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Chr11:32619240 - 32622251

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 [SNPs] [Indels]

SNPs

PositionRef.Alt.DepthScoreFreq. Of Alt.EffectSpecies
32619261GT411919.771.00DOWNSTREAM(|4497||None|Vigan.11G200600.01), UTR_3_PRIME(|337||None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32619263CT441919.771.00DOWNSTREAM(|4495||None|Vigan.11G200600.01), UTR_3_PRIME(|335||None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32619995TA672664.771.00DOWNSTREAM(|3763||None|Vigan.11G200600.01), INTRON(|||None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32620090CT532173.771.00DOWNSTREAM(|3668||None|Vigan.11G200600.01), INTRON(|||None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32620202GC682704.771.00DOWNSTREAM(|3556||None|Vigan.11G200600.01), INTRON(|||None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32620327CG682733.771.00DOWNSTREAM(|3431||None|Vigan.11G200600.01), INTRON(|||None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32620506GT562481.771.00DOWNSTREAM(|3252||None|Vigan.11G200600.01), INTRON(|||None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32620508AC552481.771.00DOWNSTREAM(|3250||None|Vigan.11G200600.01), INTRON(|||None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32620528AG512085.771.00DOWNSTREAM(|3230||None|Vigan.11G200600.01), INTRON(|||None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32620545CT532122.771.00DOWNSTREAM(|3213||None|Vigan.11G200600.01), INTRON(|||None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32620771TG592523.771.00DOWNSTREAM(|2987||None|Vigan.11G200600.01), INTRON(|||None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32620777AG532446.771.00DOWNSTREAM(|2981||None|Vigan.11G200600.01), INTRON(|||None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32620819GA522264.771.00DOWNSTREAM(|2939||None|Vigan.11G200600.01), INTRON(|||None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32620849TC492096.771.00DOWNSTREAM(|2909||None|Vigan.11G200600.01), INTRON(|||None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32620868TC532400.771.00DOWNSTREAM(|2890||None|Vigan.11G200600.01), INTRON(|||None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32620887GA552513.771.00DOWNSTREAM(|2871||None|Vigan.11G200600.01), INTRON(|||None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32620930TC471967.771.00DOWNSTREAM(|2828||None|Vigan.11G200600.01), INTRON(|||None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32621017AG401534.771.00DOWNSTREAM(|2741||None|Vigan.11G200600.01), INTRON(|||None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32621239GA80765.770.30DOWNSTREAM(|2519||None|Vigan.11G200600.01), INTRON(|||None|Vigan.11G200500.01), SPLICE_SITE_REGION(|||None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32621241CA77765.770.27DOWNSTREAM(|2517||None|Vigan.11G200600.01), INTRON(|||None|Vigan.11G200500.01), SPLICE_SITE_REGION(|||None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32621272GA60143.770.13DOWNSTREAM(|2486||None|Vigan.11G200600.01), SYNONYMOUS_CODING(SILENT|ctC/ctT|L111|None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32621273AT59143.770.12DOWNSTREAM(|2485||None|Vigan.11G200600.01), NON_SYNONYMOUS_CODING(MISSENSE|cTc/cAc|L111H|None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32621335CT871456.770.46DOWNSTREAM(|2423||None|Vigan.11G200600.01), INTRON(|||None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32621346GA781372.770.47DOWNSTREAM(|2412||None|Vigan.11G200600.01), INTRON(|||None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32621362GA751100.770.41DOWNSTREAM(|2396||None|Vigan.11G200600.01), INTRON(|||None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32621373AT703072.771.00DOWNSTREAM(|2385||None|Vigan.11G200600.01), INTRON(|||None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32621383AC701193.770.44DOWNSTREAM(|2375||None|Vigan.11G200600.01), INTRON(|||None|Vigan.11G200500.01), SPLICE_SITE_REGION(|||None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32621394CT731056.770.40DOWNSTREAM(|2364||None|Vigan.11G200600.01), NON_SYNONYMOUS_CODING(MISSENSE|Gga/Aga|G102R|None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32621408GA681056.770.37DOWNSTREAM(|2350||None|Vigan.11G200600.01), NON_SYNONYMOUS_CODING(MISSENSE|aCt/aTt|T97I|None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32621413GC741182.770.42DOWNSTREAM(|2345||None|Vigan.11G200600.01), STOP_GAINED(NONSENSE|taC/taG|Y95*|None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32621429GT811164.770.40DOWNSTREAM(|2329||None|Vigan.11G200600.01), NON_SYNONYMOUS_CODING(MISSENSE|tCt/tAt|S90Y|None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32621432CT771074.770.36DOWNSTREAM(|2326||None|Vigan.11G200600.01), NON_SYNONYMOUS_CODING(MISSENSE|cGa/cAa|R89Q|None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32621433GA771032.770.36DOWNSTREAM(|2325||None|Vigan.11G200600.01), STOP_GAINED(NONSENSE|Cga/Tga|R89*|None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32621439AG791077.770.35DOWNSTREAM(|2319||None|Vigan.11G200600.01), SYNONYMOUS_CODING(SILENT|Ttg/Ctg|L87|None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32621450GA781173.770.40DOWNSTREAM(|2308||None|Vigan.11G200600.01), NON_SYNONYMOUS_CODING(MISSENSE|cCa/cTa|P83L|None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32621478TC781215.770.41DOWNSTREAM(|2280||None|Vigan.11G200600.01), INTRON(|||None|Vigan.11G200500.01), SPLICE_SITE_REGION(|||None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32621538AC71810.770.35DOWNSTREAM(|2220||None|Vigan.11G200600.01), INTRON(|||None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32621580TC602651.771.00DOWNSTREAM(|2178||None|Vigan.11G200600.01), INTRON(|||None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32621728TC481790.771.00DOWNSTREAM(|2030||None|Vigan.11G200600.01), SYNONYMOUS_CODING(SILENT|gcA/gcG|A53|None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32621900CA491967.771.00DOWNSTREAM(|1858||None|Vigan.11G200600.01), UTR_5_PRIME(|14||None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32621933TG512089.771.00DOWNSTREAM(|1825||None|Vigan.11G200600.01), UTR_5_PRIME(|47||None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis

Indels

PositionRef.Alt.DepthScoreFreq. Of Alt.EffectSpecies
32619373TTG612345.731.00DOWNSTREAM(|4384||None|Vigan.11G200600.01), UTR_3_PRIME(|224||None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32620784TTA542392.731.00DOWNSTREAM(|2973||None|Vigan.11G200600.01), INTRON(|||None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32620790CAGATATC552509.731.00DOWNSTREAM(|2967||None|Vigan.11G200600.01), INTRON(|||None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32620964GAAAG371512.730.97DOWNSTREAM(|2793||None|Vigan.11G200600.01), INTRON(|||None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32621539GGTAC,
T
463141.731.00DOWNSTREAM(|2218||None|Vigan.11G200600.01), DOWNSTREAM(|2219||None|Vigan.11G200600.01), INTRON(|||None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32621558TATGT622797.731.00DOWNSTREAM(|2199||None|Vigan.11G200600.01), INTRON(|||None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis
32622219GGTTT271367.731.00DOWNSTREAM(|1538||None|Vigan.11G200600.01), UTR_5_PRIME(|334||None|Vigan.11G200500.01)Vigna nepalensis