Variant information

Chr11:36542383 - 36548287

Filter



 [SNPs] [Indels]

SNPs

PositionRef.Alt.DepthScoreFreq. Of Alt.EffectSpecies
36542498AG491890.771.00DOWNSTREAM(|2973||None|Vigan.11G241600.01), NON_SYNONYMOUS_CODING(MISSENSE|aAc/aGc|N32S|None|Vigan.11G241500.01)Vigna nepalensis
36542993TG421686.771.00DOWNSTREAM(|2478||None|Vigan.11G241600.01), INTRON(|||None|Vigan.11G241500.01)Vigna nepalensis
36543022AT472050.771.00DOWNSTREAM(|2449||None|Vigan.11G241600.01), INTRON(|||None|Vigan.11G241500.01)Vigna nepalensis
36543039GC512224.771.00DOWNSTREAM(|2432||None|Vigan.11G241600.01), INTRON(|||None|Vigan.11G241500.01)Vigna nepalensis
36543102AG512074.771.00DOWNSTREAM(|2369||None|Vigan.11G241600.01), INTRON(|||None|Vigan.11G241500.01)Vigna nepalensis
36543493AT461802.771.00DOWNSTREAM(|1978||None|Vigan.11G241600.01), INTRON(|||None|Vigan.11G241500.01)Vigna nepalensis
36543591GC441754.771.00DOWNSTREAM(|1880||None|Vigan.11G241600.01), NON_SYNONYMOUS_CODING(MISSENSE|Gga/Cga|G149R|None|Vigan.11G241500.01)Vigna nepalensis
36543636AG391578.771.00DOWNSTREAM(|1835||None|Vigan.11G241600.01), NON_SYNONYMOUS_CODING(MISSENSE|Aca/Gca|T164A|None|Vigan.11G241500.01)Vigna nepalensis
36543895GA572205.771.00DOWNSTREAM(|1576||None|Vigan.11G241600.01), INTRON(|||None|Vigan.11G241500.01), SPLICE_SITE_REGION(|||None|Vigan.11G241500.01)Vigna nepalensis
36544127GA632500.771.00DOWNSTREAM(|1344||None|Vigan.11G241600.01), INTRON(|||None|Vigan.11G241500.01)Vigna nepalensis
36544191TG441751.771.00DOWNSTREAM(|1280||None|Vigan.11G241600.01), INTRON(|||None|Vigan.11G241500.01)Vigna nepalensis
36545696GA612354.771.00INTRON(|||None|Vigan.11G241500.01), UTR_3_PRIME(|953||None|Vigan.11G241600.01)Vigna nepalensis
36545752GT562263.771.00INTRON(|||None|Vigan.11G241500.01), UTR_3_PRIME(|897||None|Vigan.11G241600.01)Vigna nepalensis
36545806GA612598.771.00INTRON(|||None|Vigan.11G241500.01), UTR_3_PRIME(|843||None|Vigan.11G241600.01)Vigna nepalensis
36546082GT612427.771.00UTR_3_PRIME(|113||None|Vigan.11G241500.01), UTR_3_PRIME(|567||None|Vigan.11G241600.01)Vigna nepalensis
36546101AC642851.771.00UTR_3_PRIME(|132||None|Vigan.11G241500.01), UTR_3_PRIME(|548||None|Vigan.11G241600.01)Vigna nepalensis
36546104TA642851.771.00UTR_3_PRIME(|135||None|Vigan.11G241500.01), UTR_3_PRIME(|545||None|Vigan.11G241600.01)Vigna nepalensis
36546429GA662515.771.00UTR_3_PRIME(|220||None|Vigan.11G241600.01), UTR_3_PRIME(|460||None|Vigan.11G241500.01)Vigna nepalensis
36546915CT522064.771.00NON_SYNONYMOUS_CODING(MISSENSE|Gga/Aga|G191R|None|Vigan.11G241600.01), UTR_3_PRIME(|946||None|Vigan.11G241500.01)Vigna nepalensis
36547149GT502030.771.00INTRON(|||None|Vigan.11G241600.01), UTR_3_PRIME(|1180||None|Vigan.11G241500.01)Vigna nepalensis
36547765AG471733.771.00INTRON(|||None|Vigan.11G241600.01), UTR_3_PRIME(|1796||None|Vigan.11G241500.01)Vigna nepalensis
36548236AG532078.771.00INTRON(|||None|Vigan.11G241600.01), UTR_3_PRIME(|2267||None|Vigan.11G241500.01)Vigna nepalensis

Indels

PositionRef.Alt.DepthScoreFreq. Of Alt.EffectSpecies
36543346TCT541982.731.00DOWNSTREAM(|2124||None|Vigan.11G241600.01), INTRON(|||None|Vigan.11G241500.01)Vigna nepalensis
36547832GGT461520.731.00INTRON(|||None|Vigan.11G241600.01), UTR_3_PRIME(|1864||None|Vigan.11G241500.01)Vigna nepalensis
36548009GTTG471753.731.00INTRON(|||None|Vigan.11G241600.01), UTR_3_PRIME(|2041||None|Vigan.11G241500.01)Vigna nepalensis