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Vigan.06G197300.01

Basic Information:
Name: Vigan.06G197300.01
Multiple alignment
Variant Information
Position: Chr06:33407829..33411719 (- strand)
Length: 3891
Functional Information:
Description: Similar to Protein-tyrosine phosphatase-like member B. [G7JRH2, Medicago truncatula]
InterPro: Protein-tyrosine phosphatase-like, PTPLA (IPR007482)
Expression level (FPKM): Co,Em,Fl,Le,No,Po,Ro,St:0.05,0.99,8.36,16.41,2.67,9.16,1.03, 13.70
Arabidopsis thaliana homolog: AT5G59770.1
Structure :
Position: Chr06:33407829..33408109 (- strand)
Length: 281
Type: three_prime_UTR
Position: Chr06:33408110..33408214 (- strand)
Length: 105
Type: CDS
Position: Chr06:33408926..33409023 (- strand)
Length: 98
Type: CDS
Position: Chr06:33409183..33409232 (- strand)
Length: 50
Type: CDS
Position: Chr06:33409347..33409414 (- strand)
Length: 68
Type: CDS
Position: Chr06:33409917..33409970 (- strand)
Length: 54
Type: CDS
Position: Chr06:33410424..33410512 (- strand)
Length: 89
Type: CDS
Position: Chr06:33410612..33410659 (- strand)
Length: 48
Type: CDS
Position: Chr06:33411345..33411430 (- strand)
Length: 86
Type: CDS
Position: Chr06:33411503..33411561 (- strand)
Length: 59
Type: CDS
Position: Chr06:33411562..33411719 (- strand)
Length: 158
Type: five_prime_UTR

