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Chr10:7610561 - 7614452

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 [SNPs] [Indels]

SNPs

PositionRef.Alt.DepthScoreFreq. Of Alt.EffectSpecies
7611151AG411595.771.00DOWNSTREAM(|1076||None|Vigan.10G068200.01), SYNONYMOUS_CODING(SILENT|ttT/ttC|F260|None|Vigan.10G068400.01), UPSTREAM(|1311||None|Vigan.10G068300.01)Vigna nepalensis
7611163CA401571.771.00DOWNSTREAM(|1088||None|Vigan.10G068200.01), SYNONYMOUS_CODING(SILENT|gtG/gtT|V256|None|Vigan.10G068400.01), UPSTREAM(|1323||None|Vigan.10G068300.01)Vigna nepalensis
7611734GA582379.771.00DOWNSTREAM(|1659||None|Vigan.10G068200.01), INTRON(|||None|Vigan.10G068400.01), UPSTREAM(|1894||None|Vigan.10G068300.01)Vigna nepalensis
7612025AG652594.771.00DOWNSTREAM(|1950||None|Vigan.10G068200.01), DOWNSTREAM(|4946||None|Vigan.10G068500.01), INTRON(|||None|Vigan.10G068400.01), UPSTREAM(|2185||None|Vigan.10G068300.01)Vigna nepalensis
7612139TA592613.771.00DOWNSTREAM(|2064||None|Vigan.10G068200.01), DOWNSTREAM(|4832||None|Vigan.10G068500.01), INTRON(|||None|Vigan.10G068400.01), UPSTREAM(|2299||None|Vigan.10G068300.01)Vigna nepalensis
7612140GT582613.771.00DOWNSTREAM(|2065||None|Vigan.10G068200.01), DOWNSTREAM(|4831||None|Vigan.10G068500.01), INTRON(|||None|Vigan.10G068400.01), UPSTREAM(|2300||None|Vigan.10G068300.01)Vigna nepalensis
7612187TC451991.771.00DOWNSTREAM(|2112||None|Vigan.10G068200.01), DOWNSTREAM(|4784||None|Vigan.10G068500.01), INTRON(|||None|Vigan.10G068400.01), UPSTREAM(|2347||None|Vigan.10G068300.01)Vigna nepalensis
7612209AG401813.771.00DOWNSTREAM(|2134||None|Vigan.10G068200.01), DOWNSTREAM(|4762||None|Vigan.10G068500.01), INTRON(|||None|Vigan.10G068400.01), UPSTREAM(|2369||None|Vigan.10G068300.01)Vigna nepalensis
7612804AG672631.771.00DOWNSTREAM(|2729||None|Vigan.10G068200.01), DOWNSTREAM(|4167||None|Vigan.10G068500.01), INTRON(|||None|Vigan.10G068400.01), UPSTREAM(|2964||None|Vigan.10G068300.01)Vigna nepalensis
7612936TA542138.771.00DOWNSTREAM(|2861||None|Vigan.10G068200.01), DOWNSTREAM(|4035||None|Vigan.10G068500.01), INTRON(|||None|Vigan.10G068400.01), UPSTREAM(|3096||None|Vigan.10G068300.01)Vigna nepalensis
7613338AC652621.771.00DOWNSTREAM(|3263||None|Vigan.10G068200.01), DOWNSTREAM(|3633||None|Vigan.10G068500.01), INTRON(|||None|Vigan.10G068400.01), UPSTREAM(|3498||None|Vigan.10G068300.01)Vigna nepalensis
7613435CT692816.771.00DOWNSTREAM(|3360||None|Vigan.10G068200.01), DOWNSTREAM(|3536||None|Vigan.10G068500.01), INTRON(|||None|Vigan.10G068400.01), UPSTREAM(|3595||None|Vigan.10G068300.01)Vigna nepalensis
7613752TC682796.771.00DOWNSTREAM(|3219||None|Vigan.10G068500.01), DOWNSTREAM(|3677||None|Vigan.10G068200.01), INTRON(|||None|Vigan.10G068400.01), UPSTREAM(|3912||None|Vigan.10G068300.01)Vigna nepalensis
7614375GA311111.771.00DOWNSTREAM(|2596||None|Vigan.10G068500.01), DOWNSTREAM(|4300||None|Vigan.10G068200.01), START_GAINED(|||None|Vigan.10G068400.01), UPSTREAM(|4535||None|Vigan.10G068300.01), UTR_5_PRIME(|242||None|Vigan.10G068400.01)Vigna nepalensis

Indels

PositionRef.Alt.DepthScoreFreq. Of Alt.EffectSpecies
7610579CCAGCAAAACAATTT502570.731.00DOWNSTREAM(|505||None|Vigan.10G068200.01), UPSTREAM(|740||None|Vigan.10G068300.01), UTR_3_PRIME(|352||None|Vigan.10G068400.01)Vigna nepalensis
7610811CATC431600.731.00DOWNSTREAM(|737||None|Vigan.10G068200.01), UPSTREAM(|972||None|Vigan.10G068300.01), UTR_3_PRIME(|119||None|Vigan.10G068400.01)Vigna nepalensis
7611756AAAG471687.731.00DOWNSTREAM(|1682||None|Vigan.10G068200.01), INTRON(|||None|Vigan.10G068400.01), UPSTREAM(|1917||None|Vigan.10G068300.01)Vigna nepalensis
7612997GCACAG381668.731.00DOWNSTREAM(|2923||None|Vigan.10G068200.01), DOWNSTREAM(|3973||None|Vigan.10G068500.01), INTRON(|||None|Vigan.10G068400.01), UPSTREAM(|3158||None|Vigan.10G068300.01)Vigna nepalensis