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Chr10:20740944 - 20743412

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 [SNPs] [Indels]

SNPs

PositionRef.Alt.DepthScoreFreq. Of Alt.EffectSpecies
20741605GA88180.770.17NON_SYNONYMOUS_CODING(MISSENSE|Gtc/Atc|V33I|None|Vigan.10G148500.01)Vigna nepalensis
20741649AC80263.770.19SYNONYMOUS_CODING(SILENT|gcA/gcC|A47|None|Vigan.10G148500.01)Vigna nepalensis
20741696CT67692.770.30INTRON(|||None|Vigan.10G148500.01)Vigna nepalensis
20741719GA58304.770.21INTRON(|||None|Vigan.10G148500.01)Vigna nepalensis
20741794CG62410.770.23INTRON(|||None|Vigan.10G148500.01)Vigna nepalensis
20741802TA68160.770.13INTRON(|||None|Vigan.10G148500.01)Vigna nepalensis
20741827AT63481.770.25INTRON(|||None|Vigan.10G148500.01)Vigna nepalensis
20741865CT723131.771.00INTRON(|||None|Vigan.10G148500.01)Vigna nepalensis
20741873AT73528.770.25INTRON(|||None|Vigan.10G148500.01)Vigna nepalensis
20741874AC73528.770.25INTRON(|||None|Vigan.10G148500.01)Vigna nepalensis
20741925GC731756.770.59INTRON(|||None|Vigan.10G148500.01)Vigna nepalensis
20741958AG77264.770.16INTRON(|||None|Vigan.10G148500.01)Vigna nepalensis
20742004AT100723.770.24INTRON(|||None|Vigan.10G148500.01)Vigna nepalensis
20742008CA99723.770.24INTRON(|||None|Vigan.10G148500.01)Vigna nepalensis
20742165GA1001943.770.54NON_SYNONYMOUS_CODING(MISSENSE|Gct/Act|A81T|None|Vigan.10G148500.01)Vigna nepalensis
20742176CT98494.770.19SYNONYMOUS_CODING(SILENT|tcC/tcT|S84|None|Vigan.10G148500.01)Vigna nepalensis
20742198CT85420.770.18NON_SYNONYMOUS_CODING(MISSENSE|Ctt/Ttt|L92F|None|Vigan.10G148500.01)Vigna nepalensis
20742203TC85412.770.18SYNONYMOUS_CODING(SILENT|gtT/gtC|V93|None|Vigan.10G148500.01)Vigna nepalensis
20742250TA68429.770.22INTRON(|||None|Vigan.10G148500.01), SPLICE_SITE_DONOR(|||None|Vigan.10G148500.01)Vigna nepalensis
20742257CA66669.770.30INTRON(|||None|Vigan.10G148500.01)Vigna nepalensis
20742273TC60369.770.20INTRON(|||None|Vigan.10G148500.01)Vigna nepalensis
20742964TC562187.771.00SYNONYMOUS_CODING(SILENT|atT/atC|I167|None|Vigan.10G148500.01)Vigna nepalensis
20743043GA512040.771.00INTRON(|||None|Vigan.10G148500.01), SPLICE_SITE_REGION(|||None|Vigan.10G148500.01)Vigna nepalensis
20743290CT652520.771.00UTR_3_PRIME(|16||None|Vigan.10G148500.01)Vigna nepalensis
20743319TG542082.771.00UTR_3_PRIME(|45||None|Vigan.10G148500.01)Vigna nepalensis

Indels

PositionRef.Alt.DepthScoreFreq. Of Alt.EffectSpecies
20741404TTCTC542427.731.00UTR_5_PRIME(|104||None|Vigan.10G148500.01)Vigna nepalensis
20741777GGTGTT61197.730.13INTRON(|||None|Vigan.10G148500.01)Vigna nepalensis
20741983TTGT881367.730.40INTRON(|||None|Vigan.10G148500.01)Vigna nepalensis
20742247TGGT71147.730.13FRAME_SHIFT(|ttg/|L108|None|Vigan.10G148500.01), INTRON(|||None|Vigan.10G148500.01), SPLICE_SITE_DONOR(|||None|Vigan.10G148500.01), SPLICE_SITE_REGION(|||None|Vigan.10G148500.01)Vigna nepalensis
20742253GGAT66156.730.14INTRON(|||None|Vigan.10G148500.01), SPLICE_SITE_REGION(|||None|Vigan.10G148500.01)Vigna nepalensis