>Vigan.06G197300.01 class=Sequence position=Chr06:33407829..33411719 (- strand)
AAAGAATAAA TATATAATAT ATGAGAAAAA TATATAAAAA TGATTCAAAA TAGAAGTGAA CCCTTGCGAT TGGTAGTTGC
TGAGTGTTTA TTATAGACAT CTCCGGCGAA CTAGGGAAGG AGAAGAGGGA AACGAAACGA GAAATCGAGA GACGGAGAAT
GTCTCGTATC TCCACATTCT ATCTTCTCGC TTACAACTCC TTTCAGACCG TTGGATGGTA CAAATAACAA TTCTTCATCT
CATCTCTTTC TTCAATTTCT CTTCTAACTC GCTAATTTCT CACTCGCAGG ACGCTTTCGT TGATTAAGAT TTTGTACAAT
CTTATCGCCA CTGCCTCCAT CAACGGAACC TATGCTTCCG CCGGCAATTT GATTTGTCAG TTCATTCCCA AAATACCCTT
CTCGCAATTC TATTATACAC TGAAAACAAC GCACTCAGCT TATTTTGTTT TAACTTTTTT CAGTTTAATT ACTCATTTGT
TATTTATTCT TGCAATGCTT GCATTTTAGT TACTTCGCAT ACTTTTTTTG AATCGAGATA ATGTTCAAAT TTAGTCATTA
AAATTTTATG TTGCTAAAAA AGTCATATAA GTCACTCGAA TGTTTTAACA TTGCTGTTAA TTCTCCGAAA TTAATCTCAT
TTTGTCATTT GGTCAGTCCG CTGGATACGA TGAGTGATTA TAATAATAGT AATATATTTA GAGATAAAAA GATGTTAATT
TTATAAATTT TTATTTGAAT TTTTAAATTC TAACAAAGTA AATTACACTT TTTTTTTAAG TTTAATTTGA TATCTTTCAT
TTTTGCAGAA AATCCTCTAA TTATTTTGAC AACATTATAT TACACTGATA TCCTTATAAA TTATGGTAGT CCCTTTAAAA
GTTTTAAAAT TTTTTGAATT TGTTTTAGTA CTTACTTTGG GAGGAGACTA AAATAAATTA AGAAGTGTAG CGGTAAAGAC
TAAAACTGTA ATGTTTAAGA AGAGTAGAGA TTAAAACGTG AAGATTGTAT ATTTGTTTAA TTAAGCCTAA TATTTGCTCT
TGCTTGGTAC TTGATGCAAG GTTTTCTGCA ATGTGCTGCA TTCTTGGAAG TTATACACGG AGCCATTGGT GCGTTTGCCA
CCACTGTGAA TGAAATTGGA TTGCTTTGTT GGTAGAACAC AATTTTAGTT TAAATTTTAA GAAGCAATTT TAACGAGTCA
ATTTCAGGTA TTGTGCCCAG CGGAGTTTTG CTTCCTCTTA TGCAATGGGG AGGAAGGACC CACTTTGTGC TTGCCATTGT
TCGGAAACTT GATGAGGTTT TATGGCTTAC TTTCAGTTCT CTTGTCCTTT TGTTTTGCCA AAATTCAGTA TGCCACCGAA
ATAGAAAATG TTATCCCAAT TTATTAATGT TTTACCTTTT TTGGCTAAGT GCTTTTTAAT TTTTTTCTAT TCTTTCACAA
GTGCGACATG TGTTGGCAAG ACTCATTTTG AATGATATAG TTCCATTTCT TTCCACTTTC GTTTCCATAT GCTCTTGTTC
ATGGAATGAA CCACTACATT TAGTTTTTGA AATTATTTAC AGCGAACACT TAGCCTACAT TATGAAAATC CTGTTACTTC
ATTAATATCA TCATTTCTTA TGTAAAACCA TAATGAAACG TAGGACCCTT AAATTCCTGA GGACTAATTT GAATGTTTAC
TCGCGTATGC AATGGTTCAC AATCAGACAC AGAAGCTAAC TTTGGTTATT TGTTTCATGC TTTCTGTAGC TCCAGGAACT
TCCTTCAGTT TTTATCACTT TTCTTGCATG GAGCATGGGT GAGGTAATTT GCTTATTTTA TTATTGGATG TAGTTCATTG
AATTTTCTAG CATTACCTTC TGGTTTAAGC TTTAAACAGT TGTTACATAA CCATTTAAAG CAACAATTCA TGTACGTATC
AACCGAAAAA AGAGTCACTG TTGATCATGT CTGATGTTTT CAGTAGAGCA ATAACAGGGA ACATTTCTTC ATAACACATG
AAAAGTTCAC TTTTTACAAG TTTTTAGGAT ATTATGGATT CGAATTCACC TTTAATGTTC CCAAACTTCT TTTAACCCCT
AGTTTATGTC ATCCCTATAG GTTTCCTATA ATATTTTTTT TTTCTTTTTA AGAGAATATC GGGTGACTTT TCATGGCGTG
TAGTGTTAAC TGTAGCCTGA TATTTATTTC TATGGCACCA ATGGTTTGTT ATGTCTGATC CATGAACATT GTGGTATAAA
AGAAATATAT CATGATCATT TTCCAAGTAA GAAAGATGAT TGGGTCGCAA TCTTTGGAGA TGCAGGTCGT TAGGTATTCA
CATTATGCTT TCAGTTGTTC GGGAAATTGT CCTTCTTGGA TGACCTATCT CAGGTATTTT TCTATCACAT GCCACATACT
TCAAGCTTGA ACAAAGTTAA TATCTTCGAT TATTTTAATA GAGTACTCTT TTCAAAGTAA ATGCTTGTTG CTTCATCCTT
TAATTAGGTA CACCACGTTT ATTCTGCTGT ATCCTTTGGG AGTGGGTCCT GGTGAAAGTG AGTTCATAAA TCAATACCTC
CCTTCTATCT CGGAATTCCG TTTTTGAATG AATTTTAAAT CGATTTTACT ATAGGCTTGA CTTCTTAGCT ATTCCTTTCA
TAATCAAATG CCATCAGCCC CTGCATAAAG TAACTGATAT ATGTATTATA TTGCAGTATG GACAATGTAC CAGGCGCTTC
CAATTATAAA GAAGAAGAAT CTCTATGCAG ATTCCTTTTC AGGCCTCCCA TTTAGTTATT ATGATTTCCT TAAGGTAGTA
AGTTCTTATA AGTAACAAAT AATCCATAGC CTCAAATTAG AGATGAGACA CATCTAGAAG ATAAACTTTT TCATAAACAC
ATCTAGAAGA TAAAAATAAG AAAGAAAATC AATTGAATTT CTTTATAAAC TAAGATTAGC TTATGTATAA ATTAATTTGT
AGAAACTCTT TCCATATAGT CTTTTTAAAT TTTTATTTTC AATTTCTGCA TTAATTAATT TTAACTTGTG GAAAAACTCA
TAAATTTTTC TTCTTATTTT TTTCATAAAT ATACTAGCAT ACTCTTATTA AGTATTTATT GAAGAAGGGC TCACCATGTA
ATGTAAGCAA CTATACATAA TATGACTTTA TGATAAAAAA GGAAATAAGA TTAGACTGTT TGCATGTCTT CCGTAAGCTG
TTTAATAAAC TATTCGGAAG AGCGTATTGA AGTAAGTAAA AGCAACTTAT AAACATGTCA TAAGTTATTT TCATAACTTT
TAACAAACAA TTATTGAAGT GGTGATGCAA AAAGATAAGT CCAGATTAAC TGTATATAAG AGCTCCTCCA AGAGCACCCA
AGTGTTGGGA GCTGACTGAA ACTGGTTTTT TGCTGCATAT CAAATGTCCT TTGTGACCCT TTCAATTTAA TTCTGTTCAA
TTGTAGCTCA TGTACGTACA TGAATTGTTT ATTCTTTTAA TTTATTCTTC ATTTCTCTCA TTCAGGTTGT ACTTGTAGCT
TATCCATTCC TTTGGTTCAA ACTTTACCTG CACATGTTCA GGCAACGACG TGCGAAACTT TATAAACGCC ATGACAAGAA
AACGGCTTGA GGAGCTTTAC AAAACTTTAT AGACACCATT CTTGGTTAGT CAAGTTGGAG TGATGATTAA ACTTCTGATA
CAATATGTAT TTTGTTAAAA AAATGAATGA CTTTCTTTGT GGCACTGAAG ACACTCATTC TGAAATTTAT TTATTTCCTT
TCCAATTTTT TTGTTGATTG GATTCTAGTG TCAAATAATG GATTTGTTCC TTGTAATATG GTAAGATTTG GGAGAGAAAA
CGATTTGCAA TGTTTTTGCC TTCAGTATTG TGTATACAGA TTTCTTCCTG G

