2000||None|Vigan.11G247900.01), INTRON(|||None|Vigan.11G248000.01)Vigna nepalensis
37069363AAT673015.731.00DOWNSTREAM(|2544||None|Vigan.11G247900.01), UTR_5_PRIME(|26||None|Vigan.11G248000.01)Vigna nepalensis
37069525CTGGTTTTATCACTTTGATATACGTTTACCAAAACAACAATGAAATTAATAATCAAACACTTTTTC652931.731.00DOWNSTREAM(|2706||None|Vigan.11G247900.01), INTERGENIC(||||), INTRAGENIC(|||None|), UPSTREAM(|0||None|Vigan.11G248000.01), UTR_5_PRIME(|188||None|Vigan.11G248000.01)Vigna nepalensis