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Chr10:5692441 - 5695585

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 [SNPs] [Indels]

SNPs

PositionRef.Alt.DepthScoreFreq. Of Alt.EffectSpecies
5693221AT602634.771.00INTRON(|||None|Vigan.10G055400.01), UPSTREAM(|3772||None|Vigan.10G055500.01)Vigna nepalensis
5693233TA612753.771.00INTRON(|||None|Vigan.10G055400.01), UPSTREAM(|3760||None|Vigan.10G055500.01)Vigna nepalensis
5693286GA732768.771.00INTRON(|||None|Vigan.10G055400.01), UPSTREAM(|3707||None|Vigan.10G055500.01)Vigna nepalensis
5693356GT813222.651.00INTRON(|||None|Vigan.10G055400.01), UPSTREAM(|3637||None|Vigan.10G055500.01)Vigna nepalensis
5693917TC662564.771.00INTRON(|||None|Vigan.10G055400.01), UPSTREAM(|3076||None|Vigan.10G055500.01)Vigna nepalensis
5693978GA612331.771.00INTRON(|||None|Vigan.10G055400.01), UPSTREAM(|3015||None|Vigan.10G055500.01)Vigna nepalensis
5694017CT532333.771.00INTRON(|||None|Vigan.10G055400.01), UPSTREAM(|2976||None|Vigan.10G055500.01)Vigna nepalensis
5694030CA522322.771.00INTRON(|||None|Vigan.10G055400.01), UPSTREAM(|2963||None|Vigan.10G055500.01)Vigna nepalensis
5694060GA512090.771.00INTRON(|||None|Vigan.10G055400.01), UPSTREAM(|2933||None|Vigan.10G055500.01)Vigna nepalensis
5694292TA622456.771.00NON_SYNONYMOUS_CODING(MISSENSE|Tct/Act|S114T|None|Vigan.10G055400.01), UPSTREAM(|2701||None|Vigan.10G055500.01)Vigna nepalensis
5694641TC522033.771.00INTRON(|||None|Vigan.10G055400.01), UPSTREAM(|2352||None|Vigan.10G055500.01)Vigna nepalensis
5694863AT562266.771.00INTRON(|||None|Vigan.10G055400.01), UPSTREAM(|2130||None|Vigan.10G055500.01)Vigna nepalensis
5694952CG592647.771.00INTRON(|||None|Vigan.10G055400.01), UPSTREAM(|2041||None|Vigan.10G055500.01)Vigna nepalensis
5694958CG602752.771.00INTRON(|||None|Vigan.10G055400.01), UPSTREAM(|2035||None|Vigan.10G055500.01)Vigna nepalensis
5694960TA572671.771.00INTRON(|||None|Vigan.10G055400.01), UPSTREAM(|2033||None|Vigan.10G055500.01)Vigna nepalensis
5694985GA542059.771.00INTRON(|||None|Vigan.10G055400.01), UPSTREAM(|2008||None|Vigan.10G055500.01)Vigna nepalensis
5695133CG522045.771.00SYNONYMOUS_CODING(SILENT|ggC/ggG|G283|None|Vigan.10G055400.01), UPSTREAM(|1860||None|Vigan.10G055500.01)Vigna nepalensis
5695395AT361681.771.00UPSTREAM(|1598||None|Vigan.10G055500.01), UTR_3_PRIME(|19||None|Vigan.10G055400.01)Vigna nepalensis
5695424GA411614.771.00UPSTREAM(|1569||None|Vigan.10G055500.01), UTR_3_PRIME(|48||None|Vigan.10G055400.01)Vigna nepalensis

Indels

PositionRef.Alt.DepthScoreFreq. Of Alt.EffectSpecies
5692894CGTGAATTTGAGTTAAAGTTGTC431885.731.00INTRON(|||None|Vigan.10G055400.01), UPSTREAM(|4098||None|Vigan.10G055500.01)Vigna nepalensis
5693619ATGATGGTTTCGAATGGAAATATTTTAAGA351540.731.00INTRON(|||None|Vigan.10G055400.01), UPSTREAM(|3373||None|Vigan.10G055500.01)Vigna nepalensis
5693853TTAT542290.731.00INTRON(|||None|Vigan.10G055400.01), UPSTREAM(|3139||None|Vigan.10G055500.01)Vigna nepalensis
5694096AATCTTCTTG502269.731.00INTRON(|||None|Vigan.10G055400.01), UPSTREAM(|2896||None|Vigan.10G055500.01)Vigna nepalensis
5695382TCTAATACCCT391697.731.00UPSTREAM(|1610||None|Vigan.10G055500.01), UTR_3_PRIME(|7||None|Vigan.10G055400.01)Vigna nepalensis
5695449CCTCA341582.731.00UPSTREAM(|1543||None|Vigan.10G055500.01), UTR_3_PRIME(|74||None|Vigan.10G055400.01)Vigna nepalensis
5695530AATTATAT351618.731.00UPSTREAM(|1462||None|Vigan.10G055500.01), UTR_3_PRIME(|155||None|Vigan.10G055400.01)Vigna nepalensis
5695547CCTTA351627.731.00UPSTREAM(|1445||None|Vigan.10G055500.01), UTR_3_PRIME(|172||None|Vigan.10G055400.01)Vigna nepalensis
5695562GTTCG331438.731.00UPSTREAM(|1430||None|Vigan.10G055500.01), UTR_3_PRIME(|187||None|Vigan.10G055400.01)Vigna nepalensis