>Vigan.06G197300.01
AAAGAATAAA TATATAATAT ATGAGAAAAA TATATAAAAA TGATTCAAAA TAGAAGTGAA CCCTTGCGAT TGGTAGTTGC
TGAGTGTTTA TTATAGACAT CTCCGGCGAA CTAGGGAAGG AGAAGAGGGA AACGAAACGA GAAATCGAGA GACGGAGAAT
GTCTCGTATC TCCACATTCT ATCTTCTCGC TTACAACTCC TTTCAGACCG TTGGATGGAC GCTTTCGTTG ATTAAGATTT
TGTACAATCT TATCGCCACT GCCTCCATCA ACGGAACCTA TGCTTCCGCC GGCAATTTGA TTTGTTTTCT GCAATGTGCT
GCATTCTTGG AAGTTATACA CGGAGCCATT GGTATTGTGC CCAGCGGAGT TTTGCTTCCT CTTATGCAAT GGGGAGGAAG
GACCCACTTT GTGCTTGCCA TTGTTCGGAA ACTTGATGAG CTCCAGGAAC TTCCTTCAGT TTTTATCACT TTTCTTGCAT
GGAGCATGGG TGAGGTCGTT AGGTATTCAC ATTATGCTTT CAGTTGTTCG GGAAATTGTC CTTCTTGGAT GACCTATCTC
AGGTACACCA CGTTTATTCT GCTGTATCCT TTGGGAGTGG GTCCTGGTGA AATATGGACA ATGTACCAGG CGCTTCCAAT
TATAAAGAAG AAGAATCTCT ATGCAGATTC CTTTTCAGGC CTCCCATTTA GTTATTATGA TTTCCTTAAG GTTGTACTTG
TAGCTTATCC ATTCCTTTGG TTCAAACTTT ACCTGCACAT GTTCAGGCAA CGACGTGCGA AACTTTATAA ACGCCATGAC
AAGAAAACGG CTTGAGGAGC TTTACAAAAC TTTATAGACA CCATTCTTGG TTAGTCAAGT TGGAGTGATG ATTAAACTTC
TGATACAATA TGTATTTTGT TAAAAAAATG AATGACTTTC TTTGTGGCAC TGAAGACACT CATTCTGAAA TTTATTTATT
TCCTTTCCAA TTTTTTTGTT GATTGGATTC TAGTGTCAAA TAATGGATTT GTTCCTTGTA ATATGGTAAG ATTTGGGAGA
GAAAACGATT TGCAATGTTT TTGCCTTCAG TATTGTGTAT ACAGATTTCT TCCTGG

>Vigan.06G197300.01
ATGTCTCGTA TCTCCACATT CTATCTTCTC GCTTACAACT CCTTTCAGAC CGTTGGATGG ACGCTTTCGT TGATTAAGAT
TTTGTACAAT CTTATCGCCA CTGCCTCCAT CAACGGAACC TATGCTTCCG CCGGCAATTT GATTTGTTTT CTGCAATGTG
CTGCATTCTT GGAAGTTATA CACGGAGCCA TTGGTATTGT GCCCAGCGGA GTTTTGCTTC CTCTTATGCA ATGGGGAGGA
AGGACCCACT TTGTGCTTGC CATTGTTCGG AAACTTGATG AGCTCCAGGA ACTTCCTTCA GTTTTTATCA CTTTTCTTGC
ATGGAGCATG GGTGAGGTCG TTAGGTATTC ACATTATGCT TTCAGTTGTT CGGGAAATTG TCCTTCTTGG ATGACCTATC
TCAGGTACAC CACGTTTATT CTGCTGTATC CTTTGGGAGT GGGTCCTGGT GAAATATGGA CAATGTACCA GGCGCTTCCA
ATTATAAAGA AGAAGAATCT CTATGCAGAT TCCTTTTCAG GCCTCCCATT TAGTTATTAT GATTTCCTTA AGGTTGTACT
TGTAGCTTAT CCATTCCTTT GGTTCAAACT TTACCTGCAC ATGTTCAGGC AACGACGTGC GAAACTTTAT AAACGCCATG
ACAAGAAAAC GGCTTGA

>Vigan.06G197300.01
MSRISTFYLL AYNSFQTVGW TLSLIKILYN LIATASINGT YASAGNLICF LQCAAFLEVI HGAIGIVPSG VLLPLMQWGG
RTHFVLAIVR KLDELQELPS VFITFLAWSM GEVVRYSHYA FSCSGNCPSW MTYLRYTTFI LLYPLGVGPG EIWTMYQALP
IIKKKNLYAD SFSGLPFSYY DFLKVVLVAY PFLWFKLYLH MFRQRRAKLY KRHDKKTA*